ターゲットRNAシーケンス
ターゲットRNAシーケンスの紹介
ターゲットRNAシーケンス（RNA-Seq）は、選択した特定の転写産物だけをシーケンスすることで高精度な結果が得られる手法です。定量的情報と定性的情報の両方を提供します。ターゲットRNA-Seqは、エンリッチメントまたはアンプリコンベースのアプローチのいずれかによって達成することができ、どちらも目的とする遺伝子群にフォーカスして遺伝子発現解析を可能にします。また、エンリッチメントアッセイは、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織を含む多くのサンプルタイプで、既知および新規両方の遺伝子融合パートナーを検出する機能も提供します。
ターゲットエンリッチメントRNA-Seqの利点
RNAエンリッチメントは、定量的な発現情報のほか、小規模バリアントや遺伝子融合の検出を行います。RNAエンリッチメントは以下を特徴としています。
- FFPE組織などの困難なサンプルと互換性があります
- 低インプット（10 ngのトータルRNAまたは20～100 ngのFFPE RNAが必要）
- 既知の融合遺伝子パートナーと新規融合遺伝子パートナーの両方を検出
- 幅広いダイナミックレンジで遺伝子発現をプロファイリング
ターゲットアンプリコンRNA-Seqの利点
RNA発現パネルは、関心のあるRNAシーケンスに焦点を合わせるように設計することも、完全に最適化され実験的に検証されたパネルにカスタムコンテンツを追加することもできます。
- 関心のある転写産物を測定するための、非常に正確で特異的な方法を提供
- 発現差解析、アリル特異的発現の測定、および遺伝子融合検証のための定性的および定量的情報を提供
- 数十から数千に及ぶターゲットを同時に測定
- 低品質またはFFPE由来のRNAサンプルに対応
小児白血病におけるがんパスウェイに関する新たな見解
研究者たちは小児白血病における融合遺伝子の役割を理解するためにTruSight RNA Pan-Cancer Panelを使っています。
インタビューを読む
RNAシーケンスのライブラリー調製
ターゲットRNAシーケンス向けのRNA-Seqライブラリー調製ソリューションには、タグメンテーションベースの超高速ワークフローが含まれています。これにより、RNAエクソームなどの関心のある多くの転写産物について深い洞察を引き出すことができます。
RNAライブラリー調製の詳細はこちらRNA シーケンス検討事項
遺伝子発現プロファイリング、ターゲットRNA発現、small RNA解析、など、それぞれのRNA-Seq実験によって、必要とされるリード長や深度は異なります。このページでは、実験において考慮すべき点をレビューしています。実験計画にご活用ください。
詳細はこちら
ターゲットRNA-Seqワークフロー
イルミナのSequence by Synthesis（SBS）ケミストリーは、最も広く採用されている次世代シーケンサー（NGS）テクノロジーであり、世界のシーケンスデータの約90%を生成しています。*
イルミナは、ライブラリー調製からデータ解析、生物学的解釈までのプロセス全体を簡略化する、統合的なターゲットRNA-Seqワークフローを提供しています。
RNAシーケンスの方法
このRNAシーケンス手法ガイドは、ターゲットパネルから全トランスクリプトームまで、RNAプロファイリングのためのイルミナのソリューションについて解説します。イルミナのRNAシーケンスワークフローは、ライブラリー調製、シーケンシング、データ解析をシームレスに統合し、トランスクリプトーム研究をサポートします。
ガイドをダウンロード関連ソリューション
がん研究 バリアント検出
ターゲットRNA-Seqで遺伝子発現とトランスクリプトームの変化をモニタリングすることで、どのバリアントが発現し、腫瘍形成と進行に影響を与えるかをよりよく理解することができます。がん研究におけるRNA-Seqの詳細はこちら。
医薬品開発研究
医薬品開発パイプラインの全フェーズに対応するゲノムシーケンスソリューションをご覧ください。カスタムパネルの遺伝子発現プロファイルを、いくつかの定義されたターゲットで、全トランスクリプトームに対して特性化します。医薬品開発におけるNGSの詳細はこちら。
ニューロゲノミクス研究
ゲノムテクノロジーは、アルツハイマー病やパーキンソン病などの複雑な神経疾患の背後にあるメカニズムを解明するのに役立ちます。ニューロゲノミクス研究の詳細はこちら。
免疫ゲノミクス研究
NGSが自己免疫疾患のメカニズム、免疫レパートリー、および免疫関連遺伝子変異の機能的影響の研究をどのように可能にするかをご覧ください。免疫ゲノミクスの詳細はこちら。
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Additional Resources
RNA-Seq Methods Review
This overview discusses recent RNA-Seq research publications featuring Illumina technology.
タッチパネル操作のインフォマティクス
NGSデータを容易に解析、保管、共有できるユーザーフレンドリーなツールにアクセスしてください。
Targeted RNA-Seq and Circadian Rhythms
Dr. Hughes at University of Missouri-St. Louis uses targeted RNA-Seq to uncover the genetic mechanisms of circadian rhythms.
FFPE RNA-Seq Tips
RNA-Seq analysis of FFPE and other low-quality samples offers valuable insights for disease research.
RNA-Seq データ解析
ユーザーフレンドリーなソフトウェアツールが、バイオインフォマティクスの経験がなくても、生物学者のためのmRNA-Seqデータ解析を簡素化させます。
ペアエンド RNA シーケンス
ペアエンドRNA-Seqにより融合遺伝子や新規スプライスアイソフォームの特徴づけなどの探索アプリケーションを可能にします。
*データ計算はファイルに保存しています。Illumina, Inc., 2015