hyRAD
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ハイブリダイゼーションRAD（hyRAD）は、美術館のコレクションなどの劣化したサンプルに使用するために開発されました。博物館や保存サンプルは貴重なサンプルが豊富に含まれていますが、劣化したDNAはddRADに必要な二重消化とサンプル分画を維持できません。この限界に対処するため、hyRADはビオチン化プローブとストレプトアビジンで覆われたビーズを使用して、目的の断片を捕捉し、濃縮します。
プロセスの最初のステップは、高品質のDNAからddRADライブラリーを生成することです。通常は、既存のサンプルから作成します。断片はサイズ選択され、ビオチン化されます。ショットガンまたはddRadライブラリーのハイブリダイゼーションキャプチャー用のプローブとして使用することができます。
長所：
- 分解されたDNAに使用可能
- シーケンスされていないゲノムで使用可能
短所：
- 高品質のサンプルほど網羅性がない
- かかるT., Pitteloud C., Gerasimova N. S., Kostikova A., Schmid S., et al. （2016年）収集サンプルのゲノム解析を行うための新しいツールであるRADプローブ（hyRAD）を使用したハイブリダイゼーションキャプチャー。PLoS One 11：e0151651
- Andrews K. R., Good J. M., Miller M. R., Luikart G. and Hohenlohe P. A. (2016) 生態学的ゲノミクスと進化的ゲノミクスのためのRADseqの力を活用。Nat Rev Genet
- Holmes M. W., Hammond T. T., Wogan G. O., Walsh R. E., LaBarbera K., et al. （2016年）進化過程の窓としての自然史コレクション。Mol Ecol 25：864-881