NET-Seq
scRNA-Seq
scRNA-Seqは、同じ組織タイプ内の異なる細胞の多層的な複雑性に対する深い洞察を提供します。scRNA-Seqは、シングルセルRNAシーケンス分野の他の手法に広く採用されています。この方法では、単一細胞を顕微鏡で手動で分離し、溶解します。次に、mRNAを精製し、逆転写用のポリ（T）プライマーでプライミングします。非反応性プライマーはエキソヌクレアーゼI消化によって除去されます。Poly(A)テールは、3'末端で第1鎖cDNAに添加され、第2鎖cDNA生成のためにポリ(T)プライマーにアニーリングされます。最後に、cDNAはPCR増幅され、断片化され、シーケンスライブラリーに調製されます。
長所：
- シングルセルレゾリューショントランスクリプトーム解析
- 未知のスプライスジャンクションを検出できる
- さまざまなRNAPII特異的抗体を使用して、ターゲット精度を向上させることができます
短所：
- 非常に低いスループット
- 分子バーコードは使用されていません
- スケールアップには費用がかかる可能性がある
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