ターゲットエンリッチメント
ターゲットエンリッチメントとは。
ターゲットリシーケンスでは、ゲノムの遺伝子または領域のサブセットが分離され、シーケンスされます。ターゲットエンリッチメントは、ターゲットに特異的なビオチン化プローブとのハイブリダイゼーションにより、ゲノム関心領域を捕捉し、磁気プルダウンにより分離することにより行われます。
Illumina DNA Prep with Enrichmentは、次世代シーケンサー（NGS）ターゲットエンリッチメントソリューションの最新のイノベーションです。ビーズ結合トランスポソームによるタグメンテーションケミストリーとハイブリッドキャプチャーによるターゲットエンリッチメントを組み合わせることで、研究者はワークフロータイムを短縮し、ターゲットエンリッチメントリシーケンスのための正確で信頼性の高いアッセイを作り出すことができます。
NGSターゲットエンリッチメントのメリット
ハイブリダイゼーションによるエンリッチメントは、特定のサンプル中における、特定の遺伝子バリアントの分析に有効な戦略です。
ターゲットエンリッチメントにより、研究者は堅牢で分かりやすいワークフローを使用して、エクソームや多数の遺伝子（例：50個超の遺伝子）を確実にシーケンスすることが可能になります。幅広いインプットの種類と量に対応し、信頼性の高い結果を提供します。用途は以下のとおりです。
- ヒト全エクソームシーケンス
- がんおよび遺伝性疾患研究用の設計済み（固定）シーケンスパネル
- カスタムゲノムシーケンス
ターゲットエンリッチメントとその他のリシーケンス戦略の比較
ハイブリッドキャプチャーによるターゲットエンリッチメントにより、研究者は特定の研究テーマに関連するゲノムの領域をターゲットにすることができます。ターゲットリシーケンスは、PCRやサンガーシーケンスよりも高い発見力（新規バリアントを同定する能力）と高い変異分解能を提供します。
PCRベースのアンプリコンシーケンスと比較して、ハイブリダイゼーションによるエンリッチメントシーケンスは、より多くの全遺伝子量を対象とし、すべてのバリアントタイプのプロファイリングをより包括的にサポートすることができます。遺伝子総量が多いほど、既知のバリアントと新規のバリアントの両方の特性を評価し、探索関連のアプリケーションを利用することができます。
アンプリコンシーケンスと比較したターゲットエンリッチメントの利点*
ターゲットエンリッチメント |
アンプリコンシーケンス |
| 大きな遺伝子構成、通常は50個超の遺伝子 | 小さな遺伝子構成、通常は50個未満の遺伝子 |
| すべてのバリアントタイプを対象とした、より包括的なプロファイリング | 1塩基変異（SNV）と挿入・欠失（Indel）の解析に理想的 |
| より包括的な手法だが、ハンズオンタイムとターンアラウンドタイム**が長い | より手頃な価格で、より簡単なワークフロー |
* 社内データ、イルミナ 2018年
** ターンアラウンドタイムは、ライブラリー調製アッセイタイム（DNAからライブラリーの終了まで）が対象です。
COVID-19NGSソリューション
次世代シーケンサー（NGS）は、感染症サーベイランスや感染拡大モデルにおいてユニークな位置づけにあります。ターゲットエンリッチメントを、ショットガンメタゲノミクスなど他の病原体NGS法と比較する。SARS-CoV2の検出、感染経路の追跡、複数感染の調査およびウイルスの進化を調査するためのソリューションを見つける。
推奨されるターゲットエンリッチメントワークフロー
ユーザーフレンドリーなオートメーション対応ワークフローは、研究者に迅速かつ柔軟なソリューションを提供します。ビーズ上でのタグメンテーションケミストリーは、幅広いDNAインプット量、様々なサンプルサイズ、および幅広いアプリケーションに対応することができます。
主な製品
NextSeq 1000 & 2000 Systems
Groundbreaking benchtop sequencers allow you to explore new discoveries across a variety of current and emerging applications, with higher efficiency and fewer restraints.
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Nextera Flex for Enrichment
A fast, integrated workflow for a wide range of applications providing targeted resequencing for custom panels, fixed panels, and whole-exome enrichment.
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BaseSpace Sequence Hub
Data management and simplified bioinformatics for labs getting started and for rapidly scaling next-generation sequencing (NGS) operations.
Learn More主な感染性疾患ターゲットエンリッチメントソリューション
呼吸器ウイルスオリゴパネル
SARS-CoV-2や最近のインフルエンザ株を含む一般的な呼吸器系ウイルスを、包括的かつ迅速なターゲットエンリッチメントシーケンスにより高感度に検出し、その特性を明らかにします。
呼吸器病原体ID/AMRパネル
このNGSベースのターゲットエンリッチメントワークフローは、呼吸器系病原体や抗菌薬耐性アリルをターゲットとし、IDbyDNAによる簡便なデータ解析を提供します。
SNPおよびSNVのジェノタイピング
一塩基多型（SNP）とバリアントを検出する手法を比較しながら、ニーズに最適なアプローチを決定します。サイエンティストがバリアントを機能に結び付け、疾患の生物学的側面の貴重な洞察を得る能力をどのように加速しているかを学びましょう。
補足資料
Library Prep and Array Kit Selector
Find the right sequencing library preparation kit or microarray for your needs.