組織とリキッド検体から包括的なゲノムプロファイリングが可能
TruSight Oncology 500ポートフォリオは、血液または組織生検サンプルからの固形腫瘍の包括的腫瘍横断型ゲノムプロファイリング(CGP)を可能にする3つのアッセイで構成されています。このポートフォリオは、腫瘍変異負荷(TMB)、マイクロサテライト不安定性(MSI)、相同組換え修復欠損(HRD)などのガイドラインや臨床研究に関連するバイオマーカーを同定するように設計されています。
HRD*をご利用いただけるようになりました *日本ではご利用になれません
FFPE腫瘍組織から関連DNAおよびRNAがんバイオマーカーを評価します。ゲノム不安定性スコア(GIS)を評価するアクセサリーキットが追加され、これにはHRDが含まれます。
NextSeq 1000、NextSeq 2000で発売中
NovaSeq Xシリーズ
TruSight Oncology 500アッセイと同じパネル内容と組織インプットタイプを用いて、一度に最大960のサンプルをバッチ処理できます。
NovaSeq Xシリーズで発売中
より高感度で合理化されたアッセイにより、血漿から循環腫瘍DNA(ctDNA)を4日以内に解析し、自動化に便利なオプションを提供します。
25年以上のイノベーションを誇るNGSの業界リーダーとして、イルミナをCGPソリューションの優先プロバイダーとしてご活用いただけます。ライブラリー調製からバイオインフォマティクスのシーケンスまで、ワークフロー全体にわたる専門知識を持つ単一のサプライヤーとして、イルミナはお客様のラボでCGPを効率的に実現するお手伝いをします。イルミナのポートフォリオは、お客様の施設のニーズに合わせたさまざまなオプションを提供します。
TSO 500ポートフォリオパンフレットをダウンロードTruSight Oncology 500 | TruSight Oncology 500 High Throughput | TruSight Oncology 500 ctDNA v2 |
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FFPE(DNAおよびRNA) | FFPE(DNAおよびRNA) | 血液(cfDNA) |
DNAバリアントでは523遺伝子 | DNAバリアントでは523遺伝子 | DNAバリアントでは523遺伝子 |
RNA融合とスプライスバリアントでは55遺伝子 | RNA融合とスプライスバリアントでは55遺伝子 | DNA融合では23遺伝子 |
バリアントコール: SNV InDel CNV 融合遺伝子 スプライスバリアント ゲノムシグネチャー TMB(免疫腫瘍学) MSI(免疫腫瘍学) HRD - TSO 500の追加による HRDキット |
バリアントコール: SNV InDel CNV 融合遺伝子 スプライスバリアント ゲノムシグネチャー TMB(免疫腫瘍学) MSI(免疫腫瘍学) |
バリアントコール: SNV InDel CNV 融合遺伝子(DNAから) ゲノムシグネチャー TMB(免疫腫瘍学) MSI(免疫腫瘍学) |
パネルサイズ: 1.94 Mb DNA、358 kb RNA |
パネルサイズ: 1.94 Mb DNA、358 kb RNA |
パネルサイズ: 1.94 Mb DNA |
およそのターンアラウンドタイム: 4~5日 |
およそのターンアラウンドタイム: 4~5日 |
およそのターンアラウンドタイム: 3~4日 |
シーケンスプラットフォーム: TSO 500 -- NextSeq 500、NextSeq 550、研究(RUO)モードのNextSeq550Dx TSO 500 HRD -- NextSeq 550、研究モードのNextSeq 550Dx、NovaSeq 6000 SPフローセル |
シーケンスプラットフォーム: NextSeq 1000 & 2000a NovaSeq 6000 RUOモードでのNovaSeq 6000Dx a NovaSeq Xシリーズa |
シーケンスプラットフォーム: NovaSeq 6000 RUOモードでのNovaSeq 6000Dx a NovaSeq X |
サンプルバッチ処理: TSO 500 -- 8サンプル/ラン TSO 500 HRD -- 8~16サンプル/ラン |
サンプルバッチ処理: 8~36サンプル/ラン(NextSeq 1000および2000) 16~192サンプル/ラン(NovaSeq 6000) 32~480サンプル/ラン(NovaSeq X) 32~960サンプル/ラン(NovaSeq X Plus) |
サンプルバッチ処理: 8~48サンプル/ラン** |
サンプルインプット: 40 ng DNA 40 ng RNA |
サンプルインプット: 40 ng DNA 40~80 ng RNA |
サンプルインプット: 20 ng cfDNA(10~30 ngの可能性あり) |
分析特異度: 99.9998% |
分析特異度: 99.9998% |
分析特異度: 99.9994%(SNV) |
分析感度: 96%超 |
分析感度: 96%超 |
分析感度: >95% |
a 二次解析には独立したスタンドアロンDRAGEN サーバーが必要
腫瘍横断型:BRAF NTRK1 NTRK2 NTRK3RET MSI TMB | |||||||||||
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重要なバイオマーカーを持つ遺伝子† | 潜在的に重要なバイオマーカーを持つ遺伝子‡ | ||||||||||
BRCA1 | BRCA2 | ERBB2 | ESR1 | PALB2 | PIK3CA | 180 | |||||
ERBB2 | KRAS | NRAS | 166 | ||||||||
EGFR | ERG | ETV1 | ETV4 | EWSR1 | FEV | FLI1 | FUS | H3F3A | 140 | ||
HEY1 | IDH1 | MDM2 | NCOA2 | SMARCB1 | |||||||
ALK | EGFR | ERBB2 | KRAS | MET | NUTM1 | ROS1 | 223 | ||||
KIT | NRAS | ROS1 | 172 | ||||||||
BRCA1 | BRCA2 | FOXL2 | 149 | ||||||||
APC | ATRX | CDKN2A | CDKN2B | EGFR | H3F3A | HIST1H3B | HIST1H3C | IDH1 | 140 | ||
IDH2 | MYCN | PTCH1 | RELA | TERT | TP53 | ||||||
AR | ATM | BARD1 | BRCA1 | BRCA2 | BRIP1 | CDK12 | CHEK1 | CHEK2 | 151 | ||
FANCL | FGFR2 | FGFR3 | PALB2 | RAD51B | RAD51C | RAD51D | RAD54L | ||||
HRAS | KRAS | NRAS | RET | TERT | 165 | ||||||
BRCA2 | EPC1 | ERBB2 | ESR1 | FOXO1 | GREB1 | JAZF1 | NCOA2 | NCOA3 | 138 | ||
NUTM2A | NUTM2B | PAX3 | PAX7 | PHF1 | POLE | SMARCA4 | SUZ12 | TP53 | |||
YWHAE | |||||||||||
ALK | APC | ARID1A | ASPSCR1 | ATF1 | ATIC | BAP1 | BCOR | BRCA1 | 152 | ||
BRCA2 | CAMTA1 | CARS | CCNB2 | CDK4 | CDKN2A | CIC | CITED2 | CLTC | |||
COL1A1 | COL6A3 | CREB1 | CREB3L1 | CREB3L2 | CSF1 | CTNNB1 | DDIT3 | DDX3X | |||
DNAJB1 | DUX4 | EED | EGFR | ERBB2 | ERG | ETV1 | ETV4 | ETV6 | |||
EWSR1 | FEV | FGFR2 | FGFR3 | FLI1 | FOXL2 | FOXO1 | FOXO4 | FUS | |||
GLI1 | HEY1 | HGF | HMGA2 | IDH1 | KRAS | LEUTX | MAML3 | MDM2 | |||
MYB | MYOD1 | NAB2 | NCOA2 | NF1 | NFATC2 | NFIB | NR4A3 | NRAS | |||
NUTMI | NUTM2A | NUTM2B | PALB2 | PATZ1 | PAX3 | PAX7 | PDGFB | PDGFRA | |||
PRKACA | PRKD1 | RANBP2 | ROS1 | SDHA | SDHB | SDHC | SDHD | SMARCB1 | |||
SS18 | SSX1 | SSX2 | SSX4 | STAT6 | SUZ12 | TAF15 | TCF12 | TERT | |||
TFE3 | TFEB | TFG | TP53 | TPM3 | TPM4 | TRAF7 | TSPAN31 | VGLL2 | |||
WT1 | WWTR1 | YAP1 | YWHAE | ZC3H7B |
この表に記載されている遺伝子とバイオマーカーは、パネルに含まれるすべての遺伝子のサブセットです。遺伝子リストをすべて確認するには、各製品ページの製品資料セクションの製品データシートをご覧ください。
* RNAバリアントは、TSO 500およびTSO 500 HTアッセイからのみコールされます。
† DNAおよびRNAバリアントを評価する製品は、TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundleです。