ヒトゲノムのマッピング困難な領域に対処するための、費用効率に優れ、柔軟性のある、ターゲット化したロングリードソリューション。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
Illumina Complete Long Reads with Enrichment, Humanは、低インプットDNAからの高精度で費用対効果の高いターゲットロングリードを可能にします。このライブラリー調製キットは、ロングリードを利用することで費用効果の高い洞察をもたらし、標準的なショートリード全ゲノムをターゲット化したロングリードパネルで補完することで、最大限の価値を提供します。備考：解析には、ターゲット化したロングリードを補完するために、同じサンプルから得られた30倍以上の標準的なショートリードWGSデータが必要です。
| Method | Target Enrichment, Whole-Genome Sequencing, Long-Read Sequencing, Phased Sequencing, Custom Sequencing, Targeted DNA Sequencing |
|---|---|
| Specialized sample types | Blood, Not FFPE-Compatible, Saliva |
| Variant class | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Germline variants, Structural variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
| アッセイ時間 | 約2日 |
| インプット量 |
50 ng DNAを推奨。最低10 ng DNA |
| システム | NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| ターゲットインサートサイズ |
インサートサイズ：500～700 bp、リード長：N50 5～7 kb |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム |
約6時間 |
| マルチプレックス |
レーンあたり最大384サンプル（パネルのターゲットサイズとシーケンス出力によって異なります） |
| 反応数 | 24または96回 |
| 核酸の種類 | DNA |
| 生物種 | ヒト |
| 説明 |
柔軟性と費用対効果の高いターゲットロングリードとショートリードデータの組み合わせた高精度WGS。事前に設計されたパネルまたはカスタムパネルと組み合わせて、ゲノムのマッピングが困難な領域を解決するか、関心領域に段階的シーケンスを追加します。 |
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Humanには、ターゲット化したロングリードライブラリーを生成するためのコア試薬が含まれています。エンリッチメント用のプローブパネルをご購入ください。このパネルは、DesignStudioカスタムアッセイデザインツールで、既製ヒト包括的パネル（別売りまたはキットの一部として購入可能）またはプレデザインパネルまたはカスタムパネルのいずれかです。
どのアクセサリーが必要ですか？
イルミナ独自のデュアルインデックスと、スループットに基づくデータストレージと解析のニーズを満たすのに十分なiCreditが必要です。
Illumina Complete Long Read with Enrichment解析には、同じサンプルからの標準的なショートリード≥ 30 x全ゲノムライブラリーが必要です。Illumina DNA PCR-Free Prepは、標準的なショートリード全ゲノムのライブラリー調製に推奨されます。サードパーティ製WGSキットにも互換性があります。マークされていないライブラリーは、並行して調製またはシーケンスする必要はありません。以前にアッセイしたサンプルからのFASTQファイルを使用できます。
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human
カスタムパネル
DRAGEN ICLR (Illumina Complete Long Read) with Enrichmentアプリ
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NovaSeq 6000 System | Human Comprehensive Panel: 24 samples per S4 flow cell Large panels (15–25 Mb): ~75 samples per S4 flow cell Medium panels (5–15 Mb): ~187 samples per S4 flow cell Small panels (> 5 Mb): ~375 samples per S4 flow cell |
2 × 150 |
| NovaSeq X System | Human Comprehensive Panel: 24 samples per 10B flow cell, 64 samples per 25B flow cell Large panels (15–25 Mb): ~75 samples per 10B flow cell, ~200 samples per 25B flow cell Medium panels (5–15 Mb): ~187 samples per 10B flow cell, ~500 samples per 25B flow cell Small panels (> 5 Mb): ~375 samples per 10B flow cell, ~1000 samples per 25B flow cell |
2 × 150 |
| NextSeq 2000 System | Human Comprehensive Panel: 3 samples per P3 flow cell Large panels (15–25 Mb): ~9 samples per P3 flow cell Medium panels (5–15 Mb): ~22 samples per P3 flow cell Small panels (> 5 Mb): ~45 samples per P3 flow cell |
2 × 150 |
ヒト全ゲノムシーケンスは、私たちをユニークな存在にしている複雑な遺伝性バリアントを、最も詳しく知ることができるものです。
大規模全ゲノムシーケンスは、疾患研究および集団ゲノム研究に役立ち、疾患関連アリルを明らかにします。
ターゲットエンリッチメントは、ハイブリダイゼーションを使用して目的のゲノム領域を捕捉します。ターゲットエンリッチメントについて、また、複数サンプルを一度に評価するためにどのように使用できるかについて学ぶ。
| Illumina Complete Long Read with Enrichment, Human | Illumina Complete Long Read Prep, Human | Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment | |
|---|---|---|---|
| Method | Target Enrichment, Whole-Genome Sequencing, Long-Read Sequencing, Phased Sequencing, Custom Sequencing, Targeted DNA Sequencing | Whole-Genome Sequencing, Long-Read Sequencing | Target Enrichment, Exome Sequencing, Targeted DNA Sequencing |
| Specialized sample types | Blood, Not FFPE-Compatible, Saliva | Blood, Not FFPE-Compatible, Low-Input Samples, Saliva | Blood, Saliva |
| Variant class | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Germline variants, Structural variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Short tandem repeats (STRs), Germline variants, Structural variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
| アッセイ時間 | 約2日 | 約7.5～8.5時間 | 6.5時間 |
| インプット量 |
50 ng DNAを推奨。最低10 ng DNA |
DNA 50 ng推奨 | 50～1,000 ngの高品質ゲノムDNA（直接血液および唾液については、リファレンスガイドを参照） |
| システム | NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | NovaSeq 6000Dx Instrument, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| ターゲットインサートサイズ |
インサートサイズ：500～700 bp、リード長：N50 5～7 kb |
500～700 bp | |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム |
約6時間 |
5～6時間（PCRおよびQCを含む） | 約2時間 |
| マルチプレックス |
レーンあたり最大384サンプル（パネルのターゲットサイズとシーケンス出力によって異なります） |
最大48 | 最大12プレックスの濃縮前プーリングをテスト。キット構成は、最大192サンプルのマルチプレックスをサポートします。最大384まで可能です。 |
| 反応数 | 24または96回 | 8または24 | |
| 核酸の種類 | DNA | DNA | DNA |
| 生物種 | ヒト | ヒト | ヒト |
| 説明 |
柔軟性と費用対効果の高いターゲットロングリードとショートリードデータの組み合わせた高精度WGS。事前に設計されたパネルまたはカスタムパネルと組み合わせて、ゲノムのマッピングが困難な領域を解決するか、関心領域に段階的シーケンスを追加します。 |
Illumina Complete Long Read Prep, Humanは、既存のIllumina NovaSeqプラットフォームを使用して、ロングリードヒト生殖細胞系列の全ゲノムシーケンスを実行します。 | 費用対効果と信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスのための最新のエクソームコンテンツの集中エンリッチメントプローブパネルを備えた、エンリッチメントワークフローによる高速で使いやすいライブラリー調製。 |
ターゲット化したロングリードで困難な領域での精度を向上
（A）Human Comprehensive Panelまたは（B）CMRG PanelがターゲットとするHG002遺伝子領域の一塩基多型（SNP）およびIndelに対する偽陰性（FN）および偽陽性（FP）バリアントコールを、Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment（オレンジ）を使用して、標準的なショートリードWGS（青）と比較します。
Illumina Complete Long Read技術は、1台の装置で高精度のロングリードとショートリードシーケンスを可能にする、新しい高性能アッセイのポートフォリオの構築を実現します。
イルミナの完全ロングリード：複雑なゲノムからの希少疾患に関する洞察
このプレゼンテーションでは、Complete Long Readのユースケースを共有し、世界中のコラボレーターが行っている研究に焦点を当てます。
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human Comprehensive Panel (24 samples)
20113834
ロングリードヒト全ゲノムシーケンス（WGS）アプリケーションに役立つ領域に対応するように設計されたプローブパネルを備えたライブラリー調製および濃縮ソリューション。
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human Comprehensive Panel (96 samples)
20113835
ロングリードヒト全ゲノムシーケンス（WGS）アプリケーションに役立つ領域に対応するように設計されたプローブパネルを備えたライブラリー調製および濃縮ソリューション。
Illumina Human Comprehensive Panel (24 samples)
20113836
ロングリード全ゲノムシーケンス（WGS）アプリケーションに役立つヒトゲノムの領域をターゲット化するためにデザインされたハイブリダイゼーションキャプチャープローブパネル。
Illumina Human Comprehensive Panel (96 samples)
20113837
ロングリード全ゲノムシーケンス（WGS）アプリケーションに役立つヒトゲノムの領域をターゲット化するためにデザインされたハイブリダイゼーションキャプチャープローブパネル。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 1 iCredit
20042038
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics Starter Pack - 1,000 iCredits
20042039
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 5,000 iCredits
20042040
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (24 Samples)
20041794
24ライブラリー調製用の試薬とイルミナ精製ビーズが含まれます。インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (96 Samples)
20041795
96ライブラリー調製用の試薬とイルミナ精製ビーズが含まれます。インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
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製品名
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単価
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
鎖情報の正確な測定により、タンパク質コーディングトランスクリプトームを正確かつ偏りなく検出するための迅速で費用対効果の高いワークフロー。
NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジと複数のフローセル構成を備えており、柔軟なシーケンスオプションが可能です。
すぐに使用できる充填された試薬カートリッジとフローセルからなるNovaSeq 6000システム用試薬キットです。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSI）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現し、スケーラビリティを強化します。
主要な免疫腫瘍学遺伝子シグネチャ（TMB、MSI）に加えて、血漿中のctDNAからすべての主要なバリアントクラスを検出できる腫瘍横断型パネルでCGPを可能にします。
NovaSeq 6000 Xp Workflowは、フローセルごとに独立したレーンローディングと高いライブラリーマルチプレックスの柔軟性を提供し、1回のランでサンプルスループットを最大化します。
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