製品

Infinium CytoSNP-850K BeadChip

コンソーシアムで構築された一塩基多型ベース（SNP）のマイクロアレイで、体質研究やがん研究のために細胞遺伝学的に関連する3,262の遺伝子の包括的なカバレッジを提供します。

iScanシステムで週960サンプル（自動化、24 BeadChip/バッチ、2バッチ/FTE/Tecan/週）。 NextSeq 550システムで週128サンプル（8 BeadChip/バッチ、2バッチ/FTE/Tecan/週）。

サンプルスループット

アレイあたり8サンプル

サンプル数

固定マーカー：~848,000 カスタムマーカーアドオン容量：なし

マーカー数

仕様タブで詳細を確認する

概要

Infinium CytoSNP-850K BeadChipは、SNPベースのヒトマイクロアレイで初めて、細胞ゲノム研究のために国際コミュニティからの最新の情報を活用しました。

主な特長

  • 15倍の冗長性を持つ約850K SNPを含む徹底的なカバレッジ、および3,262の用量感受性遺伝子の包括的カバレッジ

  • ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）を含む幅広いサンプルタイプで再現可能なデータ

  • 強力な解析ソフトウェアが、データを解析するための統合フレームワークを提供します

専門家の情報に基づいた包括的なカバレッジ

遺伝子リストは、「臨床ゲノミクスのための国際協力（ICCG）1」および「がんゲノミクスコンソーシアム（CGC）2」のコンテンツに基づいて定義され、細胞ゲノム活性の全体像を提供します。 

低レベルモザイクの高検出感度

SNPターゲットに対して高い特異性を持つ長い50-merプローブを使用すると、低レベルのモザイクに対する感度が向上し3、コピー数中立のヘテロ接合性欠失（LOH）に対する高解像度が得られます。15倍の高いビーズ冗長性により、ゲノム全体にわたって正確なコピー数バリアント（CNV）およびヘテロ接合性の欠如（AOH）コールを行うためのSignal to Noise比（SN比）が向上します。

マニフェスト（アレイコンテンツ）ファイルの表示

仕様

Assay type Infinium HD Super
Automation capability Liquid Handling Robots, Automated Array Loader
Cancer type Hematologic, Solid Tumor
Method Genome-Wide Genotyping Array, Cytogenomic Array
Specialized sample types FFPE Tissue, Blood, Saliva
Variant class Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs)
アッセイ時間 3日
インプット量 200 ng DNA
サンプルスループット

iScanシステムで週960サンプル（自動化、24 BeadChip/バッチ、2バッチ/FTE/Tecan/週）。

NextSeq 550システムで週128サンプル（8 BeadChip/バッチ、2バッチ/FTE/Tecan/週）。
サンプル数 アレイあたり8サンプル
システム NextSeq 550 Desktop Sequencer, iScan
テクノロジー Microarray
ハンズオンタイム

自動8ビーズチップワークフロー1時間5分、手動8ビーズチップワークフロー6時間15分
マーカー数 固定マーカー：~848,000
カスタムマーカーアドオン容量：なし
核酸の種類 DNA
生物種 ヒト
説明 Infinium CytoSNP-850K BeadChipは、既知の細胞遺伝学的に重要な3,262の遺伝子疾患に焦点を当てたカバレッジを通して、重要な染色体異常を発見するための高解像度解析を可能にします。

必要な製品

選択したキットサイズを一度にランするサンプル数に合わせます。各キットは1つのバッチとして処理され、複数の実験に分けられるように設計されていません。ロースループットバッチを複数処理する場合は、複数の小型キットを注文してください。

/

アプリケーション

Infinium CytoSNP-850K BeadChipマイクロアレイには、ゲノムにまたがる約85万のSNPが含まれており、既知の関連性のある3,262の遺伝子を網羅し、研究者が体質やがんのアプリケーションに対する染色体異常の影響を研究できるようにします。

ワークフローの例

1
アレイを選択

Infinium CytoSNP-850K BeadChip

2
アレイの処理とスキャン
3
解析

主なアプリケーションノート

Infinium CytoSNP-850K v1.1 BeadChipによるFFPE組織検体の解析
高解像度一塩基多型アレイによる細胞遺伝学的解析

関連するアプリケーションとメソッド

細胞遺伝学

マイクロアレイとシーケンスを含む染色体異常解析のためのイルミナ細胞遺伝学研究ポートフォーリオ

体質性細胞遺伝子の染色体マイクロアレイ解析

染色体マイクロアレイは、体質性疾患に関連するコピー数とアリル寄与の不均衡を高い信頼性で検出します。

がん研究

イルミナのがん研究向けNGSとマイクロアレイテクノロジーが、がんゲノム分野における革新を牽引します。

本製品の用途例
アレイからNGSへ：構造から疾患まで、染色体遺伝学はどのように進化してきたか
英国の研究所では、SNPアレイを使用して細胞遺伝学的分析を促進し、強化しています
細胞遺伝学検査は、不育症に関する洞察を提供します

ドキュメント

製品資料
Support documentation

比較する

Infinium CytoSNP-850K BeadChip Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8 Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24
Assay type Infinium HD Super
Specialized sample types Blood, Saliva Blood, FFPE Tissue, Buccal Swabs, Saliva Blood, FFPE Tissue, Buccal Swabs, Saliva
アッセイ時間 3日 3日 3日
インプット量 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng DNA
サンプルスループット

iScanシステムで週960サンプル（自動化、24 BeadChip/バッチ、2バッチ/FTE/Tecan/週）。

NextSeq 550システムで週128サンプル（8 BeadChip/バッチ、2バッチ/FTE/Tecan/週）。
サンプル数 アレイあたり8サンプル アレイあたり8サンプル アレイあたり24サンプル
ハンズオンタイム

自動8ビーズチップワークフロー1時間5分、手動8ビーズチップワークフロー6時間15分

 8ビーズチップワークフローの自動化に1時間5分 8ビーズチップワークフローの自動化に1時間5分
マーカー数 固定マーカー：~848,000
カスタムマーカーアドオン容量：なし
説明 Infinium CytoSNP-850K BeadChipは、既知の細胞遺伝学的に重要な3,262の遺伝子疾患に焦点を当てたカバレッジを通して、重要な染色体異常を発見するための高解像度解析を可能にします。 8サンプルのInfinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8は、ゲノム全体で4,800を超える主要な遺伝子を広範囲にターゲットとしています。BeadChipには約180万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能1.5 Mbを提供します。 24サンプルのInfinium Global Screening Array with Cytogenetics-24は、ゲノム全体で4,800を超える重要な遺伝子をターゲットとしています。BeadChipには約70万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能2.5 Mbを提供します。

選択ツール：

ライブラリー調製とアレイキットセレクター

ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。

図

Infinium CytoSNP-850K BeadChipカバレッジ

Infinium CytoSNP-850K BeadChipには、ゲノム全体にわたる約850Kの実験的に選択された一塩基多型（SNP）が含まれています。この高密度SNPにより、意義のある染色体異常を発見するための高解像度解析が可能となります。

プローブ間隔 平均距離
ターゲット領域プローブ間隔
 約1 kb
ターゲット領域の解像度
 約10 kb
ゲノムバックボーンプローブ間隔
 約5 kb
全体的なプローブ間隔
 約1.8 kb
全体的な有効分解能
 約18 kb

Infinium CytoSNP-850K BeadChipマーカー情報a

マーカーカテゴリーb iScanシステム
マーカーの総数
 848,902
RefSeq遺伝子
 467,422
RefSeq +/- 10 kb
 541,515
ADME遺伝子
 15,153
ADME +/- 10 kb
 18,590
COSMIC遺伝子
 418,131
HLAマーカー
 5145
HLA遺伝子
 276
GO遺伝子
 137,873
エクソン領域
 68,801
プロモーター領域
 26,814
X染色体マーカー
 29,894
Y染色体マーカー
 1197
PAR/相同マーカー
 728

a. 値はアッセイマニフェストファイルから取得されます。バリエーションは、装置ごとにBeadChipを処理するために必要な異なるマニフェスト/製品ファイルによるものです。

b. ヒトゲノムの問題であるhg19リファレンスゲノムと比較。略語：ADME＝吸着、分布、代謝、排泄　COSMIC＝がんにおける体細胞変異のカタログ　MHC＝主要組織適合性複合体　HLA＝ヒト白血球抗原　PAR＝偽常染色体領域

リソース

サムネール

Infinium Arrayによる進歩を祝う

ターゲットゲノム研究や全ゲノム研究において、卓越したデータ品質と高密度ゲノムカバレッジを実現するように設計されたInfiniumマイクロアレイ製品の包括的なスイートについてご覧ください。

Infinium CytoSNP-850K v1.4 Beadchip Kit (8 Samples)

20103480

体質およびがん細胞遺伝学アプリケーション向けに最適化。BeadChipは、8つのサンプルを処理し、コピー数バリアント（CNVS）とヘテロ接合性の欠如（AOH）の両方について850,000の一塩基多型（SNP）を解析できます。各パッケージには、1つのBeadChipと、8つのDNAサンプルのCNVおよびAOHの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Infinium CytoSNP-850K v1.4 Beadchip Kit (16 Samples)

20103481

体質およびがん細胞遺伝学アプリケーション向けに最適化。BeadChipは、8つのサンプルを処理し、コピー数バリアント（CNVS）とヘテロ接合性の欠如（AOH）の両方について850,000の一塩基多型（SNP）を解析できます。各パッケージには、2つのBeadChipと、16のDNAサンプルのCNVおよびAOHの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Infinium CytoSNP-850K v1.4 Beadchip Kit (48 Samples)

20103482

体質およびがん細胞遺伝学アプリケーション向けに最適化。BeadChipは、8つのサンプルを処理し、コピー数バリアント（CNVS）とヘテロ接合性の欠如（AOH）の両方について850,000の一塩基多型（SNP）を解析できます。各パッケージには、6つのBeadChipと、48のDNAサンプルのCNVおよびAOHの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Infinium CytoSNP-850K v1.4 Beadchip Kit (96 Samples)

20103483

体質およびがん細胞遺伝学アプリケーション向けに最適化。BeadChipは、8つのサンプルを処理し、コピー数バリアント（CNVS）とヘテロ接合性の欠如（AOH）の両方について850,000の一塩基多型（SNP）を解析できます。各パッケージには、12のBeadChipと、96のDNAサンプルのCNVおよびAOHの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

表示されている結果 : /

選択中の製品一覧

製品名

数量

Unit Price

合計 ( 製品)

製品はまだ選択されていません

選択したこれらの製品が失われないように、ページを離れる前にカートに追加してください。

よくある質問（FAQ）

FFPEサンプルは、Infinium FFPE QC KitおよびInfinium FFPE Restore Kitを使用してCytoSNP-850Kでランできます。

FFPE固有のマニフェストおよびクラスターファイルは、CytoSNP-850Kサポートページからダウンロードできます。

バッチインポートファイルは、CytoSNP-850K Lab Plannerツールを使用して作成できます。バッチインポート.txtファイルが生成されたら、「File|Batch|Batch Import」に移動し、バッチインポートファイルを見つけてから、「Open」をクリックします。

詳細については、BlueFuse Multi Software GuideのImport 24sureとBeadArray Experimentsセクションをご覧ください。 

/

NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

TruSight One Sequencing Panel

高い解析感度と特異性でエクソームの疾患関連領域をターゲットにする包括的なシーケンス研究パネルです。

Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit

CpGアイランド、遺伝子、エピゲノムワイド関連解析用エンハンサーを広範囲にカバーする頑強なメチル化プロファイルマイクロアレイ。

参考文献 

1. 臨床ゲノムリソース。www.clinicalgenome.org. 2022年12月12日にアクセス。

2. Cancer Genomics Consortium. www.cancergenomics.org. 2022年12月12日にアクセス。

3. Conlin LK, Thiel BD, Bonnemann CG, et al. Mechanisms of mosaicism, chimerism and uniparental disomy identified by single nucleotide polymorphism array analysis. Hum Mol Genet. 2010;19(7):1263-75. doi: 10.1093/hmg/ddq003.

製品情報のリクエスト

当社の製品およびサービスに関する情報、または当社のテクノロジーに関するご質問がございましたら、ぜひお問い合わせください。