BovineSNP50 v3 DNA Analysis BeadChip

このBeadChipマイクロアレイは、高密度マルチサンプルのウシのジェノタイピングを可能にし、主要な乳用種および肉用種のゲノム特性評価に利用されます。

固定マーカー:ゲノム全体で等間隔のSNP53,218 カスタムマーカーアドオン容量:最大600,000(キットバージョン以上)

マーカー数

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概要

The BovineSNP50 v3 BeadChipマイクロアレイ用キットは、主要なウシの品種タイプ全体のゲノムを均一にカバーする53,218の高情報量なSNPを含み、ゲノムワイド選抜や定量的形質座標(QTL)の同定、個体の遺伝的価値の評価、比較遺伝学的研究などにお使いいただけます。

このBeadChipは、USDA-ARS、ミズーリ大学、アルバータ大学とイルミナの共同開発で誕生しました。経済的に重要な肉牛と乳牛の3つのプール集団からイルミナのシーケンス解析で発見された新規のSNPをターゲットとするSNPプローブが2.2万以上搭載されています。

追加のコンテンツはウシリファレンスゲノム、Btau、およびBovine HapMap Consortiumデータセットなどの公開データに由来します。すべてのSNPプローブは18種の肉牛および乳牛の品種において検証されています。この製品は検査した品種にわたり多型であり均一に分布するSNPをターゲットとし、中央値間隔は37.4 kbです。

  • 24サンプルのBeadChiptは、肉牛および乳牛のゲノムの特性化のための高密度なジェノタイピングソリューションを提供します。

  • PCRフリーのシングルチューブのサンプル調製1.2によりマニュアル作業とハンドリングエラーを最小化

  • 解析全体でサンプルの追跡を高精度で効率よく行うため、アレイベースのラボ情報管理システム(LIMS)とロボットによる自動化が可能

高スループットかつコスト効率の高い遺伝スクリーニングのために、BovineSNP50 BeadChip アレイはウシゲノム全体にわたる5.3万以上の均等に配置されたSNPプローブを搭載しています。柔軟性を高めるために、BeadChipのBovineSNP50+バージョンでは、最大60万の追加マーカーを含めるようにカスタマイズできます。

仕様

必要な製品

キットサイズの選択方法

選択したキットサイズを一度にランするサンプル数に合わせます。各キットは1つのバッチとして処理され、複数の実験に分けられるように設計されていません。ロースループットバッチを複数処理する場合は、複数の小型キットをご購入ください。

/

アプリケーション

ワークフローの例

2
処理とスキャン
3
追跡、分析、およびレポート

関連するアプリケーションと手法

本製品の使用例

生産性の増加と若い雌牛の選抜によって収益が増加し、農場の効率性と競争力の向上をもたらしています。

Martin Dairyは、BovineSNP50 BeadChipテクノロジーを使用して育種判断を改善し、米国で最も生産的なジャージー牛集団の1つを構築しています。

製品比較

選択ツール:

BovineSNP50-24 v3 BeadChip (48 samples)

20000766

この24サンプルBeadChipは、乳牛や牛のゲノム用です。BeadChipには、イルミナのInfinium HTS Assayを使用した53,218の非常に有益なSNPが含まれており、ゲノムワイドな選択、量的形質遺伝子座の同定、個人の遺伝的メリットの評価、比較遺伝子研究に使用できます。

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BovineSNP50-24 v3 BeadChip (288 samples)

20000767

この24サンプルBeadChipは、乳牛および牛のゲノム用です。BeadChipには、イルミナのInfinium HTS Assayによる53,218の非常に有益なSNPが含まれており、ゲノムワイドな選択、量的形質遺伝子座の同定、個人の遺伝的メリットの評価、および比較遺伝子研究に使用できます。

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BovineSNP50-24+ v3 BeadChip (48 samples)

20000769

乳牛および牛のゲノム用のこの24サンプルBeadChip。BeadChipには、イルミナのInfinium HTS Assayを使用した53,218の非常に有益なSNPが含まれており、ゲノムワイドな選択、量的形質遺伝子座の同定、個人の遺伝的メリットの評価、および比較遺伝子研究に使用できます。

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カスタマイズ

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BovineSNP50-24+ v3 BeadChip (288 samples)

20000830

この24サンプルBeadChipは、乳牛および牛のゲノム用です。BeadChipには、イルミナのInfinium HTS Assayによる53,218の非常に有益なSNPが含まれており、ゲノムワイドな選択、量的形質遺伝子座の同定、個人の遺伝的メリットの評価、および比較遺伝子研究に使用できます。

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BovineSNP50-24+ v3 BeadChip (1152 samples)

20000831

この24サンプルBeadChipは、乳牛や牛のゲノム用です。BeadChipには、イルミナのInfinium HTS Assayを使用した53,218の非常に有益なSNPが含まれており、ゲノムワイドな選択、量的形質遺伝子座の同定、個人の遺伝的メリットの評価、比較遺伝子研究に使用できます。

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アクセサリー製品 (1)

BovineSNP50-24 v3 BeadChip (1152 samples)

20000768

この24サンプルBeadChipは、乳牛および牛のゲノム用です。BeadChipには、イルミナのInfinium HTS Assayによる53,218の非常に有益なSNPが含まれており、ゲノムワイドな選択、量的形質遺伝子座の同定、個人の遺伝的メリットの評価、および比較遺伝子研究に使用できます。

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NovaSeq Xシリーズのご購入

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

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TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。

注釈

  1. Gunderson KL, Steemers FJ, Lee G, Mendoza LG, Chee MS (2005) A genome-wide scalable SNP genotyping assay using microarray technology. Genet 37: 549–554.
  2. Steemers FJ, Chang W, Lee G, Barker DL,Shen R, et al. (2006) Whole-genome genotyping with the single-base extension assay. Nat Methods 3: 31–33.

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