主要なアプリケーションと手法
ターゲットDNAシーケンスにより、研究者は特定の遺伝子セットまたは関連する遺伝子領域に集中することができ、費用対効果の高い体系的なバリアント検出が可能になります。次世代シーケンサー（NGS）は、多数のサンプルを同時シーケンスするために使用でき、カバーされる遺伝子の数と、関連する遺伝子をカバーする自信の両方を高めます。
ターゲットシーケンスアプリケーションの例：
アッセイデザインとライブラリー調製
5～7時間
AmpliSeq for Illumina Sequencing Solution
一回の実行で数種～数百種の遺伝子を範囲とするターゲットに使用するための、高度にマルチプレックス化されたポリメラーゼ連鎖反応（PCR）に基づくワークフロー
DesignStudio Software
データ解析
2時間未満
Local Run Manager
シーケンスランの作成、ランのステータス監視、データ解析のためのオンプレミス型ソフトウェアソリューションです。
BaseSpace Sequence Hub
NGSデータの解析と管理を行うイルミナのゲノミクスクラウドコンピューティング環境。
BaseSpace Variant Interpreter
研究者がヒトゲノムデータから生物学的に重要なバリアントを迅速に同定できるようにします。
小規模ゲノムシーケンスは、公衆衛生、疫学、疾患研究のために微生物またはウイルスゲノムの包括的な解析を提供します。細菌培養を必要と せずに、研究者は何千もの小規模生物を並行してシーケンスできます。
従来のアプローチとは異なり、NGSを用いた小規模なゲノムシーケンス研究は、手間のかかるクローニングステップに依存しません。 小さなゲノムDNAライブラリーは、わずか2日で調製、シーケンス、解析できます。MiniSeqランあたり最大 50の小さなゲノムをシーケンスします。
ライブラリー調製
1.5時間未満
Nextera XT DNAライブラリー調製キット
小さなゲノム、PCR アンプリコン、プラスミドのシーケンスライブラリーを90分未満で調製し、DNAインプットの必要性を抑えます。
Illumina DNA Prep
ヒト全ゲノムシーケンスからアンプリコン、プラスミド、微生物の種まで、広範囲のアプリケーション用の迅速な統合ワークフロー。
データ解析
2～3時間
Local Run Managerリシーケンス
装置上のデータ解析を自動的に実行します。リードをアライメントし、小さなゲノムの全ゲノムシーケンスのためのバリアント解析を実行します。
TELLSeqアプリ
Tell-ReadおよびTell-Linkアプリは、de novo WGSのアセンブリの読み取りと作成を行います。
サンプルあたりの推定コスト：$64*
*MiniSeqシステム上の小さな全ゲノムシーケンスは、5 Mbゲノム、30xカバレッジ、2 x 150 bpリード長、Nextera XT Library Prep Kit、MiniSeq Reagent High Output 300サイクルキットに基づくサンプルあたりの推定コストです
MiniSeqターゲットRNAシーケンス（RNA-Seq）ソリューションを使用した遺伝子発現プロファイリングにより、数十から数千のターゲットを同時に測定できます。MiniSeqシステムは、遺伝子、アイソフォーム、スプライスジャンクション、cSNP、融合遺伝子をターゲットとするユーザー定義のパネルをサポートします
専門家が選定したコンテンツの事前定義されたパネルは、主要なシグナル伝達経路と細胞プロセスを対象としています。MiniSeqランあたり1～384のターゲットRNAサンプルをシーケンスします。
データ解析
約1時間
Local Run ManagerターゲットRNA解析
RNAサンプルの装置上のデータ解析を自動的に実行します。リードを アライメントし、相対発現を定量化します。
BaseSpace TruSeq Targeted RNA アプリ
BaseSpace Sequence Hubでサンプルデータセットを閲覧する：
MiniSeqターゲットRNAデータ
サンプルあたりの推定コスト：$23*
*MiniSeqシステム上のターゲットRNAシーケンスは、65ターゲット、1000xカバレッジ、1 x 50 bpリード長、TruSeqターゲットRNA発現カスタムパネルキット、MiniSeq試薬高出力75サイクルキットに基づくサンプルあたりの推定コストです
その他のアプリケーションと手法
生殖細胞系列変異解析
生殖細胞系列変異は、がんのリスクと感受性に重要な役割を果たします。ターゲットシーケンスにより、がんの素因となるバリアントの正確な同定が可能になります。
アプリケーションノート
小規模RNAの発見とプロファイリング
microRNAなどの小さなRNA種を単離し、シーケンスします。遺伝子サイレンサーと転写後制御におけるノンコーディングRNAの役割を研究します。
アプリケーションノート
16Sメタゲノムシーケンス
複雑な微生物叢や研究が困難な環境から細菌を同定し、比較するための培養不要の方法。
シーケンスによるジェノタイピング
シーケンスによるジェノタイピングは、新しい植物や動物のSNPを発見し、ジェノタイピング研究を行うための低コストの遺伝子スクリーニング手法を提供します。
感染症の検出と解析
COVID-19、呼吸器病原体、抗菌剤耐性などを検出し、特徴づける強力で包括的なNGSベースのソリューションをご覧ください。
アプリケーションノート
De Novo シーケンス
次世代 シーケンサー（NGS）によるデノボシーケンスにより、リファレンスゲノムなしで種を高速かつ正確に特性解析できます。
アプリケーションノート
検査法ガイド
BeadChipからゲノム、トランスクリプトーム、エピゲノム研究のためのライブラリー調製、シーケンサーの選択、解析、サポートまで、必要な情報に1か所でアクセスできます。研究用途に応じて特別に設計された包括的なガイドを使用して、ラボに最適なツールを選択してください。
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