ヒトゲノムのマッピング困難な領域に対処するための、費用効率に優れ、柔軟性のある、ターゲット化したロングリードソリューション。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
Illumina Complete Long Read with Enrichment, Humanは、低インプットDNAからの高精度で費用効果の高いターゲット化したロングリードを可能にします。このライブラリー調製キットは、ロングリードを利用することで費用効果の高い洞察をもたらし、標準的なショートリード全ゲノムをターゲット化したロングリードパネルで補完することで、最大限の価値を提供します。備考：解析には、ターゲット化したロングリードを補完するために、同じサンプルから得られた30倍以上の標準的なショートリードWGSデータが必要です。
| アッセイ時間 | 約2日 |
|---|---|
| 説明 | 柔軟性と費用対効果の高いターゲットロングリードとショートリードデータの組み合わせた高精度WGS。事前に設計されたパネルまたはカスタムパネルと組み合わせて、ゲノムのマッピングが困難な領域を解決するか、関心領域に段階的シーケンスを追加します。 |
| ハンズオンタイム | ～6時間 |
| インプット量 | 50 ng DNAを推奨。最低10 ng DNA |
| システム | NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム |
| 手法 | カスタムシーケンス, ターゲットDNAシーケンス, ロングリードシーケンス, フェージングシーケンス, 全ゲノムシーケンス, ターゲット濃縮 |
| マルチプレックス | レーンあたり最大384サンプル（パネルのターゲットサイズとシーケンス出力によって異なります） |
| 核酸の種類 | DNA |
| 反応数 | 24または96回 |
| 対応サンプルタイプ | 血液, FFPE非対応, 唾液 |
| 生物種カテゴリー | ヒト |
| ターゲットインサートサイズ | インサートサイズ：500～700 bp、リード長：N50 5～7 kb |
| テクノロジー | シーケンス |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） |
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Humanには、ターゲット化したロングリードライブラリーを生成するためのコア試薬が含まれています。濃縮用のプローブパネルをご購入ください。DesignStudioカスタムアッセイ設計ツールで既製のHuman Comprehensive Panel（別売りまたはキットの一部として購入可能）、または設計済みパネルもしくはカスタムパネルのいずれかとなります。
どのアクセサリーが必要ですか？
スループットに基づいたデータストレージと解析のニーズを満たすために、イルミナのユニークデュアルインデックスと十分なiCreditが必要になります。
Illumina Complete Long Read with Enrichment解析には、同じサンプルからの標準的なショートリード30倍以上の全ゲノムライブラリーが必要です。Illumina DNA PCR-Free Prepは、標準的なショートリード全ゲノムのライブラリー調製に推奨されます。サードパーティ製WGSキットにも互換性があります。マークされていないライブラリーは、並行して調製またはシーケンスする必要はありません。以前にアッセイしたサンプルからのFASTQファイルを使用できます。
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human
カスタムパネル
DRAGEN ICLR (Illumina Complete Long Read) with Enrichmentアプリ
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NovaSeq 6000システム | ヒト包括的パネル：S4フローセルあたり24サンプル 大型パネル（15～25 Mb）：S4フローセルあたり約75サンプル 中型パネル（5～15 Mb）：S4フローセルあたり約187サンプル 小型パネル（> 5 Mb）：S4フローセルあたり約375サンプル |
2 × 150 |
| NovaSeq Xシステム | ヒト包括的パネル：10Bフローセルあたり24サンプル、25Bフローセルあたり64サンプル 大型パネル（15～25 Mb）：10Bフローセルあたり約75サンプル、25Bフローセルあたり約200サンプル 中型パネル（5～15 Mb）：10Bフローセルあたり約187サンプル、25Bフローセルあたり約500サンプル 小型パネル（> 5 Mb）：10Bフローセルあたり約375サンプル、25Bフローセルあたり約1000サンプル |
2 × 150 |
| NextSeq 2000システム | ヒト包括的パネル：P3フローセルあたり3サンプル 大型パネル（15～25 Mb）：P3フローセルあたり約9サンプル 中型パネル（5～15 Mb）：P3フローセルあたり約22サンプル 小型パネル（> 5 Mb）：P3フローセルあたり約45サンプル |
2 × 150 |
ヒト全ゲノムシーケンスは、私たちをユニークな存在にしている複雑な遺伝性バリアントを、最も詳しく知ることができるものです。
大規模全ゲノムシーケンスは、疾患研究および集団ゲノム研究に役立ち、疾患関連アリルを明らかにします。
Illumina Complete Long Read技術は、1台の装置で高精度のロングリードとショートリードシーケンスを可能にする、新しい高性能アッセイのポートフォリオの構築を実現します。
| Illumina Complete Long Read with Enrichment, Human | Illumina Complete Long Read Prep, Human | Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment | Illumina DNA PCR-Free Prep | |
|---|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | 約2日 | 約7.5～8.5時間 | 6.5時間 | ～1.5時間 |
| 説明 | 柔軟性と費用対効果の高いターゲットロングリードとショートリードデータの組み合わせた高精度WGS。事前に設計されたパネルまたはカスタムパネルと組み合わせて、ゲノムのマッピングが困難な領域を解決するか、関心領域に段階的シーケンスを追加します。 | Illumina Complete Long Read Prep, Humanは、既存のIllumina NovaSeqプラットフォームを使用して、ロングリードヒト生殖細胞系列の全ゲノムシーケンスを実行します。 | 費用対効果と信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスのための最新のエクソームコンテンツの集中エンリッチメントプローブパネルを備えた、エンリッチメントワークフローによる高速で使いやすいライブラリー調製。 | PCRフリーケミストリーとオンビーズタグメンテーションのユニークな組み合わせを使用して、高感度アプリケーション用のシーケンスライブラリーを調製します。これにより、PCRによるバイアスを排除すると同時に、ライブラリー調製の合計時間が90分に短縮されます。 |
| ハンズオンタイム | ～6時間 | 5～6時間（PCRおよびQCを含む） | ～2時間 | ～45分 |
| インプット量 | 50 ng DNAを推奨。最低10 ng DNA | DNA 50 ng推奨 | 50～1,000 ngの高品質ゲノムDNA（直接血液および唾液については、リファレンスガイドを参照） | 25 ng 〜 300 ng |
| システム | NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム | NovaSeq 6000Dx システム, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム | NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, MiSeqDx システム 研究（RUO）モード, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500システム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム |
| 手法 | カスタムシーケンス, ターゲットDNAシーケンス, ロングリードシーケンス, フェージングシーケンス, 全ゲノムシーケンス, ターゲット濃縮 | ロングリードシーケンス, 全ゲノムシーケンス | ターゲットDNAシーケンス, エクソームシーケンス, ターゲット濃縮 | de novoシーケンス, 全ゲノムシーケンス |
| マルチプレックス | レーンあたり最大384サンプル（パネルのターゲットサイズとシーケンス出力によって異なります） | 最大48 | 最大12プレックスの濃縮前プーリングをテスト。キット構成は、最大192サンプルのマルチプレックスをサポートします。最大384まで可能です。 | 最大384プレックス |
| 核酸の種類 | DNA | DNA | DNA | DNA |
| 反応数 | 24または96回 | 8または24 | ||
| 対応サンプルタイプ | 血液, FFPE非対応, 唾液 | 血液, FFPE非対応, 少量インプットサンプル, 唾液 | 血液, 唾液 | 血液, FFPE非対応, 少量インプットサンプル, 唾液, FFPE非対応 |
| 生物種カテゴリー | ヒト | ヒト | ヒト | すべて, ヒト |
| ターゲットインサートサイズ | インサートサイズ：500～700 bp、リード長：N50 5～7 kb | 500～700 bp | 450 bp +/- 75 bp | |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス | シーケンス |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） | ショートタンデムリピート（STR）, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel） | 1塩基変異多型（SNP）, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 生殖細胞系列バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） | ショートタンデムリピート（STR）, 1塩基変異多型（SNP）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） |
ターゲット化したロングリードで困難な領域での精度を向上
（A）Human Comprehensive Panelまたは（B）CMRG PanelがターゲットとするHG002遺伝子領域の一塩基多型（SNP）およびIndelに対する偽陰性（FN）および偽陽性（FP）バリアントコールを、Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment（オレンジ）を使用して、標準的なショートリードWGS（青）と比較します。
困難な領域の費用効果の高いヒト全ゲノムカバレッジ
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Humanは、困難な遺伝子領域のカバレッジを強化し、標準的なショートリードヒトWGSを補完します。標準的なショートリードWGSおよびIllumina Complete Long Read with Enrichmentを使用してシーケンスしたRHCEのIGVプロット。ターゲット領域は赤色で示されています。
多型遺伝子のハプロタイプ解決に役立つターゲット化したロングリード
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Humanを使用したロングリードシーケンスからのIGVプロット。MHC座位の722 kb領域でのフェージング。580 kb領域（ピンク）は、1つのフェージングブロックに封入されています。
多型遺伝子のハプロタイプ解決に役立つターゲット化したロングリード
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Humanを使用したロングリードシーケンスからのIGVプロット。HLA-C遺伝子は完全にフェージングされています。リードはハプロタイプで区切られています。
Illumina Complete Long Read技術は、1台の装置で高精度のロングリードとショートリードシーケンスを可能にする、新しい高性能アッセイのポートフォリオの構築を実現します。
Illumina Complete Long Read：複雑なゲノムからの希少疾患に関する洞察
このプレゼンテーションでは、Complete Long Readのユースケースを共有し、世界中のコラボレーターが行っている研究に焦点を当てます。
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human (24 samples)
20113832
A library preparation and enrichment solution for long-read human whole- genome sequencing (WGS) applications
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human (96 samples)
20113833
A library preparation and enrichment solution for long-read human whole- genome sequencing (WGS) applications.
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human Comprehensive Panel (24 samples)
20113834
ロングリードヒト全ゲノムシーケンス（WGS）アプリケーションに役立つ領域に対応するように設計されたプローブパネルを備えたライブラリー調製および濃縮ソリューション。
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human Comprehensive Panel (96 samples)
20113835
ロングリードヒト全ゲノムシーケンス（WGS）アプリケーションに役立つ領域に対応するように設計されたプローブパネルを備えたライブラリー調製および濃縮ソリューション。
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, HCP-24, S4 Starter Pack
20113838
This package contains 1 ICLR ENR-24 sample kit, 1 HCP-24, 1 NovaSeq 6000 S4 (300) cyc kits, and support 24 analyses
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, HCP-24, 10B Starter Pack
20113839
This package contains 1 ICLR ENR-24 sample kit, 1 HCP-24, 1 NovaSeq X 10B (300) cyc kit, and support for 24 analyses
Illumina Human Comprehensive Panel (24 samples)
20113836
ロングリード全ゲノムシーケンス（WGS）アプリケーションに役立つヒトゲノムの領域をターゲット化するためにデザインされたハイブリダイゼーションキャプチャープローブパネル。
Illumina Human Comprehensive Panel (96 samples)
20113837
ロングリード全ゲノムシーケンス（WGS）アプリケーションに役立つヒトゲノムの領域をターゲット化するためにデザインされたハイブリダイゼーションキャプチャープローブパネル。
Illumina Unique Dual Indexes, LT (48 indexes, 48 samples)
20098166
Illumina Unique Dual Indexes, LT (48 indexes, 48 samples)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 1 iCredit
20042038
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics Starter Pack - 1,000 iCredits
20042039
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 5,000 iCredits
20042040
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (24 Samples)
20041794
24ライブラリー調製用の試薬とイルミナ精製ビーズが含まれます。インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (96 Samples)
20041795
96ライブラリー調製用の試薬とイルミナ精製ビーズが含まれます。インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
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製品名
数量
単価
製品名
カタログ番号
量
単価
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジ形式で提供され、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフローセル構成を備えています。
鎖情報を正確に測定し、タンパク質コーディングトランスクリプトームの正確で偏りのない検出のための迅速で費用対効果の高いワークフロー。
すぐに使用できる充填された試薬カートリッジとフローセルからなるNovaSeq 6000システム用試薬キットです。
主要な免疫腫瘍学遺伝子シグネチャ（TMB、MSI）に加えて、血漿中のctDNAからすべての主要なバリアントクラスを検出できる腫瘍横断型パネルでCGPを可能にします。
NovaSeq 6000 Xp Workflowは、フローセルごとに独立したレーンローディングと高いライブラリーマルチプレックスの柔軟性を提供し、1回のランでサンプルスループットを最大化します。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSI）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現し、スケーラビリティを強化します。
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