smMIP
smMIP
単分子分子逆位プローブ（smMIP）法は、超低頻度で発生する遺伝的変異を検出し定量化するために、単分子タグと分子逆位プローブを使用します。この方法では、プローブはゲノムDNAのターゲットを検出するために使用します。プローブされたターゲットがコピーされた後、エキソヌクレアーゼ消化はターゲットにタグを残し、PCR増幅とシーケンスを行います。シーケンスではターゲットの高解像度シーケンスリードが可能で、深度が大きいほどすべての分子タグのアライメントが良好になります。
長所：
- 低頻度ターゲットの検出
- 出発物質が非常に少ないサンプルに対して、シングルセルシーケンスまたはシーケンスを実行できます
短所：
- PCR増幅エラー
- PCRバイアスはGCリッチテンプレートを過小評価する可能性がある
- 500 bp未満のターゲットは、PCR中にポリメラーゼによって優先的に増幅されます