マルチオミクス
マルチオミクスが生物学の全体像を提供
より深い洞察と探索のために手法を統合
マルチオミクスとは？
マルチオミクス（複数のオミクス解析）は、生物学の複数の階層にわたる発見を促進するための統合的なアプローチです。ゲノミクス、トランスクリプトミクス、エピジェネティクス、およびプロテオミクスのデータを組み合わせることで、研究者は正常な発生、細胞応答、疾患に関与する分子的変化について、より包括的な理解を得ることができます。
また、マルチオミクスでは、in silicoマルチオミクスとして知られる手法により、過去の実験で取得した個別のオミクスデータを統合することも可能です。これにより、新たな生物学的関連性を効率的に解析できます。イルミナは、選択する手法にかかわらず、NGSを基盤としたソリューションを提供し、次のマルチオミクスプロファイリング研究と解析を支援します。
マルチオミクス解析で何が明らかになるのか
マルチオミクスの仕組みとその意義について学び、研究者ががん、細胞生物学、遺伝性疾患の研究にどのように応用しているかをご覧ください。
マルチオミクスの知識を広げる
統合された分子データが、発生、健康、疾患に関する理解をどのように深めるのかを示す、マルチオミクスの基本概念と実際の研究事例をご覧ください。
詳細なeBookをダウンロード複数のオミクスを活用して研究の可能性を広げる。
ゲノミクス
生物のDNA内でコード化された情報の構造、機能、進化、マッピング、編集に着目します。
トランスクリプトーム
ゲノムから産生されるRNA転写産物の全体像を研究します。
プロテオミクス
タンパク質発現を評価することで、細胞機能の理解を深め、治療反応を予測します。
エピゲノミクス
DNA変化以外の要因による、遺伝子発現の遺伝性変化を研究します。
バルク解析からターゲット解析までの手法を活用し、より大きな発見へ
NGSベースのソリューションを用いたマルチオミクス実験により、生物学的要素間の新たな関連性を見出し、バイオマーカーの特定、変異やその他の表現型のプロファイリング、新規治療法の発見の促進が可能になります。イルミナは、広範なバルク解析からターゲットシングルセル解析まで、生物学的解像度のさまざまなレベルに対応した包括的なソリューションを提供しています。詳細については、マルチオミクス検査法比較ガイドをご覧ください。
バルク細胞集団や組織切片を包括的に解析
バルクエピトープおよび核酸シーケンス（BEN-Seq）を組み合わせることで、単一のワークフロー内で、細胞集団や組織集団を用いたタンパク質活性および転写活性の解析が可能になります。その手法をご紹介します。
組織内の転写活性を空間的にマッピング
空間トランスクリプトミクスの主な利点をご覧ください。この手法では、遺伝子発現を組織構造が保持されたままの組織内で局在化して解析することで、組織の構造と機能に対する理解を深めることができます。
5塩基解析による複雑な経路の解読で、マルチオミクスの知見を獲得
本eBookでは、メチロームとゲノムを統合して解析することの価値を紹介しています。遺伝性疾患、がん、その他の複雑な疾患のメカニズムを解明するために、両者を組み合わせて研究するアプローチをご覧ください。
eBookをダウンロードマルチオミクスのワークフローを効率化
マルチオミクスワークフローは通常、目的に応じて選択したキットによる核酸の抽出から始まり、その後シーケンス用ライブラリーの調製へと進みます。得られた結果はバイオインフォマティクスソフトウェアを用いて解析され、その内容は、サンプルタイプ、使用機器、解析手法、および取得したい知見によって変わってきます。マルチオミクスワークフローを視覚的に理解できるよう、代表的なワークフローの概要と関連製品をご紹介します。バルクシーケンス、シングルセルシーケンス、空間シーケンスの各手法に対応するワークフロー例とソリューションをご覧ください。
ライブラリー調製
DNAライブラリー調製
幅広い用途のアプリケーションに対応する、効率的なDNAライブラリー調製をご体験ください。Illumina DNA PCR Free PrepおよびIllumina DNA Prep with Enrichmentは、精度が重視される用途向けに、高性能、高速かつ統合されたワークフローを提供します。
Illumina Single Cell 3' RNA Prep
細胞分離装置を必要としないシンプルな手動ワークフローを採用した、使いやすくスケーラブルなシングルセルRNA-Seqソリューションです。mRNAキャプチャー、バーコード設定、ライブラリー調製を効率的に実施できます。
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus
コーディングと複数形態のノンコーディングRNAの解析にすぐれたパフォーマンスを発揮します。
Illumina Stranded mRNA Prep
合理化されたRNA-Seqソリューションを提供し、トランスクリプトームを明確かつ包括的に解析します。
シーケンス
生産規模のシーケンサー
複数のオミクスを1台の装置で解析できます。NovaSeq XシリーズおよびNovaSeq 6000システムは、高度なアプリケーションによる広範かつ高深度の解析を実現し、包括的なオミクスデータを取得できます。
ベンチトップシーケンサー
NextSeq 1000およびNextSeq 2000シーケンスシステムは、柔軟性、コスト効率、拡張性を兼ね備えており、経験の有無を問わず、迅速なターンアラウンドタイムと運用コストの削減をサポートします。
データの解析と解釈
Illumina Connected Analytics
インフォマティクス運用の実装と科学的インサイトの創出を支援する、安全性の高いゲノムデータプラットフォームです。
DRAGEN二次解析
NGSデータの正確かつ包括的で効率的な二次解析を実現します。
Correlation Engine
厳選された公開マルチオミクスデータとユーザー独自のマルチオミクスデータを統合し、生物学的な文脈の中で解析できる対話型ナレッジベースです。
Illumina Connected Multiomics
マルチオミクスデータの解釈と可視化を行うための、強力かつ拡張性に優れた解析環境です。
マルチオミクスデータの解釈とインサイト獲得に向けた解析をシンプルに
シーケンス後のデータ解析は、サンプルの生物学的な解釈を可能にする重要なステップです。一般に、マルチオミクスデータ解析パイプラインは3つのフェーズで構成されており、それぞれのステップに対応するソフトウェアが利用可能です。採用するアプローチは、研究目的や対象とするオミクスによって異なります。
一次解析
ベースコールとも呼ばれる一次解析では、データを塩基配列（A、T、C、G）へ変換し、Binary Base Call（BCL）形式の生データファイルを生成します。この解析は、イルミナのシーケンサー上で自動的に実行されます。
二次解析
BCL形式のシーケンスデータは、Illumina製、ユーザー開発、またはサードパーティ製の二次解析ツールで利用するために、FASTQ形式へ変換する必要があります。Illumina DRAGEN Secondary Analysisは、多くの二次解析パイプラインの各工程に対応するツールを提供しています。
三次解析
Illumina Connected Multiomicsは、マルチオミクスデータの解釈と視覚化を行うための、強力かつ拡張性に優れた解析環境です。
Correlation Engineは、厳選された公開マルチオミクスデータとユーザー独自のマルチオミクスデータを統合し、生物学的な文脈の中で解析できる対話型ナレッジベースです。
Illumina Connected Multiomics
Illumina Connected Multiomicsは、イルミナ初の完全統合型マルチオミクス／マルチモーダル解析ソフトウェアです。サンプル取得からインサイト創出までのワークフローをシームレスに実現し、研究者がマルチオミクスデータを探索して、より深い生物学的知見を引き出し、発見を加速できるよう支援します。
- 強力な解析：堅牢な統計手法による、信頼性の高い解析結果の取得
- インタラクティブな視覚化と直感的なインターフェース：バイオインフォマティクスの専門知識を必要としない、情報量が豊富で論文掲載にも適した可視化結果の作成
- より深い生物学的背景: キュレーションされた生物学的知識（細胞タイプ、機能セット）とのリンクによる解析結果の深い解釈と、根拠に基づく意思決定、有意な生物学的パターンの同定、および発見の加速を実現
NovaSeq Xシリーズと25Bフローセルで、さらなる発見を実現
NovaSeq Xシリーズと25Bフローセルを組み合わせることで、マルチオミクス研究を次のレベルへと引き上げましょう。高品質なデータを低コストのワークフローで取得し、研究の加速と拡大を実現できます。
チラシをダウンロード一緒に購入されることの多い製品
注目のお客様インタビュー
疾患研究の新たな可能性を切り開くマルチオミクス
Bernard Thienpont教授が描く、DNA、RNA、タンパク質データを統合して、疾患メカニズム、バイオマーカー、そして将来の臨床応用に関するより深い知見を明らかにするビジョンをご覧ください。
ドーパミンシステムの解読
Dr Elina Nagaevaが、シングルセルおよび空間トランスクリプトミクスを組み合わせることで、ヒトのドーパミンシステムの解明を進め、神経疾患研究における新たな発見の加速に取り組む様子をご紹介します。
脳腫瘍の複雑性を解明
バルクシーケンスとシングルセルシーケンスを活用して、悪性の小児脳腫瘍における不均一性を生み出す潜在的な要因の解明を目指すRoxy Finger氏の取り組みをご覧ください。
補足資料
マルチオミクスによるがん研究の推進
オンタリオ州がん研究所およびUnited Health Networkの研究者が、マルチオミクスを活用して複雑な表現型の原因と結果を結び付け、これまで実現できなかった新たな発見を可能にしている取り組みをご紹介します。
シングルセルマルチオミクスで成功を収めるために
シングルセルマルチオミクス分野の第一人者が、マルチオミクスの活用による成功事例に加え、課題の克服方法やデータ可視化のアプローチについて紹介します。
NGSベースのプロテオミクスによるマルチオミクス
イルミナのNGSソリューションを活用することで、マルチオミクス解析にプロテオミクスを組み込む方法をご覧ください。