Infinium Asian Screening Array（ASA）は東アジア集団のゲノムワイドなカバレッジ、臨床研究コンテンツを組み合わせた拡張性の高い製品で、ゲノムスクリーニングのためのコスト効率の高い強力なツールです。
このアレイは、約9,000人の全ゲノムシーケンスから成る東アジア人リファレンスパネルを用いて構築されました。1000ゲノムプロジェクトでは少数しか含まれていない集団のカバレッジが含まれています。
Infinium Asian Screening Arrayでは、研究者、医療機関、消費者向けゲノム解析企業、サービスプロバイダー企業のコミュニティーが開発したInfinium Global Screening Arrayの成功が生かされています。イルミナのスクリーニングアレイは広く採用されており、世界中のユーザーからの注文は2千万サンプルを超えています。
このアレイは、疾患リスクプロファイリング、薬理ゲノミクス研究、健康やライフスタイルと遺伝子型の関連研究、複雑な疾患の研究のためのゲノムツールです。ClinVarやPharmGKBなどの臨床データベースから得られる最新マーカーが含まれています。
本アレイは、唾液、血液、頬粘膜スワブ、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）サンプルなどの各種サンプルタイプのジェノタイピングおよびCNVコーリングに対応しています。Infiniumプラットフォームは優れたデータ品質に関する高い信頼性があり、コールレートは99%超、再現性は99.9%を超えています。Infiniumのハイスループットワークフローにより、コスト、設備、ラボスペース、操作時間は最小限に抑えながらサンプル処理を最大限に行うことができます。
| Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 BeadChip | Infinium Global Screening Array-24 Kit | |
|---|---|---|
| Input Quantity | 200 ng DNA | 200 ng DNA |
| Method | Genome-Wide Genotyping Array, High-Throughput Genotyping Array | Genome-Wide Genotyping Array, High-Throughput Genotyping Array |
| Number of Markers | Fixed markers: ~ 660,000, Custom marker add-on capacity up to 50,000 | Fixed markers: ~ 640,000 Custom marker add-on capacity: Up to 50,000 |
| Species Category | Human | Human |
| System Compatibility | iScan | iScan |
| Technology | Microarray | Microarray |
| 集団 | 略語 | コホート | シーケンス深度 |
|---|---|---|---|
| 中国人 | CHS-GIS | Genomics Institute of Singapore | 30× |
| 南部漢民族 | CHS | 1000G - 南部漢民族 | 2–4× |
| 中国ダイ族 | CDX | 1000G - シーサンパンナ・タイ族自治州の中国ダイ族 | 2–4× |
| 漢民族 | CBD | 1000G - 北京 | 2–4× |
| 日本人 | R-JAP1 | RIKEN W13 | 15× |
| 日本人 | R-JAP2 | RIKEN W1–6 | 30× |
| 日本人 | R-JAP3 | RIKEN W18 | 30× |
| 日本人 | K-JAP | KYOTO | 3-15× |
| 日本人 | JAP | 1000G - 東京 | 2-4× |
| 韓国人 | M-KOR | MACROGEN | 15-30× |
| 韓国人 | KPGP | The Personal Genome Project Korea（KPGP） | 約35× |
| マレーシア人 | MAL | シンガポール集団健康調査 | 30× |
| モンゴル人 | MON | MACROGEN | 30× |
| ベトナム人 | KVT | 1000G - ホーチミンのキン族 | 2-4× |
Asian Screening Array v1.0の開発で使用された全ゲノムシーケンスの説明
臨床研究アプリケーションを行う研究者にとって有用な情報を提供するアレイを作製するため、コンテンツは科学的に認められているデータベースから専門家が選択しました。
臨床研究コンテンツは、CPICガイドラインとPharmGKBデータベースを元に選択された薬理ゲノミクスマーカーの大規模なリストを特徴としています。マーカーは、PharmGKBデータベースにより規定されるエビデンスレベルに従って配置されています。VIP：非常に重要な薬理遺伝子
Infinium Asian Screening Array BeadChip Data Sheet
Data Sheet | HTML
Infinium™ Chinese Genotyping Array-24 v1.0 BeadChip
Data Sheet | PDF < 1 MB
【日本語版】Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 BeadChip
Data Sheet | PDF < 1 MB
Infinium Asian Screening Array Documentation
カスタムプロトコルセレクタ
Generates customized, end-to-end instructions
The Infinium Global Screening Array-24 v3.0 BeadChip is a next-generation genotyping array for population-scale genetics, variant screening, pharmacogenomics studies, and precision medicine research.
この8サンプルフォーマットのBeadChipアレイは約250万のマーカーを搭載しており、カスタムマーカーの追加機能によって、多様な集団においてきわめて高いゲノムカバレッジレートを提供します。
