感染症に挑む検査室の革新：即応力からゲノム解析まで

ご講演1

長崎大学大学院 病態解析・診断学分野（臨床検査医学） 教授
栁原 克紀 先生

『感染症検査におけるLDTの役割』
感染症検査におけるLDT（検査室開発検査）は、従来検査の限界を補い、迅速かつ柔軟な対応を可能にする重要な手段である。従来の培養や同定といった検査法は、病原体の種類によっては時間を要したり、検出が困難であったりするという課題がある。特に、培養が困難なウイルスや、複数の病原体が混在する感染症の診断には限界があった。 このような中、コロナパンデミックではLDTとして核酸増幅検査、特にRT-PCR法が急速に普及した。公的な検査体制が整うまでの間、多くの医療機関が独自に検査法を開発・実施し、感染拡大の初期段階における診断と隔離に大きく貢献した。この経験により、LDTの迅速性と柔軟性が広く認識されるようになった。 さらに、次世代シーケンサー（NGS）の普及により、LDTの活用は新たな段階に入っている。NGSを用いた網羅的な遺伝子解析により、原因不明の感染症の病原体特定や、変異株の検出、複数病原体の同時同定が可能となり、従来検査では不可能であった情報が得られるようになった。これは診断精度の向上だけでなく、公衆衛生上のリスク評価にも寄与している。 今後もLDTは、感染症検査のフロントラインにおいて、従来検査と補完的に機能しながら、技術革新とともに進化し続けることが期待される。特に、迅速な対応が求められる新興感染症への対応力を高めるうえで、その重要性はますます増している。

ご講演2

長崎大学病院 検査部 遺伝子検査室 主任
村田 美香 先生

『感染症領域におけるNGSの活用 』
NGSは莫大かつ網羅的なデータ解析を特徴とし、がん領域ではすでに治療薬の選択や、安全性・有効性の評価に活用されている。一方で感染症領域においては、まだ日常的な検査としては導入されていないが、今後は「原因微生物の検出・同定」「病原微生物のタイピング・病原性遺伝子や薬剤耐性遺伝子の解析」「感染制御（系統解析・伝播経路の推定）」など多方面での活用が期待される。
当院の検査室では院内外より臨床菌株の解析を依頼され、NGSを用いることもしばしばあるが、特に薬剤耐性菌のアウトブレイク（院内伝播）が疑われた際の、菌株の相同性解析においてはNGSが有用であると考えている。NGSを用いて行われるコアゲノムMLSTやSNP解析を活用することで、真の院内伝播株の抽出が可能となり、感染経路の推定が行いやすくなることが期待される。
本ウェビナーでは我々の検査室でのNGSの活用方法および、データ解析を行う際の課題について紹介したい。