この包括的な高密度マイクロアレイキットは、がんの素因とリスクの研究を可能にします。
サンプルスループット
マーカー数
Infinium OncoArray-500Kには、250,000タグSNPのゲノムワイドバックボーンを持つ500,000のSNPが含まれています。その他のSNPには、乳がん、結腸直腸がん、肺がん、卵巣がん、前立腺がんに関連する遺伝子変異に加えて、祖先、定量的形質、薬理遺伝学、一般的ながん感受性遺伝子座のファインマッピングをカバーするSNPが含まれます。追加の研究要件に対応するため、Infinium OncoArray-500Kは最大120,000のカスタムビーズタイプを組み込むようにカスタマイズできます。*
Infinium OncoArray-500Kは、OncoArrayコンソーシアム†の有力な専門家と共同で開発され、成功したCollaborative Oncological Gene-environment Study（iCOGS）アレイ1の多くの機能を活用しています。コンソーシアムによって特定された候補SNPを用いて設計されたOncoArrayは、がんリスクに関連する可能性のある候補バリアントを評価するための費用対効果の高い手段を提供します。
Infinium OncoArray-500Kは、24サンプルハイスループットスクリーニング（HTS）BeadChipを使用して、スループット、生産性、ジェノタイピング精度を最大化します。実績のあるiScanシステムを使用して、Infinium OncoArray-500Kは、手頃な価格と高密度コンテンツを組み合わせ、最も有病率の高い5つのがんにおける遺伝子変異とがん素因の関係に関する洞察を提供するように設計されています。
* カスタムアドオンコンテンツの詳細については、イルミナのアカウントマネージャーまたは セールススペシャリストにお問い合わせください。
| アッセイの種類 | Infinium HTS |
|---|---|
| 自動化機能 | 自動化アレイローダー, 自動液体分注システム |
| インプット量 | 200 ng DNA |
| システム | iScan |
| 手法 | ターゲットジェノタイピングアレイ |
| 核酸の種類 | DNA |
| マーカー数 |
固定マーカー：約500,000 カスタムマーカーアドオン容量：最大120,000（キットバージョン以上） |
| サンプルスループット | 1週間に約2,304サンプル |
| 生物種カテゴリー | ヒト |
| テクノロジー | マイクロアレイ |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） |
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンスアプリケーションに対応する、高速で、統合されたライブラリー調製のワークフロー。
1. www.nature.com/icogs/primer/cogs-project-and-design-of-the-icogs-array
† OncoArrayコンソーシアムは、NCIが支援する Genetic Association and Mechanisms in Oncology（GAME-ON）コンソーシアム、 Genome Canada、 Genome Quebec、および Cancer Research UKの有力な専門家による国際的なコラボレーションです。
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