MiniSeqシーケンスシステムのアプリケーションと手法

異なる手法を柔軟に利用

DNAとRNAのアプリケーションのためのシーケンス手法間の容易な移行

MiniSeqフローセル

主要なアプリケーションと手法

ターゲットDNAシーケンスにより、研究者は専門家が選択したコンテンツの固定パネルまたはカスタムのユーザー定義遺伝子パネルを使用して、選択された遺伝子セットまたは関連する遺伝子領域に集中することができます。次世代シーケンサー(NGS)のパワーに焦点を当てることで、ターゲットシーケンスは、高い精度と再現性を備えた費用対効果に優れた体系的なバリアント検出を可能にします。  

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アッセイと調製の設計
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シーケンス
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解析

MiniSeqシステムは、ランごとに最大50の小さなゲノムをシーケンスし*、極めて微小な生物のゲノムの詳細な様子を提供します。小規模全ゲノムシーケンス(WGS)は、公衆衛生、感染症サーベイランス、分子疫学研究、環境メタゲノムにおけるアプリケーションのための微生物またはウイルスゲノムの包括的な解析を可能にします。このアプローチでは、細菌培養や手間のかかるクローニング手順は必要ありません。

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ライブラリー調製
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シーケンス
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解析

*5 Mbゲノム、30×カバレッジ、2 × 150 bpリード長、Nextera XT Library Prep Kit、およびMiniSeq Reagent High Output 300サイクルキットに基づきます。

MiniSeqシステムを使用したターゲットRNAシーケンス(RNA-Seq)により、数十から数千のターゲットの遺伝子発現を同時に測定できます。 MiniSeqシステムは、ユーザー定義のパネルをサポートし、遺伝子、アイソフォーム、スプライスジャンクション、cSNP、融合遺伝子をターゲットに設定することが可能です。専門家が選定した内容で構成された既定のパネルは、主要なシグナル伝達経路や細胞プロセスをターゲットとしています。1ランあたり1~384個のターゲットRNAサンプルをシーケンスします。

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アッセイと調製の設計
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シーケンス
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解析

65のターゲット、1000×カバレッジ、1 × 50 bpリード長、TruSeq Targeted RNA Expressionカスタムパネルキット、MiniSeq Reagent High Output 75サイクルキットに基づきます。

その他のアプリケーションと手法

16S メタゲノムシーケンス

16SリボソームのRNA(rRNA)遺伝子を培養不要の方法でシーケンスし、複雑で研究が困難なマイクロバイオームまたは環境から細菌を同定し比較します。

De novoシーケンス

すべての新規ゲノムの高速で精確な特性解析をリファレンスシーケンスなしで可能にします。

シーケンスによるジェノタイピング(GBS)

低コストの遺伝子スクリーニング手法を用いて、新しい植物と動物のSNPを発見し、ジェノタイピング研究を実施します。

生殖系列変異解析

がんの遺伝性リスクの増加に関連することが認識されている、または疑われる遺伝子を評価します。

病原体の同定と解析

NGSを活用して、研究アプリケーション用のウイルス、バクテリア、真菌、寄生虫を検出し、特性を評価します。

Small RNAの探索とプロファイリング

microRNAなどのsmall RNAを分離し、シーケンスを決定することで、遺伝子サイレンシングや転写後制御におけるノンコーディングRNAの役割を研究します。

ターゲット遺伝子シーケンス

遺伝子プロファイリング研究用に事前に設計されたパネルまたはカスタム設計されたパネルを使用して、特定の遺伝子またはゲノムの関心領域を選択してシーケンスします。

装置のその他の使用法

MiniSeqシステムで何ができるかをご覧ください