NovaSeq 6000Dxのアプリケーションと手法
NovaSeq 6000Dx システムアプリケーション
デュアルモードの操作により、臨床検査と臨床研究の両方が可能になり、さまざまなサンプルタイプ、シーケンス方法、アプリケーションに新たな可能性をもたらします。
主な臨床研究アプリケーション（研究（RUO）モード）
シーケンス
NovaSeq 6000Dx Reagent Kits
NovaSeq 6000用の試薬キットには、クラスター形成およびSBS用のすぐに使用できるカートリッジベースの試薬が含まれています。NovaSeq 6000Dx システムは、RUO モードでRUO試薬と互換性があります。
解析
BaseSpace Sequence HubまたはスタンドアロンDRAGEN server
Illumina BaseSpace Sequence HubまたはスタンドアロンDRAGENサーバー（別売り）で、DRAGEN GermlineまたはDRAGEN Somaticを活用して、正確で包括的、効率的な二次解析を行います。
ライブラリー調製
Illumina DNA Prep with Enrichment
カスタムパネル、固定パネル、全エクソーム濃縮のためのターゲットリシーケンスを提供する幅広いアプリケーションに対応した迅速な統合ワークフロー。
Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment
高性能、高速、完全な全エクソームシーケンスキット。
シーケンス
NovaSeq 6000Dx Reagent Kits
NovaSeq 6000用の試薬キットには、クラスター形成およびSBS用のすぐに使用できるカートリッジベースの試薬が含まれています。NovaSeq 6000Dx システムは、RUO モードでRUO試薬と互換性があります。
解析
NovaSeq 6000Dx用の装置と一組になって提供されるDRAGEN server
RUOモードで、Illumina DRAGEN for Illumina DNA Prep with Enrichment（IDPE）アプリを活用して、正確で効率的な二次解析を行います。
ライブラリー調製
TruSight Oncology 500 High-Throughput (HT)
TruSight Oncology 500 HTは、より高いサンプルスループットとバッチオプションのための柔軟性により、腫瘍サンプルの施設内での包括的なゲノムプロファイリングを可能にします。DNAとRNAのコンテンツは、すべてのDNAとRNAバリアントタイプに加えて、TMBとMSIの評価のために、523の遺伝子をターゲットにしています。ハンズオンタイムとスケーラビリティを削減するために、自動化キットとメソッドを利用できます。
シーケンス
NovaSeq 6000Dx Reagent Kits
柔軟なサンプルバッチ処理により、RUOマニュアルモードで、NovaSeq 6000Dxのシステムのシーケンスフローセルあたり16～192のサンプル処理が可能となります。NovaSeq 6000用の試薬キットには、クラスター形成およびSBS用のすぐに使用できるカートリッジベースの試薬が含まれています。NovaSeq 6000Dx システムは、RUO モードでRUO試薬と互換性があります。
解析
スタンドアロンDRAGEN serverまたはIllumina Connected Analytics（ICA）
DRAGENパイプラインによる迅速なバリアントコーリングアルゴリズム。独立したスタンドアロンのDRAGENサーバーでローカルで利用可能。安全でスケーラブルなクラウドベースのバリアントコールは、自動起動機能を備えたIllumina Connected Analytics（ICA）のDRAGENパイプラインでも利用できます。