MiniSeqシーケンスシステムのアプリケーションと方法

アクセシブルなクロスメソッドの柔軟性

DNAアプリケーションとRNAアプリケーションのためのシーケンスメソッド間の容易な移行

MiniSeq flow cell

主要なアプリケーションと手法

ターゲットDNAシーケンスにより、研究者は専門家が選択したコンテンツの固定パネルまたはカスタムのユーザー定義遺伝子パネルを使用して、選択された遺伝子セットまたは関連する遺伝子領域に集中することができます。次世代シーケンサー(NGS)のパワーに焦点を当てることで、ターゲットシーケンサーは高い精度と再現性で費用対効果の高い体系的なバリアント検出を可能にします。  

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アッセイと調製の設計
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シーケンス
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解析

MiniSeqシステムは、ランあたり最大50の小さなゲノムをシーケンスし*、最小の生物のゲノムを詳細に表示します。小規模全ゲノムシーケンス(WGS)は、公衆衛生、感染症サーベイランス、分子疫学研究、環境メタゲノムにおけるアプリケーションのための微生物またはウイルスゲノムの包括的な解析を可能にします。このアプローチでは、細菌培養や手間のかかるクローニング手順は必要ありません。

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ライブラリー調製
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シーケンス
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解析

*5 Mbゲノム、30×カバレッジ、2 × 150 bpリード長、Nextera XT Library Prep Kit、およびMiniSeq Reagent High Output 300サイクルキットに基づきます。

MiniSeqシステムを使用したターゲットRNAシーケンス(RNA-Seq)により、数十から数千のターゲットの遺伝子発現を同時に測定できます。 MiniSeqシステムは、遺伝子、アイソフォーム、スプライスジャンクション、cSNP、融合遺伝子をターゲットとするユーザー定義のパネルをサポートします。専門家が選定したコンテンツの事前定義されたパネルは、主要なシグナル伝達パスウェイと細胞プロセスを対象としています。1ランあたりシーケンス1~384ターゲットRNAサンプル。

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アッセイと調製の設計
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シーケンス
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解析

65のターゲット、1000×カバレッジ、1 × 50 bpリード長、TruSeq Targeted RNA Expressionカスタムパネルキット、およびMiniSeq Reagent High Output 75サイクルキットに基づきます。

その他のアプリケーションと手法

16Sメタゲノムシーケンス

16SリボソームのRNA(rRNA)遺伝子を培養不要の方法でシーケンスし、複雑で研究が困難なマイクロバイオームまたは環境から細菌を同定し比較します。

De novoシーケンス

あらゆる種に利用可能なリファレンスシーケンスなしで、新規ゲノムの高速で正確な特徴付けを可能にします。

シーケンスによるジェノタイピング(GBS)

低コストの遺伝子スクリーニング手法を用いて、新しい植物と動物のSNPを発見し、ジェノタイピング研究を実施します。

生殖細胞系列変異解析

がんの遺伝性リスクの増加との関連が既知または疑われる遺伝子を評価します。

病原体の同定と解析

NGSを活用して、研究アプリケーション用のウイルス、バクテリア、真菌、寄生虫を検出し、特徴づけます。

小規模RNAの発見とプロファイリング

microRNAなどのsmall RNAを分離し、シーケンスを決定することで、遺伝子サイレンシングや転写後制御におけるノンコーディングRNAの役割を研究します。

ターゲット遺伝子シーケンス

遺伝子プロファイリング研究用に事前に設計されたパネルまたはカスタム設計されたパネルを使用して、特定の遺伝子またはゲノムの関心領域を選択してシーケンスします。

他の人がこの装置をどのように使用するか

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