製品

AmpliSeq for Illumina SARS-CoV-2 Research Panel

このシーケンスパネルは、SARS-CoV-2ウイルスを研究するための迅速、正確、かつ費用対効果の高い手法を提供します。

概要

この研究パネルには、SARS-CoV-2ゲノムをターゲットとする2つのプールに247個のアンプリコンが含まれています。このパネルには、コロナウイルスゲノムの>99%カバレッジ（約30kb）が含まれ、すべての潜在的な血清型をカバーしています。

コミュニティパネル機能

AmpliSeq for Illumina Community Panelは受注生産です。当社ではお客様の便宜のためにデザインを提供していますが、関連するパフォーマンスメトリクスはありません。事前にデザインおよびテストされたコンテンツについては、 AmpliSeq for Illumina Ready-to-Use Panelsをご覧ください。

AmpliSeq for Illumina Community Panelsには、主要な疾患研究者からの情報に基づいて選択および設計されたコンテンツが含まれています。イルミナコンシェルジュを使用して遺伝子やアンプリコンを追加または削除することで、このコミュニティパネルをそのまま注文したり、ニーズに合わせてパネルをカスタマイズしたりできます。

追加情報

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仕様

インプット量 1～100 ng、プールあたり10 ngを推奨
Method Amplicon Sequencing
核酸の種類 RNA
アンプリコン数 合計247（2プール） （プール1：125アンプリコン。プール2：122アンプリコン）
生物種 Virus
生物種詳細 SARS-CoV-2（SARS-CoV-2_ MN908947v3）
テクノロジー イルミナシーケンサー

必要な製品

コミュニティパネルに加えて、AmpliSeq Library PLUSキットとインデックスアダプターも必要です。

ライブラリーPLUS、アダプター、cDNA合成の注文

/ 結果

ドキュメント

製品資料
Support documentation

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AmpliSeq for Illumina SARS-CoV-2 Research Panel Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit COVIDSeqテスト（RUO版）
インプット量 1～100 ng、プールあたり10 ngを推奨 10～100 ng 容量に基づく（濃度に依存しない）
Method Amplicon Sequencing Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing Targeted RNA Sequencing, Amplicon Sequencing
核酸の種類 RNA DNA, RNA DNA, RNA RNA
アンプリコン数 合計247（2プール） （プール1：125アンプリコン。プール2：122アンプリコン）
生物種 Virus ヒト, Virus Fungal, Virus, Bacteria ヒト, Virus
生物種詳細 SARS-CoV-2（SARS-CoV-2_ MN908947v3） 最近のインフルエンザウイルス株やSARS-CoV-2を含む一般的な呼吸器系ウイルスを検出します。このパネルには、品質機能としてヒトターゲットへのプローブが含まれているため、アッセイに使用したすべてのサンプルでヒトターゲットを検出できます。 呼吸器病原体（180以上の細菌、50以上の真菌、SARS-CoV-2を含む40以上のウイルス）および抗菌薬耐性アリル（1200以上）を検出します。 SARS-CoV-2（SARS-CoV-2_ MN908947v3）
テクノロジー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー

パネル (1)

AmpliSeq™ SARS-CoV-2 Research Panel for Illumina®

20020496

特定のターゲットまたは関心のあるゲノムコンテンツに最適化されたターゲットカスタムアンプリコンパネル。Library PLUSおよびインデックス付きアダプターは別売です。

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よくある質問（FAQ）

AmpliSeq for Illumina SARS-CoV-2 Community Panelは、AmpliSeq for Illuminaライブラリー調製、インデックス、およびアクセサリと組み合わせて、SARS-CoV-2ウイルスの疫学研究のためのターゲットRNA/cDNAアンプリコンアッセイです（研究用のみ）。このパネルは2プールデザインであり、247のアンプリコン/プライマーペア（242の固有アンプリコン（プール1：125アンプリコン、プール2：122アンプリコン）：237のウイルス特異的SARS-CoV-2ターゲットおよび5つのヒト遺伝子発現コントロール）を含み、ウイルスゲノムの>99%およびウイルスのすべての潜在的な血清型をカバーする長さ125～275 bpsの範囲です。

このパネルは、研究用（RUO）アプリケーションのみを対象としており、診断手順では使用できません。感染の診断、予防、または管理にパネルが使用できることを示す情報の提供を目的とした主張や表現はありません。

ウイルスRNAを単離できる市販の抽出キットを評価することをお勧めします。QIAGEN QIAmp Viral RNA Mini Kit（PN 52904）は、次世代シーケンサーライブラリー調製やその他の社内検査法での使用に互換性があることが実証されています。バックオーダーの場合、他社の市販の抽出キットも互換性がある必要があります。

詳細については、以下のリソースを参照してください。

AmpliSeq for Illumina SARS-CoV-2 Community Panelのライブラリー調製は、AmpliSeq for Illumina Custom and Community Panelsリファレンスガイドに従います。第3章 RNAパネルのプロトコール（https://support.illumina.com/downloads/ampliseq-for-illumina-custom-and-community-panels-reference-guide-1000000036408.html）

“Amplify cDNA Targets”で、以下に進みます。

  • AMP_RNAプログラム用の2つのプライマープール
  • 表7：18サイクルおよび4分でプールあたり97～192のプライマーペア
    • プール1：アンプリコン125個/プライマーペア、プール2：アンプリコン122個/プライマーペア
  • 表8：サンプル品質とサンプルインプットに基づいて調整可能

AmpliSeq Library PLUS for Illuminaを使用したライブラリー調製は、すべてのAmpliSeq CDまたはUD Index Sets for Illuminaと互換性があります。

リード深度：サンプルあたり25万リード。

リード長：2 x 151 bp

プラットフォーム：AmpliSeq for Illuminaライブラリーは、iSeq 100、MiSeq、MiniSeq、NextSeqシステムと互換性があります。

パネルをMyIlluminaカートに追加してチェックアウトした後、パネルの注文を受け取ります。パネルにはソリューションIDが明記されている必要があります。IAACY126664577_100。

サンプルスループットに応じて、お客様は以下も注文する必要があります。

ライブラリー調製
インデックスアダプター
アクセサリー製品

1つの注文には、2250サンプルを調製するのに十分なオリゴが含まれています。

1回の注文=2,223米ドルで2,250サンプル（約9ドル/アンプリコン）を調製できます。これには、AmpliSeq Library PLUS for Illumina、Ampliseq cDNA Synthesis for Illumina、AmpliSeq CDまたはUD Indexes for Illuminaは含まれません。

BaseSpace Sequence Hub DNA Amplicon または DRAGEN Metagenomics Pipeline アプリは、データ解析に使用できます。

その他のご質問は、 techsupport@illumina.comまでお問い合わせください。

/ 結果

NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel

骨髄がんに関連する40種のDNA遺伝子、29種のRNA融合ドライバー遺伝子、5種の遺伝子発現レベルを調べるターゲットパネル。

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