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Infinium Asian Screening Array-24 Kit

東アジアの母集団における大規模な遺伝学的研究およびファーマコゲノミクスのための、強力で費用対効果の高いジェノタイピングマイクロアレイ。
Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 BeadChip

Infinium Asian Screening Array-24 Kit

東アジアの母集団における大規模な遺伝学的研究およびファーマコゲノミクスのための、強力で費用対効果の高いジェノタイピングマイクロアレイ。

1週間に約2,304サンプル（iScanシステム1台、AutoLoader1台、Tecanロボット2台、週5日勤務を想定） 

サンプルスループット

アレイあたり24サンプル

サンプル数

固定マーカー：約660,000、カスタムマーカーアドオン容量最大50,000

マーカー数

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概要

Infinium Asian Screening Array Kitには、東アジア母集団および東南アジア母集団における集団遺伝学的研究のための24サンプルBeadChipと試薬が含まれています。

  • 1,000ゲノムプロジェクトで少数派の集団のカバレッジを含む、> 9K000の全ゲノムシーケンスを含む東アジアのリファレンスパネルを使用

  • 最新の臨床研究および疾患関連コンテンツを含む

  • > 99%のコール率と> 99.9%の再現性で高いデータ品質を維持

専門家が厳選したコンテンツ

このマイクロアレイは、主要な機関とのコラボレーションにより設計されました。コンテンツには、臨床研究バリアントを用いたゲノムワイドなバックボーン、QCマーカー、発見パネル、およびカスタムアドオンコンテンツが含まれます。

幅広く採用

このマイクロアレイは、Infinium Global Screening Arrayの商業的成功を基盤としています。> イルミナInfiniumアレイの20Mサンプルが、ユーザーのグローバルコミュニティによって注文されています。 

ロバストでスケーラブル

ジェノタイピングとCNVコールは、複数のサンプルタイプ（唾液、血液、口腔綿棒、FFPEサンプルなど）に対応しています。ハイスループットのワークフローは、コスト、装置、ラボスペース、ハンズオンタイムを最小限に抑えながら、サンプル処理を最大化します。

オプションのアドオンとして、事前に設計されたブースターコンテンツを利用できます。

仕様

Assay type Infinium HTS
Automation capability Automated array loader, Liquid handling robot(s)
説明 東アジア母集団および東南アジア母集団における集団規模の遺伝学的研究、バリアントスクリーニング、プレシジョンメディシン研究に、高価値でスケーラブル、かつ費用対効果の高いソリューションを提供する先進的なジェノタイピングアレイ。 
インプット量 gDNA 200 ng
システム iScan
手法 High-throughput genotyping array, Genome-wide genotyping array
Nucleic acid type DNA
マーカー数 固定マーカー：約660,000、カスタムマーカーアドオン容量最大50,000
サンプル数 アレイあたり24サンプル
サンプルスループット 1週間に約2,304サンプル（iScanシステム1台、AutoLoader1台、Tecanロボット2台、週5日勤務を想定） 
Specialized sample types Blood, FFPE tissue
Species category ヒト
テクノロジー Microarray
バリアントクラス Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)

必要な製品

選択したキットサイズを一度にランするサンプル数に合わせます。各キットは1つのバッチとして処理され、複数の実験に分けられるように設計されていません。ロースループットバッチを複数処理する場合は、複数の小型キットを注文してください。

DesignStudioを使用してコンテンツをカスタマイズするか、コンソーシアムブースターとして利用可能なアドオンコンテンツのリストから選択できます。ブースターアドオンコンテンツは、複数の疾患マーカー（約5万SNP）でご利用いただけます。

在庫状況と価格については、担当営業にご確認ください。

Infinium FFPE QC KitおよびInfinium HD FFPE DNA Restore Kitはオプションですが、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）サンプルでInfinium Asian Screening Arrayを使用する場合に推奨されます。

/ 件

アプリケーション

Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 BeadChipは、疾患関連やリスクプロファイリング研究、ファーマコゲノミクス研究、疾患特性評価、ライフスタイルや健康特性評価、複雑な疾患におけるマーカー発見など、幅広い臨床研究およびバリアントスクリーニングのアプリケーションにおいて、東アジア母集団を対象とした費用対効果に優れたスケーラブルなゲノムスクリーニングを可能にします。

ワークフローの例

1
手法
2
スケールとプロセス
3
追跡、分析、およびレポート

関連するアプリケーションとメソッド

ハイスループットジェノタイピング

マイクロアレイを用いた大規模なジェノタイピングにより、大規模なコホートまたは母集団における疾患リスクに関連するバリアントを同定することができます。

ヒトのジェノタイピング

ヒトのジェノタイピングアレイは、何千ものサンプルを処理して、形質や疾患に関連するバリアントを特定するのに理想的です。

複雑な疾患と遺伝性疾患に関する研究

包括的なアレイおよび次世代シーケンサー（NGS）ソリューションにより、さまざまな遺伝性の複雑な疾患の研究を加速できます。

本製品の用途例

ドキュメント

製品資料
サポートドキュメント

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Infinium Asian Screening Array-24 Kit Infinium Global Screening Array-24 Kit Infinium Global Diversity Array-8 Kit
Assay type Infinium HTS Infinium HTS Infinium LCG
Automation capability Automated array loader, Liquid handling robot(s) Automated array loader, Liquid handling robot(s) Automated array loader, Liquid handling robot(s)
説明 東アジア母集団および東南アジア母集団における集団規模の遺伝学的研究、バリアントスクリーニング、プレシジョンメディシン研究に、高価値でスケーラブル、かつ費用対効果の高いソリューションを提供する先進的なジェノタイピングアレイ。  Infinium Global Screening Array-24 Kitは、最適化された多民族ゲノムワイドコンテンツ、キュレーションされた臨床研究バリアント、およびQCマーカーを組み合わせることで、集団規模の遺伝学、トランスレーショナル研究、バリアントスクリーニング研究、プレシジョンメディシン研究を可能にする経済的な次世代ジェノタイピングアレイです。 8サンプルのInfinium Global Diversity Arrayは、ゲノム全体で4,800を超える重要な遺伝子のターゲットカバレッジを提供します。BeadChipには約180万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能1.5 Mbを提供します。
インプット量 gDNA 200 ng 200 ng DNA 200 ng DNA
システム iScan iScan iScan
手法 High-throughput genotyping array, Genome-wide genotyping array High-throughput genotyping array, Genome-wide genotyping array Genome-wide genotyping array
Nucleic acid type DNA DNA DNA
マーカー数 固定マーカー：約660,000、カスタムマーカーアドオン容量最大50,000 654,027の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量： 最大100,000。  1,825,277の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量：最大175,000。
サンプル数 アレイあたり24サンプル アレイあたり24サンプル アレイあたり8サンプル
サンプルスループット 1週間に約2,304サンプル（iScanシステム1台、AutoLoader1台、Tecanロボット2台、週5日勤務を想定）  1週間に約5,760サンプル 1週間に約1,728サンプル
Specialized sample types Blood, FFPE tissue Blood, FFPE tissue, Buccal swabs, Saliva Blood, FFPE tissue, Buccal swabs, Saliva
Species category ヒト ヒト ヒト
テクノロジー Microarray Microarray Microarray
バリアントクラス Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Structural variants, Copy number variants (CNVs)

選択ツール

ライブラリー調製とアレイキットセレクター

ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。

遺伝子パネルとアレイファインダー

目的の遺伝子（複数可）をターゲットとするシーケンスパネルまたはマイクロアレイを特定します。

DesignStudioカスタムアッセイデザインツール

DesignStudioは、研究者がカスタムジェノタイピングのマイクロアレイプローブやカスタムシーケンシングアッセイを設計・注文するためのウェブベースのアッセイ設計ツールです。

図

Infinium Asian Screening Arrayの臨床研究コンテンツ

コンテンツは、科学的に認知されたデータベースから専門的に選択され、臨床研究アプリケーションのための非常に有益なアレイを作成しました。バリアント数は2018年8月現在のものであり、変更される場合があります。

幅広いファーマコゲノミクスマーカー

臨床研究コンテンツには、CPIC1ガイドラインとPharmGKB2データベースに基づいて選択されたファーマコゲノミクスマーカーの広範なリストを掲載しています。マーカーは、PharmGKBデータベースで定義されたエビデンスのレベルに従って配置されます。VIP、非常に重要な薬理遺伝学。

Infinium Asian Screening Arrayの構築に使用される全ゲノムシーケンス

Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 BeadChipの構築に使用された全ゲノムシーケンスデータには、現在公開されている参照集団には含まれていない韓国、モンゴル、マレーシアのサンプルが含まれます。

集団 略語 コホート シーケンス深度
中国語 CHS-GIS シンガポールゲノミクス研究所 30×
南漢族中国人 CHS 1000G - 南漢族中国人 2～4倍
中国ダイ CDX 1000G - Xishuangbannaの中国ダイ 2～4倍
漢族中国人 CBD 1000G - 北京 2～4倍
日本語 R-JAP1 リケン W13 15×
日本語 R-JAP2 リケン W1～6 30×
日本語 R-JAP3 リケン W18 >30×
日本語 K-JAP 京都 3～15倍
日本語 JAP 1000G - 東京 2～4倍
韓国語 M-KOR マクロゲン 15～30×
韓国語 KPGP パーソナルゲノムプロジェクト韓国（KPGP） ～35倍
マレーシア語 メリーランド州 シンガポールの集団健康調査 30×
モンゴル語 月 マクロゲン 30×
ベトナム語 KVT 1000G - 錫錫錫 >2～4×

  1. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC). cpicpgx.org. 2016年10月にアクセス。

  2. PharmGKB、ファーマコゲノミクス知識ベース。www.pharmgkb.org. 2017年1月にアクセス。

固定コンテンツ (3)

Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 Kit (48 samples)

20016317

アジアのスクリーニングアレイは、非常に経済的な遺伝的リスクスクリーニングのための汎用的な全ゲノムアレイです。各キットには、2つのBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 Kit (288 samples)

20016318

アジアのスクリーニングアレイは、非常に経済的な遺伝的リスクスクリーニングのための汎用的な全ゲノムアレイです。各キットには、12個のBeadChipと、288個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 Kit (1152 samples)

20016319

アジアのスクリーニングアレイは、経済的な遺伝子リスクスクリーニングのための汎用的な全ゲノムアレイです。各キットには48個のBeadChipと、1152個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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追加製品 (3)

Infinium Asian Screening Array-24+ v1.0 Kit (48 samples)

20016320

アジアのスクリーニングアレイは、経済的な遺伝子リスクスクリーニングのための汎用的な全ゲノムアレイです。各キットには、2つのBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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カスタマイズ

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Infinium Asian Screening Array-24+ v1.0 Kit (288 samples)

20016321

アジアのスクリーニングアレイは、経済的な遺伝子リスクスクリーニングのための汎用的な全ゲノムアレイです。各キットには、12個のBeadChipと、288個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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カスタマイズ

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Infinium Asian Screening Array-24+ v1.0 Kit (1152 samples)

20016322

アジアのスクリーニングアレイは、経済的な遺伝子リスクスクリーニングのための汎用的な全ゲノムアレイです。各キットには48個のBeadChipと、1152個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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カスタマイズ

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アクセサリー製品 (2)

Infinium FFPE QC Kit (384 reactions)

WG-321-1001

Infinium FFPE QC Kitは、Nextera Flex for Enrichmentを用いたFFPEサンプルの適格性確認に必要な付属製品です。別途、ライブラリー調製、濃縮、および濃縮プローブパネル、およびインデックスアダプターの試薬を注文する必要があります。

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Infinium HD FFPE DNA Restore Kit (24 samples)

WG-321-1002

損傷したFFPE DNAの復元に使用される新しい試薬の組み合わせを含みます。イルミナFFPE対応のInfinium BeadChipsを使用して、復元DNAのジェノタイピングを行い、高品質のデータを得ることができます。Infinium FFPE Restore Kitには、24のFFPE DNAサンプルを復元するのに十分な試薬が同梱されています。

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よくある質問（FAQ）

はい。FFPEサンプルは、Infinium FFPE QC KitおよびInfinium FFPE Restore Kitを使用して、Infinium Asian Screening Array -24 v1.0 BeadChipで実行できます。

iScan Systemのスキャンには1サンプルあたり2.5分かかります。

Infinium Asian Screening Array BeadChip Kitには、ハイスループットで合理化されたInfiniumワークフローを使用して、遺伝子バリアントを増幅、断片化、ハイブリダイゼーション、ラベリング、検出するためのBeadChipと試薬が含まれています。

Infinium Asian Screening Arrayには、ターゲットアレイのインピュテーションカバレッジと推定機能喪失のためにタグSNPによって選択された> 45K000バリアントのアジアの発見パネルが含まれています。詳細については、データシートを参照してください。
/ 件

NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v2

MiSeqシステムのクラスター密度とリード長を増大させ、v1キットと比較してシーケンスクオリティスコアを向上させる試薬キットです。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを準備するための、高速で統合されたワークフロー。

Nextera XT DNA Library Preparation Kit

低DNAインプット要件で、小規模ゲノム、PCR アンプリコン、プラスミド、cDNA シーケンス用のDNAライブラリーを調整するための90分のワークフローを提供します。

Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8

このマイクロアレイで、先天性疾患、がん研究、ファーマコゲノミクス（PGx）、エクソームコンテンツに関連する臨床研究バリアントをプロファイルします。

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