Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit

メタトランスクリプトミクス研究のための複雑な微生物サンプル(例:糞便)からの望ましくない宿主および汎細菌rRNAの迅速で効率的な枯渇。 続きを読む...
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Illumina® Ribo-Zero Plus rRNA Microbiome Depletion Kit(96サンプル)

20072062

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Illumina® Stranded Total RNA Prep with Ligation、Ribo-Zero Plus Microbiome(96サンプル)

20072063

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製品のハイライト

Illumina Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kitは、便を含む複雑な微生物サンプルのメタトランスクリプトームシーケンスのためのRNAから解析までの合理化されたソリューションです。

  • 不要なリードを減らし、発現した細菌RNAのカバレッジを高めることで、より深い解析を行い、微生物の活性に関する洞察を得ます。
  • 実証済みのRibo-Zero Plus酵素的リボデプレーションテクノロジーを使用して、成人および乳児のヒトの腸に共通する細菌から不要なrRNAを除去し、ヒトやマウスから宿主RNAを除去します。
  • BaseSpace Microbiome Metatranscriptomicsアプリに無料でアクセスして、複雑なメタトランスクリプトームを解析します。

メタトランスクリプトミクスアプリケーションの詳細については、データシートをお読みください。

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仕様

製品比較

  Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit
説明 メタトランスクリプトミクス研究のための宿主および細菌rRNAからの大量の転写産物の枯渇。 複数の種または転写産物からの豊富な転写産物のシングルチューブ枯渇
インプット量 最適な性能を得るために、最低25 ngのトータルRNA、50 ngを推奨 標準品質のRNA検体にはトータルRNA1~1,000 ng、最適パフォーマンスとFFPE検体にはトータルRNA10 ng以上を推奨
システム互換性の詳細 ライブラリー調製は、すべてのイルミナシーケンスシステムと互換性があるように設計されており、NextSeq 500、NextSeq 550、NextSeq 1000、NextSeq 2000、およびNovaSeq 6000システムで使用することを推奨します。 ライブラリー調製は、すべてのイルミナシーケンスシステムと互換性があるように設計されており、NextSeq 500、NextSeq 550、およびNovaSeq 6000システムで広く検証されています。
ストランド特異性 ストランド化 ストランド化
手法 全トランスクリプトームシーケンス、メタトランスクリプトームシーケンス 全トランスクリプトームシーケンス
バリアントクラス 新規転写産物、転写産物バリアント 遺伝子融合、新規転写産物、単一ヌクレオチド多型(SNP)、転写産物バリアント
生物種カテゴリー 細菌、ヒト、マウス、ラット 細菌、ヒト、マウス、ラット
生物種詳細 Ribo-Zero Plusにリストされているすべての転写産物に加えて、糞便サンプルを含む複雑な細菌(微生物叢)サンプルから大量のrRNA転写産物が除去されます。 ヒト細胞質&ミトコンドリアrRNA、マウスrRNA、ラットrRNA、大腸菌およびB. subtilis rRNA、ヒトβグロビン転写産物など、複数の種からの大量の転写産物の除去
システム互換性 NextSeq 1000、NextSeq 2000、NextSeq 500、NextSeq 550、NovaSeq 6000 HiSeq 2500、HiSeq 3000、HiSeq 4000、NextSeq 1000、NextSeq 2000、NextSeq 500、NextSeq 550、NovaSeq 6000
サンプルタイプ マイクロバイオームサンプル FFPE組織、低インプットサンプル
核酸タイプ RNA RNA

メソッドごとのワークフロー例

 
メタトランスクリプトミクスによる偏りのない微生物プロファイリング
Tonya Ward博士とEmily Hollister博士のメタトランスクリプトミクスプロファイル

DiversigenとDNA GenotekのTonya Ward博士、Emily Hollister博士、Le François博士がメタトランスクリプトーム研究のワークフローをどのように開発したか、そしてこの研究分野の潜在的にインパクトのある未来に対する彼らの見解をお読みください。

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メタトランスクリプトミクス:課題と機会
メタトランスクリプトミクス:課題と機会のバナー

このウェビナーでは、この分野の3人の主要な専門家が、サンプルの収集と処理、rRNA枯渇、およびバイオインフォマティクス解析に関する洞察と重要な検討事項を共有します。

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サポートデータと図

 

マニュアルとサポート情報

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