非侵襲的出生前スクリーニングのためのゲノムソリューション
NIPT（非侵襲的出生前検査）の感度と特異性は、検査を選択する上で重要な考慮事項です。Verifi Prenatal Testは、21番、18番、13番染色体の異数性をスクリーニングする、非常に正確で非侵襲的な検査です。単胎妊娠では、性染色体異数性、一部の微小欠失、すべての常染色体トリソミーについて追加スクリーニングが利用できます。
双子の妊娠の場合、21番、18番、13番染色体の異数性スクリーニング、および選択肢として、Y染色体の欠如のスクリーニングが利用できます。結果はサンプル受領後、約3～5日後に報告されます。需要に応じて、報告までの時間は異なる場合があります。NIPTの感度、陽性適中率（PPV）、特異性データなどの、試験性能メトリクスは以下の通りです。
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Verifi Prenatal Test試験性能メトリクス
公表されている検証メトリクスと比較した異数性検出サンプルの感度と特異性
| Clinical Laboratory Improvement Amendments（CLIA）ラボ | 検証研究* | |||
|---|---|---|---|---|
| 状態 | 観察された感度† （範囲）‡ | 観察された特異性† （範囲）‡ | 感度 | 特異性 |
| 21トリソミー | 99.49%（98.66～99.53%） | 99.77%（98.92～99.91%） | 100% | 99.76% |
| 18トリソミー | 97.23%（94.20～98.15%） | 99.69%（99.51～99.85%） | 97.37% | 99.57% |
| 13トリソミー | 97.98%（95.56～98.87%） | 99.84%（99.77～99.93%） | 87.50% | 100% |
* イルミナ。Verifi prenatal testの分析的検証：21、18、13トリソミーを検出するための強化された試験性能と、性染色体状態の分類オプション。イルミナホワイトペーパー。2012.
† 観察された感度と特異性は、利用可能な転帰データを用いて算出し、転帰が確認された陽性症例の割合でコホートサイズを調整しました。
‡ 範囲の下限値は、未報告の転帰がすべて不一致であるという仮定に基づき、範囲の上限値は、未報告の転帰がすべて一致しているという仮定に基づきました。
スクリーニング後のパフォーマンスメトリクスに関する考慮事項
パフォーマンスメトリクスに基づくPPV
陽性的中率（PPV）とは、真に陽性である陽性検査結果の割合を指します。PPVは、検査の感度と特異性、および検査対象母集団におけるその疾患の有病率に基づいています。常染色体トリソミー（例：21トリソミー）の有病率は、母親の年齢とともに上昇するため、PPVも増加します。
Verifi Prenatal Testおよび Verifi Plus Prenatal Testでは、単胎妊娠で21トリソミー、18トリソミー、または13トリソミーの異数性検出結果が出た場合、報告書には、その状態、母体年齢、および在胎週数に対する検査の感度と特異性に基づくPPVが記載されます。
サンプルテスト検査報告書
| 染色体 | 結果 | PPV (%) |
|---|---|---|
| 21番染色体 | 陽性：異数性検出 21トリソミーのリスクが高い妊娠と一致する結果。 |
95% |
| 18番染色体 | 陰性：異数性検出なし 18番染色体の2コピーと一致する結果。 |
|
| 13番染色体 | 陰性：異数性検出なし 13番染色体の2コピーと一致する結果。 |
PPVにとって特異性が重要な理由
若い女性ではPPVは低いものの、NIPTは、特異性が有意に高い（偽陽性率が低い）ため、NIPTのPPVは、すべての母親年齢で従来の血清スクリーニングのPPVよりも高くなります。1
PPVにとって有病率が重要な理由
常染色体トリソミー（例：21トリソミー）の有病率は、母親の年齢とともに上昇するため、PPVも増加します。21トリソミーは、生児出産時に最もよく見られる常染色体トリソミーです。そのため、一般的ではありませんが下のグラフに見られるように、PPVは、21トリソミーの方が、18トリソミーや13トリソミーよりも高いのです。
以下のPPVは、年齢に関連する有病率に基づいて算出されます。その他の異数性危険因子（例：超音波異常）の存在は、ここに示したものよりもPPVを増加させる可能性があります。
母親の年齢別のNIPT PPV
37件のNIPT研究のメタアナリシスから得られた感度と特異性のデータ²と、母親の年齢群別の妊娠10週時の異数性有病率の公表推定値を用いて算出したPPV³⁻⁵。エラーバーで示された潜在的なPPV範囲は、感度と特異性の95％信頼度区間（CI）を用いて算出されました。
テスト失敗率の評価
Verifi Prenatal testの失敗率は、0.6％と低いものです。6 次世代シーケンサーを使用して全ゲノムにわたるcfDNA断片を解析するため、ターゲットシーケンスやアレイベースの手法など、他のNIPT手法よりも優れていることが証明されています。
これは重要かつ臨床的に意義のあることです。検査の失敗は、患者のケアに悪影響を及ぼすだけでなく、感度、特異性、PPVなどの検査メトリクスパラメータにも悪影響を及ぼすためです。Verifi Prenatal Testを選択することで、失敗の臨床的影響を軽減できるのです。4
イルミナの違い
当社は、人々の健康を改善するための包括的なソリューションと検査オプションをラボに提供することに尽力しています。公表されたデータによると、全ゲノムシーケンス（WGS）によるNGSは、ターゲットアプローチと比較した場合、NIPTテクノロジーとして選ばれています。
これらの研究におけるNIPTサンプルの99.7%以上が、イルミナNGSテクノロジーで実行されており、当社は、出生前スクリーニングにおけるブレークスルーの前進を支援しています。
以下のをクリックすると、サンプルランデータ表をご覧いただけます。
| 検査（会社） | 現在のテクノロジープラットフォーム | プラットフォームプロバイダー | 公開サンプル数 | ||
|---|---|---|---|---|---|
| イルミナNGS | Ion Proton NGS | Affymetrixアレイ | |||
| Bambni検査（Berry Genomics） | NGS | イルミナ | 3,268 | 0 | 0 |
| MaterniT21 PLUS検査（Sequenom） | NGS | イルミナ | 293,243 | 0 | 0 |
| NIFTY検査（BGI） | NGS | イルミナ | 168,655 | 0 | 0 |
| Panorama出生前スクリーニング（Natera） | NGS | イルミナ | 55,077 | 0 | 0 |
| PrenaTest (LifeCodexx AG) | NGS | イルミナ | 504 | 0 | 0 |
| Verifi Prenatal Test（イルミナ） | NGS | イルミナ | 113,561 | 0 | 0 |
| IONA Test (Premaltha) | NGS | イオンプロトン | 0 | 684 | 0 |
| Harmony出生前検査（Arlosa）* | アレイ | Affymetrix | 44,313 | 0 | 1,677 |
| 合計 | 678,621 | 684 | 1,677 | ||
2015年11月30日に、「セルフリー、DNA、出生前」、「非侵襲的出生前検査」、「非侵襲的出生前スクリーニング」のPubMed検索を実施しました。独自のサンプルを使用したすべての検証および臨床研究が含まれ、現在の臨床NIPTプロバイダーがサンプル解析を実施しました。事例研究および英語以外の言語で発表された研究は除外されました。合計59件の公表済み研究が調査されました。社内計算データにより Illumina, Inc. 2015. NGS = 全ゲノムまたはターゲットの次世代シーケンス。
* 2014年、Ariosaはこのプラットフォームで限られた公開データにもかかわらず、臨床サンプル用のシーケンスからアレイに切り替えました。
検査の失敗は、侵襲的処置につながる可能性があります。†
NIPTの失敗およびアッセイの偽陽性率のために依頼された侵襲的処置の数の理論的な例。失敗率には、アッセイ失敗、および胎児分率が低いために結果返却が棄却されたサンプルが含まれます。Harmony検査のアッセイ失敗率はNGS研究に基づいており、現在使用されているアレイに基づくのHarmony検査で得られた実際の試験結果とは一致しない場合があります。3-7,9,10
† スクリーニング検査不合格により影響を受ける妊娠は、T21検出数から除外されました。
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補足資料
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Verifi Prenatal Testの詳細については、検査オプションや性能データの情報、サンプルレポートなど、読みやすい資料をご覧ください。
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Verifi Plus Prenatal Testの選択
このパンフレットでは、微小欠失、特定疾患、発生率について説明し、臨床的エビデンスを提供するVerifi Plus Prenatal Testについて、より深い洞察を得るでしょう。
参考文献
- Bianchi DW, Parker RL, Wentworth J, et al. DNA sequencing versus standard prenatal aneuploidy screening. N Engl J Med. 2014;370(9):799-808.
- Ryan A, Hunkapiller N, Banjevic M, et al. Validation of an enhanced version of a single-nucleotide polymorphism-based noninvasive prenatal test for detection of fetal aneuploidies. Fetal Diagn Ther. 2016;40(3):219-223.
- McCullough RM, Almasri EA, Guan X, et al. Non-invasive prenatal chromosomal aneuploidy testing--clinical experience: 100,000 clinical samples. PLoS One. 2014;9(10):e109173.
- Norton ME, Jacobsson B, Swamy GK, et al. Cell-free DNA analysis for noninvasive examination of trisomy. N Engl J Med. 2015: 372(17): 1589-97.
- Dar P, Curnow KJ, Gross SJ, et al. Clinical experience and follow-up with large scale single-nucleotide polymorphism-based noninvasive prenatal aneuploidy testing. Am J Obstet Gynecol. 2014: 211(5): 527.e1-527.e17.
- 社内資料。Illumina, Inc 2022.
Verifi™およびVerifi™ Plusは、イルミナの完全子会社であるVerinata Health, Inc.（VHI）によって開発され、性能特性が決定されました。VHIラボは、米国臨床病理医協会認定を受けており、Clinical Laboratory Improvement Amendments（CLIA）認可の下、複雑度の高い臨床検査を行っています。これらはアメリカ食品医薬品局の認可または承認を受けていません。