GMUCT 2.0

GMUCT 2.0

GMUCTは、デキャッピングされたmRNAまたは切断されたmRNAで構成されるシーケンスライブラリーを構築するための方法です。GMUCTには2つのバージョンがあります。バージョン1.0は2008年に開発され、より合理化された効率的なバージョン2.0は2013年に設計されました。GMUCT 2.0は、ライブラリー調製時間を3日(5~6日ではなく2~3日)大幅に短縮し、必要な開始総RNAは10分の1(50 μgではなく5 μg)です。

GMUCT 2.0:このバージョンは、GMUCT 1.0と同様に開始しますが、ポリ(A)RNAに5' RNAアダプターをライゲーションした後で逸脱します。ポリ(A)選択の別のラウンドは、任意の非ライゲーションRNAから目的のmRNAをさらに精製するために行われます。RTは、5'末端に3'アダプター、3'末端にランダムヘキサマーを持つプライマーを用いて行われます。この修飾によりRT中に3'アダプターが付加され、両端にアダプターが隣接するcDNA鎖が生じます。cDNAはPCR増幅され、シーケンスインデックスを追加し、シーケンスされます。

長所:
  • RNA分解中間体およびキャップされていないRNAのシーケンス
  • GMUCT 2.0はわずか2~3日で、トータルRNAは5 μgです
  • miRNAまたはsiRNAターゲットの切断を研究するために修飾可能
短所:
  • 最小サイズ:135 bp