サイエンスと学習

Hi-C/3C-Seq/Capture-C

Hi-C/3C-Seq/Capture-C

メソッドカテゴリー：エピゲノム>DNAとタンパク質の相互作用

説明： Hi-C、3C-Seq、およびCapture-Cは、クロマチン相互作用を解析するための一連の手法で構成されています。Capture-Cは、磁気ビーズによるビオチン化断片のプルダウンを3C法に追加します。Capture-C法（NG Capture-C）の新たな改良が利用可能です。Hi-Cアプローチは、3C-Seqを拡張してクロマチンの接触をゲノムワイドにマッピングし、in situクロマチン相互作用の研究にも適用されています。

この方法では、DNA-タンパク質複合体はホルムアルデヒドと架橋されます。サンプルは断片化され、DNAは制限酵素で抽出、ライゲーション、消化されます。得られたDNA断片はPCR増幅され、シーケンスされます。ディープシーケンスでは、ライゲーションされた断片の塩基対の分解能が得られます。

長所：
  • 長距離DNA相互作用の検出が可能
  • ハイスループット法
短所：
  • ランダムな染色体の衝突によって検出される場合があります
  • DNA断片の1%未満が実際にライゲーション産物を産生します1
  • 複数のステップがあるため、この方法では大量の出発物質が必要です

主な製品

関連コンテンツ

  1. エピジェネティクス
  2. DNAタンパク質相互作用解析

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