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TruSight Oncology 500臨床研究ソリューション

がんを不確実性から洞察へと導く

組織およびリキッドバイオプシーからの包括的なゲノムプロファイリングを実現（臨床研究向け）

（画像説明）女性サイエンティストがピペットを用いてチューブに試薬を分注する様子。ラボベンチにはTruSight Oncology ctDNA v2 Enrichmentライブラリー調製キットのボックスが2つ置かれ、NovaSeq Xの消耗品とともに配置されている。背景には、2人のサイエンティストとNovaSeq Xシステムがぼんやりと映っている。

高精度腫瘍学研究を支える合理化されたアッセイ

TruSight Oncology 500製品ラインは、汎がん （Pan-Cancer）に対応した次世代シーケンサー（NGS）アッセイを提供し、施設内で包括的ゲノムプロファイリング（CGP）を実施できるようにします。主要なガイドラインや臨床試験で推奨されるバイオマーカーを同定し、単一の統合アッセイで検出可能です。従来の反復検査と比較して、より少ないサンプルでより多くの結果を得ることができます。 

TruSight Oncology 500製品

TruSight Oncology 500 v2*

主要なバリアントクラスと遺伝子シグネチャ（TMB、MSI、HRD）をすべてカバーする包括的な汎がんパネルを用いて、さらに効率的なワークフローでFFPE組織からのCGPに関する所見を迅速に得ることが可能です。

*TruSight Oncology 500 v2キットは日本ではご購入いただけません。TruSight Oncology 500 v1キットは引き続きご購入いただけます。詳細については、イルミナの担当者にお問い合わせください。

TruSight Oncology 500 ctDNA v2

主要な免疫腫瘍学遺伝子シグネチャ（TMB、MSI）に加えて、血漿中のctDNAからすべての主要なバリアントクラスを検出できる汎がん （Pan-Cancer）パネルでCGPを可能にします。

主な特長とメリット

包括的

TMB、MSI、HRD*などの幅広いゲノムシグネチャーを含む500超の種類もの汎がん （Pan-Cancer）バイオマーカーを、一度のマルチプレックスアッセイで評価可能です。従来の逐次検査を行うことなく、関連する変異を同定できる可能性を高めます。

柔軟性

FFPEサンプルやリキッドバイオプシー由来の微量な血中循環腫瘍DNA（ctDNA）を使用することで、組織サンプルを用いた研究を補い、十分な組織サンプルが得られない場合でも解析を可能にします。

信頼性

ロバストなハイブリッドキャプチャーケミストリー、実績のあるSBSシーケンス、高度なバイオインフォマティクスにより、製品ポートフォリオ全体で一貫した高品質を実現します。

ラボ内での運用

ラボで高精度腫瘍学を実施することで、サンプルロスを最小限に抑え、ターンアラウンドタイムを管理し、品質を監視するとともに、新たな発見に応じてデータを再解析できる環境を維持できます。

タイムリー

統合型のライブラリー調製、シーケンス、およびバイオインフォマティクスオプションを活用し、ローカルまたはクラウド環境で解析することによって、3～4日で結果を取得できます。

スケーラブル

自動化オプションにより、ハンズオンタイムを短縮し、エラーを最小限に抑えます。TruSight Oncologyでは1回のランで8～960サンプルをシーケンス可能です。さらに、TruSight Oncology 500 ctDNAでは、1回のランで8～48サンプルをシーケンス可能です。

主要なバイオマーカー

さまざまな種類のがんに対するゲノム腫瘍プロファイリングバイオマーカーのサブセット

汎がん （Pan-Cancer）: BRAF、NTRK1、NTRK2、NTRK3、RET、TMB、MSI

重要なバイオマーカーを持つ遺伝子a
  乳房 AKT1 BRCA1 BRCA2 ESR1 PIK3CA PTEN
  結腸 KRAS NRAS POLD1 POLE    
  肺 ALK BRAF EGFR ERBB2 KRAS MET
RET ROS1        
  黒色腫 KIT NRAS        
  卵巣 BRCA1 BRCA2 HRD      
  前立腺 ATM ATR BARD1 BRCA1 BRCA2 BRIP1
CDK12 CHEK1 CHEK2 FANCL MRE11A NBN
PALB2 RAD51B RAD51C RAD51D RAD54L  
  子宮 POLE          

この表に記載されている遺伝子とバイオマーカーは、パネルに含まれるすべての遺伝子のサブセットです。遺伝子リストをすべて確認するには、各製品ページの製品資料セクションの製品データシートをご覧ください。

  1. *主要ガイドラインにリンクされた重要なバイオマーカーを持つ遺伝子。

製品比較

  TruSight Oncology 500 v2* TruSight Oncology 500 ctDNA v2
アッセイ時間 サンプルインプットから最終結果まで3～4日 精製された核酸からバリアントレポートまで3〜4日
自動化に対応 自動液体分注システム 自動液体分注システム
自動化の詳細 利用可能な自動化方法を見る 利用可能な自動化方法を見る
がん種 汎がん （Pan-Cancer）、固形腫瘍 汎がん （Pan-Cancer）、固形腫瘍
コンテンツ仕様
  • 523の遺伝子からのDNAおよび55の遺伝子からのRNAのターゲットシーケンス、合計1.94 Mbのパネルサイズ。MSIおよびTMB測定を含みます。 
  • 含まれる相同組換え修復欠損（HRD）パネルには、Myriad Geneticsによる包括的ゲノム不安定性スコア（LOH+TAI+LST）で相同組換え欠損を評価するために、約25,000のSNPが含まれます。
  • 免疫腫瘍学バイオマーカーのカバレッジ：TMBおよびMSI
  • ガイドラインのカバレッジ：複数の固形腫瘍タイプに関する主要ガイドラインを幅広く網羅
  • 臨床試験のカバレッジ：600件を超える臨床試験（2023年2月現在、Velseraナレッジベースに基づく）
説明 FFPE組織のDNAとRNAを使用して、固形腫瘍の包括的なゲノムプロファイリングを可能にします。1つのサンプルからバリアント検出とバイオマーカー評価を行い、幅広い腫瘍特性を解析します。 液体生検サンプル（血漿からのctDNA）の包括的ゲノムプロファイリングにより、非侵襲的な研究方法を実現します。この液体生検アプローチは、組織ベースのCGPを補完する低侵襲性サンプル収集アプローチを使用して、腫瘍内および腫瘍間の不均一性に関する知見を提供します。
ハンズオンタイム 手動ワークフロー約7時間 自動ワークフロー約1.5時間。
手動ワークフロー約2.5時間。
インプット量 30 ng DNA（最低10 ng）、40 ng RNA（最低20 ng） cfDNA 20 ng（血漿4 ml）
装置 NextSeq 550システム、NextSeq 2000システム、NextSeq 1000システム、研究（RUO）モードでのNextSeq 550Dx システム、NovaSeq Xシステム、NovaSeq 6000Dx システム 研究（RUO）モード、NovaSeq 6000システム、NovaSeq X Plusシステム NovaSeq Xシステム、NovaSeq X Plusシステム、NovaSeq 6000システム、NovaSeq 6000Dxシステム（研究（RUO）モード） 
手法 ターゲットDNAシーケンス、ターゲットRNAシーケンス、ターゲットエンリッチメント ターゲットエンリッチメント、ターゲットDNAシーケンス
マルチプレックス NextSeq 550/Dx：8サンプル/ラン
NextSeq 1000および2000：P2フローセル8サンプル、P3フローセル24サンプル、P4フローセル36サンプル
NovaSeq 6000/Dx：SPフローセル16サンプル、S1フローセル32サンプル、S2フローセル72サンプル、S4フローセル192サンプル
NovaSeq X/X+：1.5B 32サンプル、10B 192サンプル、25B 480サンプル		 NovaSeq Xシリーズ：1.5Bフローセルに4サンプル、10Bフローセルに24サンプル。
NovaSeq 6000システム：S2フローセルに8サンプル、S4フローセルに24サンプル、最大192インデックス。
核酸の種類 DNA RNA DNA
サンプルスループット 8～960 サンプル/ラン 4～48サンプル/ラン
特殊なサンプルタイプ ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織 血中循環腫瘍DNA、血液
生物種カテゴリー ヒト ヒト
テクノロジー シーケンス シーケンス
バリアントクラス 遺伝子融合、ヘテロ接合性欠失（LOH）、体細胞バリアント、転写バリアント、1塩基変異（SNV）、挿入-欠失（indel）、コピー数バリアント（CNV）、ゲノム不安定性（GIS）、マイクロサテライト不安定性（MSI）、腫瘍変異負荷（TMB）、新規転写、１塩基変異多型（SNP）、構造多型 1塩基変異（SNV）、挿入-欠失（indel）、コピー数バリアント（CNV）

よくある質問

TruSight Oncology 500 v2 およびTruSight Oncology 500 ctDNA v2は、DNAおよびRNAバリアントを含む523種類のがん関連遺伝子を対象としています。（RNAバリアントは、TruSight Oncology 500 v2組織ベースアッセイにのみ含まれています。） 対象遺伝子は、複数の固形腫瘍タイプにわたるガイドライン、医薬品ラベル、臨床試験との整合性に基づいて選定されています。 詳細および全遺伝子リストについては、TruSight Oncology 500 v2 およびTruSight Oncology 500 ctDNA v2 データシートをご参照ください。

TruSight Oncology 500 v2アッセイには、ラボがゲノム不安定性（GIS）の評価を可能にし、卵巣がん、乳がん、膵臓がん、および前立腺がんに関連する腫瘍の洞察を得るために必要なプローブが含まれています。3

TruSight Oncology 500 ctDNA v2には、TruSight Oncology 500 v2と同様のコンテンツが含まれていますが、遺伝子融合の解析はDNA由来のみで行われ、対象となる遺伝子数は23種類です（組織アッセイでは55種類）。さらに、TruSight Oncology 500 ctDNA v2にはHRDアセスメントが含まれていません。

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リソース

サムネール

Catalan Institute of OncologyにおけるTSO 500 v2によるがん研究の進歩

Catalan Institute of Oncologyの研究者がTruSight Oncology 500 v2を使用してどのようにワークフローを合理化し、研究を加速させているかをご覧ください。この動画では、同研究所のサイエンティストがアッセイの改善について語り、より迅速な結果が発見の推進にどのように役立つかを紹介します。

お問い合わせ

TruSight Oncology 500製品ラインの詳細とニーズに合ったアッセイを見つけるには、イルミナの担当者にお問い合わせください。

＊日本では、TruSight Oncology v2は販売されていません。

 

参考文献

  1. Pierian Knowledgebase v8.5（2023年2月）によって提供されているコンテンツ解析。
  2. O'Connor MJ. Targeting the DNA Damage Response in Cancer. Mol Cell. 2015;60(4):547-560. doi:10.1016/j.molcel.2015.10.040 
  3. Yamamoto H, Hirasawa A. Homologous recombination deficiencies and hereditary tumors. Int J Mol Sci. 2021;23(1):348. doi:10.3390/ijms23010348