NET-Seq
DamID
DamIDは、架橋や免疫沈降を必要とせずに、生細胞におけるタンパク質結合部位の同定を可能にします。NGSに適応する前のマイクロアレイ法として2006年に開発されました。DamIDには、DNAアデニンメチルトランスフェラーゼ（Dam）と目的のクロマチンタンパク質で構成される融合タンパク質の低レベル発現が含まれます。この融合タンパク質は、Damが周囲のDNAのアデニンをメチル化するクロマチンタンパク質の天然結合部位をターゲットとしています。その後、メチル化されたDNA断片を単離し、選択的PCRにより増幅し、シーケンスします。
長所：
- 架橋や免疫沈降を必要とせず、生細胞におけるタンパク質結合部位の同定が可能
- 専用のアルゴリズムが利用可能1
短所：
- ダムは有毒である可能性があります
- キロベースサイズの領域に限定
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