TruSight Oncology 500ポートフォリオ

がんを不確実性から洞察へと導く

組織とリキッド検体から包括的なゲノムプロファイリングが可能

TruSight Oncology 500ポートフォリオ

TruSight Oncology 500ポートフォリオは、血液または組織生検サンプルからの固形腫瘍の包括的腫瘍横断型ゲノムプロファイリング(CGP)を可能にする3つのアッセイで構成されています。このポートフォリオは、腫瘍変異負荷(TMB)、マイクロサテライト不安定性(MSI)、相同組換え修復欠損(HRD)などのガイドラインや臨床研究に関連するバイオマーカーを同定するように設計されています。

TruSight Oncology 500アッセイ

HRD*をご利用いただけるようになりました *日本ではご利用になれません

FFPE腫瘍組織から関連DNAおよびRNAがんバイオマーカーを評価します。ゲノム不安定性スコア(GIS)を評価するアクセサリーキットが追加され、これにはHRDが含まれます。

TruSight Oncology 500 High Throughputアッセイ

NextSeq 1000、NextSeq 2000で発売中
NovaSeq Xシリーズ

TruSight Oncology 500アッセイと同じパネル内容と組織インプットタイプを用いて、一度に最大960のサンプルをバッチ処理できます。 

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 Assay

NovaSeq Xシリーズで発売中

より高感度で合理化されたアッセイにより、血漿から循環腫瘍DNA(ctDNA)を4日以内に解析し、自動化に便利なオプションを提供します。

TruSight Oncology 500ポートフォリオのパンフレット

25年以上のイノベーションを誇るNGSの業界リーダーとして、イルミナをCGPソリューションの優先プロバイダーとしてご活用いただけます。ライブラリー調製からバイオインフォマティクスのシーケンスまで、ワークフロー全体にわたる専門知識を持つ単一のサプライヤーとして、イルミナはお客様のラボでCGPを効率的に実現するお手伝いをします。イルミナのポートフォリオは、お客様の施設のニーズに合わせたさまざまなオプションを提供します。

TSO 500ポートフォリオパンフレットをダウンロード

アッセイ比較表

TruSight Oncology 500 TruSight Oncology 500 High Throughput TruSight Oncology 500 ctDNA v2
FFPE(DNAおよびRNA) FFPE(DNAおよびRNA) 血液(cfDNA)
DNAバリアントでは523遺伝子 DNAバリアントでは523遺伝子 DNAバリアントでは523遺伝子
RNA融合とスプライスバリアントでは55遺伝子 RNA融合とスプライスバリアントでは55遺伝子 DNA融合では23遺伝子
バリアントコール:
SNV
InDel
CNV
融合遺伝子
スプライスバリアント
ゲノムシグネチャー
TMB(免疫腫瘍学)
MSI(免疫腫瘍学)
HRD - TSO 500の追加による
HRDキット
バリアントコール:
SNV
InDel
CNV
融合遺伝子
スプライスバリアント
ゲノムシグネチャー
TMB(免疫腫瘍学)
MSI(免疫腫瘍学)
バリアントコール:
SNV
InDel
CNV
融合遺伝子(DNAから)
ゲノムシグネチャー
TMB(免疫腫瘍学)
MSI(免疫腫瘍学)
パネルサイズ:
1.94 Mb DNA、358 kb RNA
パネルサイズ:
1.94 Mb DNA、358 kb RNA
パネルサイズ:
1.94 Mb DNA
およそのターンアラウンドタイム:
4~5日
およそのターンアラウンドタイム:
4~5日
およそのターンアラウンドタイム:
3~4日
シーケンスプラットフォーム:
TSO 500 -- NextSeq 500、NextSeq 550、研究(RUO)モードのNextSeq550Dx
TSO 500 HRD -- NextSeq 550、研究モードのNextSeq 550Dx、NovaSeq 6000 SPフローセル
シーケンスプラットフォーム:
NextSeq 1000 & 2000a
NovaSeq 6000
RUOモードでのNovaSeq 6000Dx a
NovaSeq Xシリーズa
シーケンスプラットフォーム:
NovaSeq 6000
RUOモードでのNovaSeq 6000Dx a
NovaSeq X 
サンプルバッチ処理:

TSO 500 -- 8サンプル/ラン
TSO 500 HRD -- 8~16サンプル/ラン
サンプルバッチ処理:
8~36サンプル/ラン(NextSeq 1000および2000)
16~192サンプル/ラン(NovaSeq 6000)
32~480サンプル/ラン(NovaSeq X)
32~960サンプル/ラン(NovaSeq X Plus)
サンプルバッチ処理:
8~48サンプル/ラン**
サンプルインプット:
40 ng DNA
40 ng RNA
サンプルインプット:
40 ng DNA
40~80 ng RNA
サンプルインプット:
20 ng cfDNA(10~30 ngの可能性あり)
分析特異度:
99.9998%
分析特異度:
99.9998%
分析特異度:
99.9994%(SNV)
分析感度:
96%超
分析感度:
96%超
分析感度:
>95%

a 二次解析には独立したスタンドアロンDRAGEN サーバーが必要

腫瘍横断型バイオマーカー

複数種の固形腫瘍に関して現在関連性の高いDNA & RNA*バリアントの検出。以下のような重要なバイオマーカーがあります。
腫瘍横断型:BRAF NTRK1 NTRK2 NTRK3RET MSI TMB
重要なバイオマーカーを持つ遺伝子 潜在的に重要なバイオマーカーを持つ遺伝子
乳がん 乳房 BRCA1 BRCA2 ERBB2 ESR1 PALB2 PIK3CA       180
結腸がん 結腸 ERBB2 KRAS NRAS             166
骨がん EGFR ERG ETV1 ETV4 EWSR1 FEV FLI1 FUS H3F3A 140
HEY1 IDH1 MDM2 NCOA2 SMARCB1        
肺がん ALK EGFR ERBB2 KRAS MET NUTM1 ROS1     223
黒色腫がん 黒色腫 KIT NRAS ROS1             172
卵巣がん 卵巣 BRCA1 BRCA2 FOXL2             149
中枢神経系(CNS)がん CNS APC ATRX CDKN2A CDKN2B EGFR H3F3A HIST1H3B HIST1H3C IDH1 140
IDH2 MYCN PTCH1 RELA TERT TP53      
前立腺がん 前立腺 AR ATM BARD1 BRCA1 BRCA2 BRIP1 CDK12 CHEK1 CHEK2 151
FANCL FGFR2 FGFR3 PALB2 RAD51B RAD51C RAD51D RAD54L  
甲状腺がん 甲状腺 HRAS KRAS NRAS RET TERT         165
子宮がん 子宮および子宮頸部 BRCA2 EPC1 ERBB2 ESR1 FOXO1 GREB1 JAZF1 NCOA2 NCOA3 138
NUTM2A NUTM2B PAX3 PAX7 PHF1 POLE SMARCA4 SUZ12 TP53
YWHAE                
その他の固形がん腫瘍 その他の固形腫瘍 ALK APC ARID1A ASPSCR1 ATF1 ATIC BAP1 BCOR BRCA1 152
BRCA2 CAMTA1 CARS CCNB2 CDK4 CDKN2A CIC CITED2 CLTC
COL1A1 COL6A3 CREB1 CREB3L1 CREB3L2 CSF1 CTNNB1 DDIT3 DDX3X
DNAJB1 DUX4 EED EGFR ERBB2 ERG ETV1 ETV4 ETV6
EWSR1 FEV FGFR2 FGFR3 FLI1 FOXL2 FOXO1 FOXO4 FUS
GLI1 HEY1 HGF HMGA2 IDH1 KRAS LEUTX MAML3 MDM2
MYB MYOD1 NAB2 NCOA2 NF1 NFATC2 NFIB NR4A3 NRAS
NUTMI NUTM2A NUTM2B PALB2 PATZ1 PAX3 PAX7 PDGFB PDGFRA
PRKACA PRKD1 RANBP2 ROS1 SDHA SDHB SDHC SDHD SMARCB1
SS18 SSX1 SSX2 SSX4 STAT6 SUZ12 TAF15 TCF12 TERT
TFE3 TFEB TFG TP53 TPM3 TPM4 TRAF7 TSPAN31 VGLL2
WT1 WWTR1 YAP1 YWHAE ZC3H7B        

この表に記載されている遺伝子とバイオマーカーは、パネルに含まれるすべての遺伝子のサブセットです。遺伝子リストをすべて確認するには、各製品ページの製品資料セクションの製品データシートをご覧ください。

* RNAバリアントは、TSO 500およびTSO 500 HTアッセイからのみコールされます。

DNAおよびRNAバリアントを評価する製品は、TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundleです。

イルミナのNGSメソッドガイド

解析評価ガイダンス

TruSight Oncology 500の解析ガイダンスは、最新の業界標準とベストプラクティスに沿った推奨事項により、実装を迅速化します。

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