この包括的な高密度マイクロアレイキットは、がんの素因とリスクの研究を可能にします。
サンプルスループット
マーカー数
Infinium OncoArray-500Kには、250,000タグSNPのゲノムワイドバックボーンを持つ500,000のSNPが含まれています。その他のSNPには、乳がん、結腸直腸がん、肺がん、卵巣がん、前立腺がんに関連する遺伝子変異に加えて、祖先、定量的形質、薬理遺伝学、一般的ながん感受性遺伝子座のファインマッピングをカバーするSNPが含まれます。追加の研究要件に対応するため、Infinium OncoArray-500Kは最大120,000のカスタムビーズタイプを組み込むようにカスタマイズできます。*
Infinium OncoArray-500Kは、OncoArrayコンソーシアム†の有力な専門家と共同で開発され、成功したCollaborative Oncological Gene-environment Study（iCOGS）アレイ1の多くの機能を活用しています。コンソーシアムによって特定された候補SNPを用いて設計されたOncoArrayは、がんリスクに関連する可能性のある候補バリアントを評価するための費用対効果の高い手段を提供します。
Infinium OncoArray-500Kは、24サンプルハイスループットスクリーニング（HTS）BeadChipを使用して、スループット、生産性、ジェノタイピング精度を最大化します。実績のあるiScanシステムを使用して、Infinium OncoArray-500Kは、手頃な価格と高密度コンテンツを組み合わせ、最も有病率の高い5つのがんにおける遺伝子変異とがん素因の関係に関する洞察を提供するように設計されています。
* カスタムアドオンコンテンツの詳細については、イルミナのアカウントマネージャーまたは セールススペシャリストにお問い合わせください。
| Assay type | Infinium HTS |
|---|---|
| Automation capability | Liquid handling robots, Automated array loader |
| インプット量 | 200 ng DNA |
| システム | iScan |
| 手法 | Targeted genotyping array |
| Nucleic acid type | DNA |
| マーカー数 |
固定マーカー：約500,000 カスタムマーカーアドオン容量：最大120,000（キットバージョン以上） |
| サンプルスループット | 1週間に約2,304サンプル |
| Species category | ヒト |
| テクノロジー | Microarray |
| バリアントクラス | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
選択したキットサイズを一度にランするサンプル数に合わせます。各キットは1つのバッチとして処理され、複数の実験に分けられるように設計されていません。ロースループットバッチを複数処理する場合は、複数の小型キットを注文してください。
次世代シーケンサーとマイクロアレイを使って、個人のがん発症の可能性を増大させる生殖細胞系列変異を同定します。
マイクロアレイデータの視覚化と解析、および大規模な実験のデータ解析の促進に役立つマイクロアレイデータ解析ツールとヒントをご覧ください。
Infinium OncoArray-500K BeadChip Kit (48 samples)
WG-355-1001
各Infinium OncoArray-500K BeadChipは、24のサンプルを処理し、>500,000の遺伝子座を解析できます。各パッケージには、2つのBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。
List Price:
Discounts:
Infinium OncoArray-500K BeadChip Kit (288 samples)
WG-355-1002
各Infinium OncoArray-500K BeadChipは、24のサンプルを処理し、>500,000の遺伝子座を解析できます。各パッケージには、12個のBeadChipと、288個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。
List Price:
Discounts:
Infinium OncoArray-500K v1.0 BeadChip Kit (1152 samples)
WG-355-1003
各Infinium OncoArray-500K BeadChipは、24のサンプルを処理し、>500,000の遺伝子座を解析できます。各パッケージには、48個のBeadChipと、1152個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。
List Price:
Discounts:
Infinium OncoArray-500K+ BeadChip Kit (48 samples)
WG-355-1011
Infinium OncoArray-500K + v1.0（48サンプル）
Infinium OncoArray-500K+ BeadChip Kit (288 samples)
WG-355-1012
Infinium OncoArray-500K + v1.0（288サンプル）
Infinium OncoArray-500K+ BeadChip Kit (1152 samples)
WG-355-1013
Infinium OncoArray-500K + v1.0（1152サンプル）
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カタログ番号
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単価
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリを準備するための、高速で統合されたワークフロー。
低DNAインプット要件で、小規模ゲノム、PCR アンプリコン、プラスミド、cDNA シーケンス用のDNAライブラリーを調整するための90分のワークフローを提供します。
完全にカスタマイズ可能なマイクロアレイで、あらゆる生物種にわたり、実質的にあらゆるターゲットを精査し、お客様独自の研究ニーズに対応します。
Infinium Exome-24 Kitアレイは、多様な集団と幅広い共通条件を表す推定上の機能性エクソンバリアントの優れたカバレッジを提供します。
専門家が選定したシーケンスパネルは、多様ながんを発生する素因と関連する94の遺伝子と284のSNPをターゲットにします。
臨床研究用バリアントの卓越したカバレッジと、遺伝型スクリーニング用に最適化された多民族ゲノムワイドなコンテンツを組み合わせたBeadChip。
1. www.nature.com/icogs/primer/cogs-project-and-design-of-the-icogs-array
† OncoArrayコンソーシアムは、NCIが支援する Genetic Association and Mechanisms in Oncology（GAME-ON）コンソーシアム、 Genome Canada、 Genome Quebec、および Cancer Research UKの有力な専門家による国際的なコラボレーションです。
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