Illumina Complete Long Read with Enrichmentのライブラリー調製キットを使用して、タンパク質コード遺伝子内のマッピング困難な領域のカバレッジを強化するための最適化されたデザイン済みパネル。必要な30倍以上の標準的なショートリード全ゲノムと組み合わせて解析。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
イルミナのHuman Comprehensive Panelは、ゲノムにおいて最大の価値を提供するロングリードに焦点を合わせています。 ターゲットロングリードは、高精度のショートリードWGSを補完し、PrecisionFDA1 Truth Challenge v2ベンチマークで測定される99.87%のF1スコア（SNVs + Indels）で卓越した小型バリアント精度を提供する包括的なヒト全ゲノムソリューションを作成します。
Illumina Complete Long Read Prep with EnrichmentおよびHuman Comprehensive Panelは、イルミナのプラットフォームと組み合わせることで、他のロングリードシーケンスソリューションよりも高いサンプルスループットを達成できます。より広範にバリアントを発見するためのリフレックスツールとして、既存のWGSデータセットを補強するために使用します。
イルミナのHuman Comprehensive Panelは、>6500のタンパク質コード遺伝子内のターゲットロングリードから恩恵を受ける幅広い遺伝子領域のカバレッジを強化します。2 このパネルの開発では、20,000を超えるタンパク質コード遺伝子の全セットが検討されました。ショートリードのみで包括的にカバーされている遺伝子は除外されました。このパネルは出荷準備が整っており、Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Humanでの使用に最適化されています。
| Method | Target Enrichment |
|---|---|
| Variant class | Short tandem repeats (STRs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
| アッセイ時間 | 約2日 |
| インプット量 |
50 ng DNAを推奨。最低10 ng DNA |
| ハンズオンタイム |
約6時間 |
| マルチプレックス |
最大64サンプル |
| 作用機序 | タグメンテーション, ランドマーク, ビーズ結合トランスポソーム, ハイブリッドキャプチャー化学 |
| 生物種 | ヒト |
| 説明 |
6,599のタンパク質コード遺伝子内のマッピングが困難な領域に対応するように事前設計、最適化されたパネル。 |
パネル単体またはキットの一部としてご注文いただけます。Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment、Human（24または96サンプル）およびイルミナのユニークデュアルインデックスが必要です。スループットに基づいたデータ保存と解析のニーズを満たすために十分なiCreditを購入してください。
Illumina Complete Long Read with Enrichmentのデータ解析には、同じサンプルからの標準的なショートリード30倍以上の全ゲノムライブラリーが必要です。Illumina DNA PCR-Free Prepは、標準的なショートリード全ゲノムのライブラリー調製に推奨されます。以前にランしたサンプルからのFASTQファイルを使用できます。
DRAGEN ICLR (Illumina Complete Long Read with Enrichment)
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NovaSeq 6000 System | 24 samples per S4 flow cell, 10 samples per S2 flow cell, 4 samples per S1 flow cell, 2 samples per SP flow cell |
2 × 150 |
| NovaSeq X System | 64 samples per 25B flow cell, 24 samples per 10B flow cell, 4 samples per 1.5B flow cell |
2 × 150 |
ヒト全ゲノムシーケンスは、私たちをユニークな存在にしている複雑な遺伝性バリアントを、最も詳しく知ることができるものです。
Illumina Complete Long Read技術は、1台の装置で高精度のロングリードとショートリードシーケンスを可能にする、新しい高性能アッセイのポートフォリオの構築を実現します。
大規模全ゲノムシーケンスは、疾患研究および集団ゲノム研究に役立ち、疾患関連アリルを明らかにします。
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Illumina Complete Long Read Prep with EnrichmentおよびHuman Comprehensive Panelは、困難な遺伝子領域のカバレッジを強化し、標準的なショートリードヒトWGSを補完します。標準ショートリードWGSと濃縮したイルミナ完全ロングリードを用いてシーケンスした STRC のIGVプロット。
Illumina Complete Long Read Prep with EnrichmentおよびHuman Comprehensive Panelは、困難な遺伝子領域のカバレッジを強化し、標準的なショートリードヒトWGSを補完します。標準的ショートリードWGSおよびIllumina Complete Long Read with Enrichmentを使用してシーケンスされたNEBのIGVプロット。
Human Comprehensive Panelがターゲットとする遺伝子領域の一塩基多型（SNP）およびIndelに対する偽陰性（FN）および偽陽性（FP）バリアントコールを、Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment（オレンジ）を使用して、標準的なショートリードWGS（青）と比較します。
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human Comprehensive Panel (24 samples)
20113834
ロングリードヒト全ゲノムシーケンス（WGS）アプリケーションに役立つ領域に対応するように設計されたプローブパネルを備えたライブラリー調製および濃縮ソリューション。
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human Comprehensive Panel (96 samples)
20113835
ロングリードヒト全ゲノムシーケンス（WGS）アプリケーションに役立つ領域に対応するように設計されたプローブパネルを備えたライブラリー調製および濃縮ソリューション。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 1 iCredit
20042038
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics Starter Pack - 1,000 iCredits
20042039
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 5,000 iCredits
20042040
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
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進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
鎖情報の正確な測定により、タンパク質コーディングトランスクリプトームを正確かつ偏りなく検出するための迅速で費用対効果の高いワークフロー。
NovaSeqプラットフォームからのロングリードデータを使った、包括的なヒトWGSのための高精度、高性能なフルワークフローソリューション。
高感度シーケンスアプリケーション用の高精度データを生成する効率的で高速な統合ライブラリー調製ワークフロー。
iCreditsは、イルミナのクラウドソフトウェアエコシステム内でデータストレージと解析を購入するために使用されます。1 iCreditは1米ドル（USD）に相当します。
NovaSeq Xシリーズ用試薬キットには、試薬カートリッジ、バッファーカートリッジ、フローセル、Lyoインサート、プレロードバッファー、ライブラリーチューブストリップが含まれます。
すぐに使用できる充填された試薬カートリッジとフローセルからなるNovaSeq 6000システム用試薬キットです。
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