製品
製品
製品

Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit

メタトランスクリプトミクス研究のために、複雑な微生物サンプル（糞便など）から望ましくない宿主および汎細菌rRNAを迅速かつ効率的に除去。

概要

Illumina Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kitは、糞便を含む複雑な微生物サンプルのメタトランスクリプトームシーケンス用のRNAから解析までの合理化されたソリューションです。

主な特長

  • 不要なリードを減らし、発現した細菌RNAのカバレッジを高めることで、より深い解析を行い、微生物の活性に関する洞察を得ます。

  • 実証済みのRibo-Zero Plus酵素的リボデプレーションテクノロジーを使用して、成人および乳児のヒトの腸に共通する細菌、ならびにヒトおよびマウスの宿主RNAから不要なrRNAを除去します。

  • BaseSpace Microbiome Metatranscriptomicsアプリに無料でアクセスして、複雑なメタトランスクリプトームを解析します。

仕様

説明 本製品は複雑な微生物サンプルから豊富なrRNA転写産物を除去するため、研究者はメタトランスクリプトームの高価値で有益な部分に集中できます。このキットには、データ分析と視覚化を簡素化するためのBaseSpace Microbiome Metatranscriptomicsアプリへのアクセスが含まれています。
インプット量 標準品質トータルRNA25～1,000 ng
システム NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq 6000 System
作用機序 酵素によるrRNA除去、ライゲーションベースのアダプターおよびインデックスの追加
手法 Whole-transcriptome sequencing, Metatranscriptome sequencing
Nucleic acid type RNA
サンプルタイプ Microbiome samples
Species category マウス, ヒト, ラット, Bacteria
テクノロジー イルミナシーケンサー
バリアントクラス Novel transcripts, Transcript variants

アプリケーション

ワークフローの例

1
ライブラリー調製

Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit

2
シーケンス
3
解析

プロジェクトの推奨事項

装置 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

Mid output: 2 High output: 8 (based on 25-50 million reads per sample)

2 x 75 bp
NovaSeq 6000 System

Whole Transcriptome Analysis: SP: 16  S1: 32  S2: 82   S4: 200 samples per run (based on 25-50 million reads per sample)

2 × 100 bp

関連するアプリケーションとメソッド

NGSによるヒトマイクロバイオーム解析

ショットガンメタゲノミクス、16S rRNAメタゲノム、メタトランスクリプトミクスなどのNGS法を使用して、ヒトマイクロバイオームを解析します。

微生物ゲノム

次世代シーケンサー（NGS）は、微生物ゲノミクスを変化させています。NGSを使用して、新規の微生物の発見、感染拡大の監視、食料源の分析などを行うことができます。

ドキュメント

製品資料
Support documentation

この製品では専用サポートセクションは現在ご利用いただけません

比較する

Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome
説明 本製品は複雑な微生物サンプルから豊富なrRNA転写産物を除去するため、研究者はメタトランスクリプトームの高価値で有益な部分に集中できます。このキットには、データ分析と視覚化を簡素化するためのBaseSpace Microbiome Metatranscriptomicsアプリへのアクセスが含まれています。 低RNAインプットや低品質サンプルから全トランスクリプトームシーケンシング対応ライブラリーを調製し、幅広いRNA-Seqアプリケーションをサポートします。豊富なトランスクリプトーム解析を容易にするため、複数種からrRNAとグロビンRNAを単一チューブで除去するRibo-Zero Plusが含まれています。 
インプット量 標準品質トータルRNA25～1,000 ng 標準品質のRNA検体にはトータルRNA 1～1,000 ng、最適パフォーマンスとFFPE検体にはトータルRNA 10 ng以上を推奨 
システム NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq 6000 System NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
作用機序 酵素によるrRNA除去、ライゲーションベースのアダプターおよびインデックスの追加 酵素によるrRNA除去、ライゲーションベースのアダプターおよびインデックスの追加
手法 Whole-transcriptome sequencing, Metatranscriptome sequencing Whole-transcriptome sequencing, Metatranscriptome sequencing
Nucleic acid type RNA RNA
サンプルタイプ Microbiome samples Microbiome samples, Low-input samples, FFPE tissue
Species category マウス, ヒト, ラット, Bacteria マウス, ヒト, ラット, Bacteria
テクノロジー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー
バリアントクラス Novel transcripts, Transcript variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants

図

Ribo-Zero Plus Microbiome Depletionキットによる強固なリボデプレーション

Ribo-Zero Plus Microbiome Depletionキットは、単一のチューブによる反応で、ヒトと細菌種のrRNA（5S、16S、23S）を効率的に除去します。得られる結果を、Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kitと、X社製の市販のリボソームRNA除去キットと比較してあります。2つの糞便サンプルを検査しました。サンプル1は成人と幼児の糞便サンプルを含んだ混合サンプルで、サンプル2はZymo社（カタログ番号：6331）由来の市販の糞便サンプルです。

リソース

メタトランスクリプトミクスによる偏りのない微生物プロファイリング

DiversigenおよびDNA GenotekのDr. Tonya Ward、Dr. Emily Hollister、Dr. Le Françoisが、メタトランスクリプトーム研究のワークフローをどのようにして開発したのか、未来に潜在的に強い影響力を持つこの研究分野に対する彼らの見解を参照してください。

スポットライトを見る

メタトランスクリプトミクス：課題と機会

このウェビナーでは、この分野の3名の著名な専門家がサンプルの収集と処理、rRNA枯渇、およびバイオインフォマティクス解析に関する洞察と重要な検討事項を共有します。

ウェビナーを視聴

Illumina® Ribo-Zero Plus rRNA Microbiome depletion kit (96 Samples)

20072062

96サンプル用のRibo-Zero Plusキットに含まれるマイクロバイオームやターゲットによく見られる多様なバクテリアからリボソームRNAを枯渇させるためのRibo-Zero Plusマイクロバイオーム枯渇モジュールが含まれます。ライブラリー調製試薬を含む完全なキットについては、Ribo-Zero Plus Microbiomeキット付きIllumina Stranded Total RNAを注文してください。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina® Stranded Total RNA Prep with Ligation, Ribo-Zero Plus Microbiome (96 Samples)

20072063

96ライブラリー調製用の試薬とRibo-Zero Plus Microbiome Depletionモジュールが含まれます。IDT for Illumina RNA UDインデックス、Ligationとのみ互換性があります。インデックスは別売りです。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

表示されている結果 : /

選択中の製品一覧

製品名

数量

Unit Price

合計 ( 製品)

製品はまだ選択されていません

選択したこれらの製品が失われないように、ページを離れる前にカートに追加してください。

NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

TruSeq RNA Exome

ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織やその他の低品質のサンプルからRNAをシーケンスするための再現性と経済性を兼ね備えたソリューションを提供します。わずか10 ngのトータルRNAから得られる精度

Illumina UD Indexes

ユニークデュアル（UD）インデックスにより、スループットの向上とコスト削減メリットをもたらすマルチプレックス可能なハイクオリティなライブラリーの調製が可能になります。

TruSeq Stranded mRNA

mRNAからシーケンスライブラリーを調製し、ストランド特異的情報でコーディングトランスクリプトームを明確に把握します。

TruSeq Stranded Total RNA

ヒト、マウスおよびホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織を含むさまざまな生物種やサンプルタイプに対応した、堅牢でスケーラブルな全トランスクリプトーム解析（RNA-Seq）ソリューション。

Illumina Stranded mRNA Prep

鎖情報の正確な測定により、タンパク質コーディングトランスクリプトームを正確かつ偏りなく検出するための迅速で費用対効果の高いワークフロー。

お問い合わせ

当社の製品およびサービスに関する情報、または当社のテクノロジーに関するご質問がございましたら、ぜひお問い合わせください。