分子疫学
分子疫学におけるNGS
分子疫学は、感染、蔓延、そして予防に影響を及ぼす宿主と病原菌の中の変位を始めとする、疫病の遺伝学的基礎を同定するためのプロセスを説明します。分子疫学研究者は、通常、病院における感染予防や疫学調査を支援するために、感染源の判定、感染経路の追跡、それに毒性や薬剤耐性の原因となる遺伝子の同定にフォーカスします。
次世代シーケンサー（NGS）は、検出のために、複数の分離株の高度に正確で仮説の不要な解析を可能にし、生命体を同定して抵抗性や毒性を検査するための複数の試験に置き換わります。一方、病原体の同定および特性化のための従来の方法は、一連の仮説により導かれ、限られた数の生命体のみのために最適化されます。
分子疫学特集記事
コロナウイルスの特性化と管理に役立つイルミナシーケンサー
イルミナNGSは、New England Journal of Medicineに掲載された通り、他のテクノロジーと組み合わせて、SARS-CoV-2コロナウイルスゲノムのシーケンス（配列決定）に使用されました。
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分子疫学におけるBGSのさらなるメリット
NGSの主な利点は、研究者がさまざまな生物（細菌、ウイルス、寄生虫）を同定できるゲノムシーケンスデータを生成できることです。 ゲノム間のバリエーションを調べることは、感染や感染拡大につながるメカニズムをよりよく理解するための横断研究と、生物間の関連性を判断するための系統的解析をサポートします。
ゲノム全体のシーケンスデータを使用する、高分解能な病原体分類は、従前の数多くの方法では区別できなかった、生命体の識別を可能にします。
微生物のゲノム全体のシーケンス は、疫学研究者が、病気の起源を追跡し、発生を調査するという従来からの課題を打開するために役に立ちます。
病原性の変化の追跡
NGSがいかにして公衆衛生活動の力となるか、そしてカナダ、ブリティッシュコロンビアで結核の感染拡大を再構成するためにどのように使われたか、Dr. Jennifer Gardyが説明するゲノム疫学入門です。
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関連する疫学ソリューション
感染症サーベイランス
NGSは、新規病原体を同定し、人畜共通感染症のリザーバーを研究し、さらなる感染を予防のための有効な戦略を支援します。
呼吸器病原体ID/AMRパネル
このNGSに基づくワークフローにより、呼吸器病原体および抗微生物薬耐性（AMR）アリルをターゲットとし、IDbyDNAの機能により簡素化されたデータ解析が可能になります。
COVID-19ソフトウェアツール
コロナウイルスの検出と同定の加速化、宿主応答研究の実行、サンプル追跡の簡素化、公開データベースへの貢献を無料で実施します。
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補足資料
参考文献
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