TRAP-Seq
TRAP-Seq
多染色体mRNA（TRAP-Seq）のターゲット精製は、さまざまな条件下でmRNAを翻訳するマップです。この方法では、タグ付きリボソームタンパク質は細胞に発現します。タグ付きリボソームタンパク質を精製し、RNAを単離します。RNAはcDNAに逆転写されます。cDNAのディープシーケンスにより、翻訳RNAの単一塩基分解能が得られます。
長所：
- 翻訳RNAの検出が可能
- 特定のターゲットリボソームによって翻訳されたRNAを評価できる
- RNAの事前知識は必要ありません
- ゲノムワイドRNAスクリーニングを提供
短所：
- Ribo-Seqなど、最近開発された手法ほど具体的ではない