CAGE-Seq
CAGE-Seq
CAGEはRNA発現を測定し、プロモーターのTSSをマッピングします。この方法では、RNAは最初にランダムプライマーを用いて逆転写されます。RNAキャップと3'末端はビオチン化されます。非ハイブリダイズした一本鎖RNAはRNaseで消化され、ストレプトアビジンビーズを使用してキャプチャされた5'完全なcDNAが残ります。cDNAはシーケンスのために処理されます。
長所：
- RNA発現レベルを測定し、プロモーター領域のTSSをマッピングします
- 単一ヌクレオチドの分解能でTSSの正確なマッピングを提供
短所：
- 全成熟RNA 1にのみ作用
- 検出は長寿命転写産物のTSSに偏っています
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