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Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 BeadChip

Infinium Asian Screening Array-24 Kit

東アジアの母集団における大規模な遺伝学的研究およびファーマコゲノミクスのための、強力で費用対効果の高いジェノタイピングマイクロアレイ。

1週間に約2,304サンプル（iScanシステム1台、AutoLoader1台、Tecanロボット2台、週5日勤務を想定） 

サンプルスループット

24サンプル （１アレイあたり）

サンプル数

固定マーカー：約660,000、カスタムマーカーアドオン容量最大50,000

マーカー数

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概要

Infinium Asian Screening Array Kitには、東アジア母集団および東南アジア母集団における集団遺伝学的研究のための24サンプルBeadChipと試薬が含まれています。

  • 9,000を超える全ゲノムシーケンスを含む東アジアのリファレンスパネルを使用し、ここでは1000 Genomes Projectであまり解析されていない集団もカバーされています。

  • 最新の臨床研究および疾患関連コンテンツを含む

  • 99%を超えるコール率と99.9%を超える再現性で高いデータ品質を維持

専門家が厳選したコンテンツ

このマイクロアレイは、主要な機関とのコラボレーションにより設計されました。コンテンツには、臨床研究バリアントを用いたゲノムワイドなバックボーン、QCマーカー、発見パネル、およびカスタムアドオンコンテンツが含まれます。

幅広く採用

このマイクロアレイは、Infinium Global Screening Arrayの商業的成功を基盤としています。Illumina Infiniumアレイは、グローバルなユーザーコミュニティから2,000万サンプルを超える注文を受けています。

ロバストでスケーラブル

ジェノタイピングとCNVコールは、複数のサンプルタイプ（唾液、血液、口腔綿棒、FFPEサンプルなど）に対応しています。ハイスループットのワークフローは、コスト、装置、ラボスペース、ハンズオンタイムを最小限に抑えながら、サンプル処理を最大化します。

オプションのアドオンとして、事前設計されたブースターコンテンツをご用意しています。

仕様

アッセイの種類 Infinium HTS
自動化機能 自動化アレイローダー, 自動液体分注システム
説明 東アジア母集団および東南アジア母集団における集団規模の遺伝学的研究、バリアントスクリーニング、プレシジョンメディシン研究に、高価値でスケーラブル、かつ費用対効果の高いソリューションを提供する先進的なジェノタイピングアレイ。 
インプット量 gDNA 200 ng
システム iScan
手法 ハイスループットジェノタイピングアレイ, ゲノムワイドジェノタイピングアレイ
核酸の種類 DNA
マーカー数 固定マーカー：約660,000、カスタムマーカーアドオン容量最大50,000
サンプル数 24サンプル （１アレイあたり）
サンプルスループット 1週間に約2,304サンプル（iScanシステム1台、AutoLoader1台、Tecanロボット2台、週5日勤務を想定） 
対応サンプルタイプ 血液, FFPE組織
生物種カテゴリー ヒト
テクノロジー マイクロアレイ
バリアントクラス 1塩基変異多型（SNP）, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV）

必要な製品

選択したキットサイズを一度にランするサンプル数に合わせます。各キットは1つのバッチとして処理され、複数の実験に分けられるように設計されていません。ロースループットバッチを複数処理する場合は、複数の小型キットを注文してください。

DesignStudioを使用してコンテンツをカスタマイズするか、またはコンソーシアムブースターとして利用可能なアドオンコンテンツのリストから選択できます。ブースターアドオンコンテンツは、複数の疾患マーカー（約5万SNP）でご利用いただけます。

在庫状況と価格については、担当営業にご確認ください。

Infinium FFPE QC KitおよびInfinium HD FFPE DNA Restore Kitはオプションですが、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）サンプルでInfinium Asian Screening Arrayを使用する場合に推奨されます。

/ 件

アプリケーション

Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 BeadChipは、疾患関連やリスクプロファイリング研究、ファーマコゲノミクス研究、疾患特性評価、ライフスタイルや健康特性評価、複雑な疾患におけるマーカー発見など、幅広い臨床研究およびバリアントスクリーニングのアプリケーションにおいて、東アジア母集団を対象とした費用対効果に優れたスケーラブルなゲノムスクリーニングを可能にします。

ワークフローの例

1
方法
2
スケールとプロセス
3
追跡、分析、およびレポート

関連するアプリケーションと手法

ハイスループットジェノタイピング

マイクロアレイを用いた大規模なジェノタイピングにより、大規模なコホートまたは母集団における疾患リスクに関連するバリアントを同定することができます。

ヒトのジェノタイピング

ヒトのジェノタイピングアレイは、何千ものサンプルを処理して、形質や疾患に関連するバリアントを特定するのに理想的です。

複雑な疾患と遺伝性疾患に関する研究

包括的なアレイおよび次世代シーケンサー（NGS）ソリューションにより、さまざまな遺伝性の複雑な疾患の研究を加速できます。

本製品の用途例

ドキュメント

製品資料
サポートドキュメント

製品比較

Infinium Asian Screening Array-24 Kit Infinium Global Screening Array-24 Kit Infinium Global Diversity Array-8 Kit
アッセイの種類 Infinium HTS Infinium HTS Infinium LCG
自動化機能 自動化アレイローダー, 自動液体分注システム 自動化アレイローダー, 自動液体分注システム 自動化アレイローダー, 自動液体分注システム
説明 東アジア母集団および東南アジア母集団における集団規模の遺伝学的研究、バリアントスクリーニング、プレシジョンメディシン研究に、高価値でスケーラブル、かつ費用対効果の高いソリューションを提供する先進的なジェノタイピングアレイ。  Infinium Global Screening Array-24 Kitは、最適化された多民族ゲノムワイドコンテンツ、キュレーションされた臨床研究バリアント、およびQCマーカーを組み合わせることで、集団規模の遺伝学、トランスレーショナル研究、バリアントスクリーニング研究、プレシジョンメディシン研究を可能にする経済的な次世代ジェノタイピングアレイです。 8サンプルのInfinium Global Diversity Arrayは、ゲノム全体で4,800を超える重要な遺伝子のターゲットカバレッジを提供します。BeadChipには約180万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能1.5 Mbを提供します。
インプット量 gDNA 200 ng 200 ng 200 ng DNA
システム iScan iScan iScan
手法 ハイスループットジェノタイピングアレイ, ゲノムワイドジェノタイピングアレイ ハイスループットジェノタイピングアレイ, ゲノムワイドジェノタイピングアレイ ゲノムワイドジェノタイピングアレイ
核酸の種類 DNA DNA DNA
マーカー数 固定マーカー：約660,000、カスタムマーカーアドオン容量最大50,000 654,027の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量： 最大100,000。  1,825,277の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量：最大175,000。
サンプル数 24サンプル （１アレイあたり） 24サンプル （１アレイあたり） アレイあたり8サンプル
サンプルスループット 1週間に約2,304サンプル（iScanシステム1台、AutoLoader1台、Tecanロボット2台、週5日勤務を想定）  1週間に約5,760サンプル 1週間に約1,728サンプル
対応サンプルタイプ 血液, FFPE組織 血液, FFPE組織, 口腔スワブ, 唾液 血液, FFPE組織, 口腔スワブ, 唾液
生物種カテゴリー ヒト ヒト ヒト
テクノロジー マイクロアレイ マイクロアレイ マイクロアレイ
バリアントクラス 1塩基変異多型（SNP）, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） 1塩基変異多型（SNP）, 構造バリアント, コピー数バリアント（CNV） 1塩基変異多型（SNP）, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 染色体変異, 構造バリアント, コピー数バリアント（CNV）

選択ツール：

ライブラリー調製とアレイキットセレクター

ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。

遺伝子パネルとアレイファインダー

目的の遺伝子（複数可）をターゲットとするシーケンスパネルまたはマイクロアレイを特定します。

DesignStudio Custom Assay Design Tool

DesignStudioは、研究者がカスタムジェノタイピングのマイクロアレイプローブやカスタムシーケンシングアッセイを設計・注文するためのウェブベースのアッセイ設計ツールです。

図

Infinium Asian Screening Arrayの臨床研究コンテンツ

コンテンツは、科学的に認知されたデータベースから専門的に選択され、臨床研究アプリケーションのための非常に有益なアレイを作成しました。バリアント数は2018年8月現在のものであり、変更される場合があります。

幅広いファーマコゲノミクスマーカー

臨床研究コンテンツには、CPIC1ガイドラインとPharmGKB2データベースに基づいて選択されたファーマコゲノミクスマーカーの広範なリストを掲載しています。マーカーは、PharmGKBデータベースで定義されたエビデンスのレベルに従って配置されます。VIP、非常に重要な薬理遺伝学。

Infinium Asian Screening Arrayの構築に使用される全ゲノムシーケンス

Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 BeadChipの構築に使用された全ゲノムシーケンスデータには、現在公開されている参照集団には含まれていない韓国、モンゴル、マレーシアのサンプルが含まれます。

集団 略号 コホート シーケンス深度
中国人 CHS-GIS Genomics Institute of Singapore 30回
南漢族中国人 CHS 1000G - Southern Han Chinese 2～4回
ダイ族中国人 CDX 1000G - Chinese Dai in Xishuangbanna 2～4回
漢族中国人 CBD 1000G - Bejing 2～4回
日本人 R-JAP1 RIKEN W13 15回
日本人 R-JAP2 RIKEN W1～6 30回
日本人 R-JAP3 RIKEN W18 >30回
日本人 K-JAP KYOTO 3～15回
日本人 JAP 1000G - Tokyo 2～4回
韓国人 M-KOR MACROGEN 15～30回
韓国人 KPGP The Personal Genome Project Korea (KPGP) ～35回
マレーシア人 MAL Singapore Population Health Study 30回
モンゴル人 MON MACROGEN 30回
ベトナム人 KVT 1000G - Kinh in Ho Chi Minh >2～4回

  1. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC). cpicpgx.org. 2016年10月にアクセス。

  2. PharmGKB, The Pharmacogenomics Knowledgebase. www.pharmgkb.org. 2017年1月にアクセス。

固定コンテンツ (3)

Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 Kit (48 samples)

20016317

アジアのスクリーニングアレイは、非常に経済的な遺伝的リスクスクリーニングのための汎用的な全ゲノムアレイです。各キットには、2つのBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 Kit (288 samples)

20016318

アジアのスクリーニングアレイは、非常に経済的な遺伝的リスクスクリーニングのための汎用的な全ゲノムアレイです。各キットには、12個のBeadChipと、288個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 Kit (1152 samples)

20016319

アジアのスクリーニングアレイは、経済的な遺伝子リスクスクリーニングのための汎用的な全ゲノムアレイです。各キットには48個のBeadChipと、1152個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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追加製品 (3)

Infinium Asian Screening Array-24+ v1.0 Kit (48 samples)

20016320

アジアのスクリーニングアレイは、経済的な遺伝子リスクスクリーニングのための汎用的な全ゲノムアレイです。各キットには、2つのBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Asian Screening Array-24+ v1.0 Kit (288 samples)

20016321

アジアのスクリーニングアレイは、経済的な遺伝子リスクスクリーニングのための汎用的な全ゲノムアレイです。各キットには、12個のBeadChipと、288個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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カスタマイズ

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Infinium Asian Screening Array-24+ v1.0 Kit (1152 samples)

20016322

アジアのスクリーニングアレイは、経済的な遺伝子リスクスクリーニングのための汎用的な全ゲノムアレイです。各キットには48個のBeadChipと、1152個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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カスタマイズ

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アクセサリー製品 (2)

Infinium FFPE QC Kit (384 reactions)

WG-321-1001

Infinium FFPE QC Kitは、Nextera Flex for Enrichmentを用いたFFPEサンプルの適格性確認に必要な付属製品です。別途、ライブラリー調製、濃縮、および濃縮プローブパネル、およびインデックスアダプターの試薬を注文する必要があります。

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Infinium HD FFPE DNA Restore Kit (24 samples)

WG-321-1002

損傷したFFPE DNAの復元に使用される新しい試薬の組み合わせを含みます。イルミナFFPE対応のInfinium BeadChipsを使用して、復元DNAのジェノタイピングを行い、高品質のデータを得ることができます。Infinium FFPE Restore Kitには、24のFFPE DNAサンプルを復元するのに十分な試薬が同梱されています。

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よくある質問（FAQ）

はい。FFPEサンプルは、Infinium FFPE QC KitおよびInfinium FFPE Restore Kitを使用して、Infinium Asian Screening Array -24 v1.0 BeadChipで実行できます。

iScan Systemのスキャンには1サンプルあたり2.5分かかります。

Infinium Asian Screening Array BeadChip Kitには、ハイスループットで合理化されたInfiniumワークフローを使用して、遺伝子バリアントを増幅、断片化、ハイブリダイゼーション、ラベリング、検出するためのBeadChipと試薬が含まれています。

Infinium Asian Screening Arrayには、ターゲットアレイのインピュテーションカバレッジと推定機能喪失のために、タグSNPによって選択された45,000を超えるバリアントを含むアジア発見パネルが含まれています。詳細については、データシートを参照してください。
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NovaSeq Xシリーズのご購入

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MiSeq Reagent Kit v2

MiSeqシステムのクラスター密度とリード長を増大させ、v1キットと比較してシーケンスクオリティスコアを向上させる試薬キットです。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。

Nextera XT DNA Library Preparation Kit

低DNAインプット要件で、小規模ゲノム、PCR アンプリコン、プラスミド、cDNA シーケンス用のDNAライブラリーを調整するための90分のワークフローを提供します。

Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8

このマイクロアレイで、先天性疾患、がん研究、ファーマコゲノミクス（PGx）、エクソームコンテンツに関連する臨床研究バリアントをプロファイルします。

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