Illumina Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kitは、便を含む複雑な微生物サンプルのメタトランスクリプトームシーケンスのためのRNAから解析までの合理化されたソリューションです。
メタトランスクリプトミクスアプリケーションの詳細については、データシートをお読みください。
| Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit | Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit | |
|---|---|---|
| 説明 | メタトランスクリプトミクス研究のための宿主および細菌rRNAからの大量の転写産物の枯渇。 | 複数の種または転写産物からの豊富な転写産物のシングルチューブ枯渇 |
| インプット量 | 最適な性能を得るために、最低25 ngのトータルRNA、50 ngを推奨 | 標準品質のRNA検体にはトータルRNA1～1,000 ng、最適パフォーマンスとFFPE検体にはトータルRNA10 ng以上を推奨 |
| システム互換性の詳細 | ライブラリー調製は、すべてのイルミナシーケンスシステムと互換性があるように設計されており、NextSeq 500、NextSeq 550、NextSeq 1000、NextSeq 2000、およびNovaSeq 6000システムで使用することを推奨します。 | ライブラリー調製は、すべてのイルミナシーケンスシステムと互換性があるように設計されており、NextSeq 500、NextSeq 550、およびNovaSeq 6000システムで広く検証されています。 |
| ストランド特異性 | ストランド化 | ストランド化 |
| 方法 | 全トランスクリプトームシーケンス、メタトランスクリプトームシーケンス | 全トランスクリプトームシーケンス |
| バリアントクラス | 新規転写産物、転写産物バリアント | 遺伝子融合、新規転写産物、単一ヌクレオチド多型（SNP）、転写産物バリアント |
| 生物種カテゴリー | 細菌、ヒト、マウス、ラット | 細菌、ヒト、マウス、ラット |
| 生物種詳細 | Ribo-Zero Plusにリストされているすべての転写産物に加えて、糞便サンプルを含む複雑な細菌（微生物叢）サンプルから大量のrRNA転写産物が除去されます。 | ヒト細胞質&ミトコンドリアrRNA、マウスrRNA、ラットrRNA、大腸菌およびB. subtilis rRNA、ヒトβグロビン転写産物など、複数の種からの大量の転写産物の除去 |
| システム互換性 | NextSeq 1000、NextSeq 2000、NextSeq 500、NextSeq 550、NovaSeq 6000 | HiSeq 2500、HiSeq 3000、HiSeq 4000、NextSeq 1000、NextSeq 2000、NextSeq 500、NextSeq 550、NovaSeq 6000 |
| サンプルタイプ | マイクロバイオームサンプル | FFPE組織、低インプットサンプル |
| 核酸タイプ | RNA | RNA |
DiversigenとDNA GenotekのTonya Ward博士、Emily Hollister博士、Le François博士がメタトランスクリプトーム研究のワークフローをどのように開発したか、そしてこの研究分野の潜在的にインパクトのある未来に対する彼らの見解をお読みください。
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このウェビナーでは、この分野の3人の主要な専門家が、サンプルの収集と処理、rRNA枯渇、およびバイオインフォマティクス解析に関する洞察と重要な検討事項を共有します。
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Ribo-Zero Plus Microbiome Depletionキットによる強固なリボドプレーション。Ribo-Zero Plus Microbiome Depletionキットは、単一のチューブによる反応で、ヒトと細菌種のrRNA（5S、16S、23S）を効率的に除去します。得られる結果を、Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kitと、X社製の市販のリボソームRNA除去キットと比較してあります。2つの糞便サンプルを検査しました。サンプル1は成人と幼児の糞便サンプルを含んだ混合サンプルで、サンプル2はZymo社（カタログ番号：6331）由来の市販の糞便サンプルです。
Application Note | PDF | 2 versions
Data Sheet | PDF | 6 versions
Illumina Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus
Data Sheet | PDF 1 MB
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