NET-Seq

TCR-LA-MC PCR

TCR-LA-MC PCRは、T細胞からTCR-α鎖とβ鎖を同定し、シーケンスを使用して、血液または組織サンプルからin vivoまたはin vitroでクローン性TCRのカタログを解析します。この技術は、わずか10 ngのcDNAで実施でき、TCRクローン性に影響を与える多様性とメカニズムを分析するための優れた感度と精度を提供します。第一鎖cDNAは、TCR鎖の定常遺伝子にアニーリングするビオチン化プライマーを使用して生成されます。RNA鎖はRNA消化によって除去され、一本鎖cDNAはストレプトアビジンビーズを使用して磁気的に捕捉されます。プライマー配列を含む一本鎖リンカーカセット(ssLC)はcDNAにライゲーションされ、サンプルはPCR増幅されます。二本鎖cDNAにはシーケンスアダプターが隣接しており、シーケンスの準備が整います。

同様の方法:TCRチェーンのペアリング。

長所:
  • シーケンス関連または定量的な制限なしにTCRの多様性を同定
  • クローン性に影響を与えるTCRの多様性とメカニズムを研究するために使用できます
  • わずか10 ngのcDNAを入力として使用できます
  • 1:10,000の分解能でT細胞を同定し、単一細胞でも同定可能
短所:
  • 未報告