SMORE-Seq
snRNA-Seq
snRNA-Seqは、軽度で迅速な核解離プロトコールを使用して、核内のRNAを分離しシーケンスします。この方法は、特に即時早期遺伝子（IEG）の挙動を研究する際に、一般的な解離プロトコールから生じる可能性のある技術的な問題を最小限に抑えます。
この方法では、細胞懸濁液は穏やかに溶解され、核は遠心分離によって細胞質溶解物から分離されます。FACSを使用して、単一細胞/核を個々のウェルに分類します。個々の核は、細胞捕捉と反応ケミストリーを実行するマイクロ流体支援装置を使用して増幅されます。Nextera XT DNA Library Prep Kitを使用して、核RNA内容物をcDNAライブラリーに処理します。磁気ビーズを用いて、40のサンプルのプールを採取し、精製します。cDNAライブラリーはシーケンスの準備ができました。
同様の方法：Div-Seq、Nuc-seq。
長所：
- 迅速な解離プロトコールにより、プロテアーゼ消化、加熱、細胞質リボソームによるスプリアス遺伝子発現に起因する技術的問題を防止
- プロテアーゼ解離ステップ中に一般的に発生する樹状突起の喪失を防ぎます
短所：
- 未報告
- Poulin J. F., Tasic B., Hjerling-Leffler J., Trimarchi J. M. and Awatramani R. Disentangling neural cell diversity using single-cell transcriptomics. Nat Neurosci。2016;19:1131-1141
- Gagliano S. A. All in the Brain：利用可能な機能的ゲノムアノテーションのレビュー。生物精神医学。2016年
- 海馬におけるGoncalves J. T.、Schafer S. T.、Gage F. H. Adult Neurogenesis：幹細胞から行動まで。セル。2016;167:897-914