ICEの後に続くNGSは、アデノシンからイノシンへの編集を同定します。この方法では、RNAはアクリロニトリルで処理され、対照RNAは未処理です。コントロールRNAと処理RNAは逆転写され、PCR増幅されます。アクリロニトリルで処理したRNA断片のイノシンは逆転写できません。コントロールRNAおよび処理RNAから調製されたcDNAのディープシーケンスにより、RNA断片中のイノシンの高解像度リードが得られます。

長所:
  • アデノシンからイノシンへの編集のマッピングを提供
  • 限られた材料で実施可能
短所:
  • 非線形PCR増幅はバイアスにつながる可能性があり、再現性に影響を与えます
  • ポリメラーゼによって引き起こされる増幅エラーは、誤って表され、シーケンスされます