NET-Seq

ChIPメンテーション

ChIPmentationは、ChIPとTn5トランスポサーゼによるシーケンスライブラリー調製(タグメンテーション)を組み合わせます。ATAC-seqとChIPmentationはどちらも、オープンクロマチンとタンパク質の結合をアッセイするために、同じ実験でそれぞれ有用に組み合わせることができます。1この手法の組み合わせは、ライブラリー調製にTn5トランスポサーゼを使用することによって得られる柔軟性と効率性を活用します。タグメンテーションは、ビーズに結合した免疫沈降クロマチンで直接行われ、その後、標準的なライブラリー調製法が続きます。

長所:
  • わずか10,000セルから正確なプロファイルを生成可能
  • シンプルなワンステップ反応
短所:
  • 報告なし