新しいイルミナRNA UD Indexes Sets A-D (20091655、、2009165720091659、20091661）を注文することをお勧めします。IDT for Illumina RNA UD Indexes Sets A-D (20040553, 20040554, 20040555, 20040556)は廃止されており、最終注文日はPON2023-1440で発表されているように2025年1月30日です。
Illumina Stranded mRNA Prep
インプット量わずか25 ngの標準（未分解）RNAを利用してコーディングトランスクリプトームを解析できるシンプルで拡張性が高くコスト効率の良い、1日で完了できる迅速ソリューション
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ライブラリー調製
インデックスアダプター
サービス
Illumina Stranded mRNA Library Prepトレーニング
20044765
合計：
製品のハイライト
Illumina Stranded mRNA Prepは、効率化を実現したRNA-Seqソリューションであり、トランスクリプトームを明確かつ網羅的に解析することができます。さまざまなサンプルタイプに柔軟に対応し、トータルRNA25 ngという少ないインプット量に対応できます。Illumina Stranded mRNA Prepは、ストランドの向きを精確に測定することができます。また、均一なカバレッジを実現し、未知のアイソフォーム、遺伝子融合、アリル特異的発現といったさまざまな特徴を確実に検出することができます。
卓越したパフォーマンス
Illumina Stranded mRNA Prepは、ポリAの優れたキャプチャー効率とカバレッジ均一性を提供するために最適化されています。コーディングトランスクリプトームの正確で偏りのない検出に必要なシーケンス深度を最小限に抑えます。Illumina Stranded mRNA PrepはTruSeqライゲーションテクノロジーに基づいており、2011年以降、9,926を超える出版物で引用されています。
多くの試験デザインの柔軟性
Illumina Stranded Total RNA Prepは、25 ng～1000 ngの幅広いRNAインプットをサポートします。*
ストランドの向きの正確な測定
この情報はアンチセンス転写の検出を可能にし、転写産物のアノテーションを強化し、アライメント効率を向上させます。
高速で自動化に適したワークフロー
イルミナシーケンス用のライブラリーを1日で調製します。Illumina Qualified Methodは、当社のパートナーが提供するさまざまな自動化プラットフォームで利用できます。
シーケンスのスケーラビリティ
1回のランで最大384のサンプルとシーケンスをマルチプレックスします。
RNA-Seqのパワー
RNA-Seqは、ソートリーダーにとってますます最適なプラットフォームとなり、特定の時点でトランスクリプトームの詳細なスナップショットを提供します。定量的PCRよりも多くの利点があります。
- トランスクリプトームに関するこれまでの知識を必要としない、仮説のない実験デザイン
- 既知および新規の転写産物を検出する高い検出力
- 各アッセイで数百から数千の領域を定量化する高いスループット能力
- より広いダイナミックレンジにより、遺伝子発現をより正確に測定
- アッセイごとにより多くのデータが得られ、完全なシーケンスとバリアント情報を提供
*FFPEサンプルには対応していません
よく一緒に購入される製品
仕様
推奨プロジェクト
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | 中出力：5 高出力：16 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 75 bp |
| NextSeq 2000 System | P2：16 P3：40 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 75 bp |
| NovaSeq 6000 System | SP：32 S1：64 S2: 164 S4：384 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 75 bp |
製品比較
| Illumina Stranded mRNA Prep | TruSeq Stranded mRNA | TruSeq RNA Library Prep Kit v2 | Illumina RNA Prep with Enrichment | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome | |
|---|---|---|---|---|---|
| ストランド特異性 | ストランド化 | ストランド化 | Non-Stranded | Non-Stranded | ストランド化 |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス | シーケンス | シーケンス |
| バリアントクラス | 新規転写産物, トランスクリプトバリアント, 遺伝子融合, 一塩基多型（SNP） | 新規転写産物, トランスクリプトバリアント, 遺伝子融合, 一塩基多型（SNP） | 新規転写産物, トランスクリプトバリアント, 遺伝子融合, 一塩基多型（SNP） | 新規転写産物, トランスクリプトバリアント, 遺伝子融合, 一塩基多型（SNP） | 新規転写産物, トランスクリプトバリアント, 遺伝子融合, 一塩基多型（SNP） |
| 自動化に関する互換性 | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム |
パフォーマンスメトリクスの比較
左 - イルミナストランドmRNA調製のパフォーマンスメトリクス。右 - Illumina Stranded mRNA PrepをTruSeq Stranded mRNAと比較しました。Illumina Stranded mRNA Prepは、特に25 ng UHR RNAの入力で優れた性能を示しました。BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.30Mリードにサブサンプリングし、解析しました。重複は、4Mサブサンプルペアエンドリードパスフィルター（PF）で報告されます。
低インプットでの遺伝子発見の向上
Illumina Stranded mRNA Prepは、TruSeq Stranded mRNAと比較して、低RNAインプットでより大きな遺伝子検出を可能にします。検出された遺伝子数は、30MサブサンプリングされたペアエンドリードPFで報告されます。Illumina Stranded mRNA Prepのように、1xカバレッジで検出されるより多くの遺伝子は、より高い感度の指標です。
レガシーキットとのハイコンコーダンス
Illumina Stranded mRNA Prepは、（A）100 ng UHR RNAの等価インプット、および（B）100 ng UHR RNAよりも25 ngの低インプットで、TruSeq Stranded mRNAとの非常に一致したデータを生成します。
高いデータ整合性
Illumina Stranded mRNA Prepは、（A）25 ng UHR RNAのテクニカルレプリケートと（B）25 ng UHR RNAと100 ng UHR RNAの入力量の間の高いデータ一致を達成します。ライブラリーを2 × 74 bpでシーケンスし、30Mリードにサブサンプリングしました。データ解析はBaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0.1を用いて実施しました。
Illumina Stranded mRNA Prepワークフロー
Illumina Stranded mRNA Prepは、ハンズオンタイムを短縮した迅速なワークフローを実現します。時間は、使用する機器、処理されたサンプル数、自動化手順、またはユーザー体験によって異なる場合があります。
製品資料
Brochure | PDF 1 MB
Illumina library preparation solutions
Brochure | PDF 2 MB
NextSeq 1000 and NextSeq 2000 RNA sequencing solution
Application Note | PDF < 1 MB
Application Note | PDF < 1 MB
Best practices for read trimming for Illumina Stranded mRNA and Total RNA workflows
Technical Note | PDF < 1 MB
Data Sheet | PDF | 5 versions
マニュアルとサポート情報
Illumina Stranded mRNA Prep Ligationチェックリスト Documentation
Illumina Stranded mRNA Prep Ligationリファレンスガイド Documentation
Illumina Stranded mRNA Prep Ligationドキュメント Documentation
Illumina Stranded mRNA Prep Ligation消耗品および機器 Documentation
すべて イルミナDNA RNA UDインデックス Support すべて Illumina Stranded mRNA Prep Ligationサポート Support
BaseSpace Sequence Hub | クラウドベースのゲノムデータ管理
次世代シーケンサー（NGS）の運用を開始し、急速に拡大するラボのためのデータ管理および簡素化されたバイオインフォマティクス。
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome
コーディングおよびノンコーディングトランスクリプトーム研究用の広範な種類のサンプルから迅速にライブラリーを調製して、非常に優れた柔軟性を持って研究を行うことができます。