AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel

20,000を超えるヒトRefSeq遺伝子の発現レベルを測定するターゲットパネルです。

6時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない)

アッセイ時間

<1.5時間

ハンズオンタイム

RNA 1~100 ng(推奨量10 ng)

インプット量

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概要

AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panelは、1回のアッセイで20,000を超えるヒトRefSeq遺伝子の発現レベルを測定するための、高度にマルチプレックス化されたターゲットリシーケンスアッセイです。

主な特長

  • 迅速な遺伝子発現プロファイリング - 6時間でライブラリーを調製(ハンズオンタイムは1.5時間未満)。結果は2日未満で取得可能です。

  • 低品質、低数量のサンプル入力 - ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織からのインプットが最小限で開始した場合でも高品質のデータを取得できます。

  • DNA解析ソリューション  -ライブラリー調製、シーケンス、解析にまたがる包括的なワークフローを活用してください。

Transcriptome Human Gene Expression Panelは、AmpliSeq for Illuminaポリメラーゼ連鎖反応(PCR)に基づくライブラリー調製、イルミナのSequence by Synthesis(SBS)次世代シーケンサー(NGS)テクノロジー、および自動化解析を含む、統合されたワークフローの一部です。

このパネルはそのまますぐに使い始めることができるため、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化にかかる時間と労力を節約できます。

仕様

必要な製品

AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panelワークフローには、Transcriptome Panel、Library PLUSキット、インデックスアダプターが必要です。RNAワークフローにはcDNA合成も必要です。

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アプリケーション

ワークフローの例

関連するアプリケーションと手法

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AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome TruSeq Stranded Total RNA TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin
アッセイ時間 6時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) 約7時間 11.5時間 11.5時間
コンテンツ仕様 ヒトRefSeq遺伝子の95%超、20,802遺伝子、ヒトトランスクリプトームをキャプチャー コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー
説明 配列特異的アンプリコンを使用して、20,000を超えるヒトRefSeq遺伝子の発現レベルを調べます。 低RNAインプットや低品質サンプルから全トランスクリプトームシーケンシング対応ライブラリーを調製し、幅広いRNA-Seqアプリケーションをサポートします。豊富なトランスクリプトーム解析を容易にするため、複数種からrRNAとグロビンRNAを単一チューブで除去するRibo-Zero Plusが含まれています。  全トランスクリプトームシーケンシング研究用。トータルRNAバージョンは細胞質rRNAを除去し、トータルRNA Goldバージョンは細胞質およびミトコンドリアrRNAを除去します。 血液由来RNAの全トランスクリプトームシーケンシング研究用。細胞質およびミトコンドリアのrRNAおよびグロビンmRNAを除去します。
ハンズオンタイム <1.5時間 <3時間 5.5時間 5.5時間
インプット量 RNA 1~100 ng(推奨量10 ng) 標準品質のRNA検体にはトータルRNA 1~1,000 ng、最適パフォーマンスとFFPE検体にはトータルRNA 10 ng以上を推奨  高品質トータルRNA0.1~1 ug 低品質のサンプルは、さらなる最適化を必要とする場合があります。 0.1~1 ug血液由来高品質精製トータルRNA
システム NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500システム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500システム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500システム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム
作用機序 マルチプレックスPCR法 酵素によるrRNA除去、ライゲーションベースのアダプターおよびインデックスの追加 ビーズベースのrRNA除去、cDNA合成、PCR ビーズベースのrRNA除去、cDNA合成、PCR
手法 mRNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス 全トランスクリプトームシーケンス, メタトランスクリプトームシーケンス 全トランスクリプトームシーケンス 全トランスクリプトームシーケンス
マルチプレックス 96のデュアルインデックスの組み合わせ 最大384のユニークデュアルインデックス ロースループットキット:最大12のサンプルをプールします。または、セットAとセットBを併せて最大24のサンプルをプールします。, ハイスループットキット:コンビナトリアルデュアルインデックスまたはユニークデュアルインデックスのいずれかを使用して、96個のインデックスサンプルを調製 ハイスループットキット:コンビナトリアルデュアルインデックスまたはユニークデュアルインデックスのいずれかを使用して、96個のインデックスサンプルを調製, ロースループットキット:最大12のサンプルをプールします。または、セットAとセットBを併せて最大24のサンプルをプールします。
核酸の種類 RNA RNA RNA RNA
アンプリコン数 1プール
対応サンプルタイプ 血液, FFPE組織 マイクロバイオームサンプル, 少量インプットサンプル, FFPE組織 FFPE組織 血液
生物種カテゴリー ヒト マウス, ヒト, ラット, 細菌 マウス, ヒト, ラット マウス, ヒト, ラット
テクノロジー シーケンス シーケンス シーケンス シーケンス
バリアントクラス 転写産物バリアント 1塩基変異多型(SNP), 融合遺伝子, 新規点転写産物, 転写産物バリアント 1塩基変異多型(SNP), 融合遺伝子, 新規点転写産物, 転写産物バリアント 1塩基変異多型(SNP), 融合遺伝子, 新規点転写産物, 転写産物バリアント

パネル (1)

AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Panel for Illumina®

20019170

AmpliSeq Library PLUS for Illuminaと組み合わせると、24の反応に十分です。ライブラリー調製、インデックスアダプター、アクセサリー製品は別売りです。

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ライブラリー調製 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

24ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

384ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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インデックスアダプター (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

24サンプルのラベル付けに十分な24インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

96サンプルにラベル表示できる96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬とプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

イルミナ、セットA、セットB、セットCおよびセットDの4セットのAmpliSeq CDインデックスが含まれます。各セットには96サンプルにラベルを付けるのに十分な96、8 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。

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アクセサリー製品 (4)

Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

AmpliSeq for Illumina RNA Panels(AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom RNA PanelまたはCommunity RNA Panelsなど)で作業する場合、全RNAをcDNAに変換するための反応ミックスと酵素ブレンドが含まれます。反応の数はパネルによって異なります(例:AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom Panelについては1キットあたり100反応、AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panelについては1キットあたり200反応)。

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AmpliSeq™ for Illumina® Sample ID Panel

20019162

AmpliSeq Library PLUS for Illuminaとペアにすると、96反応に十分な8つの一塩基多型(SNP)ターゲットプライマーペアと1つの性差別プライマーペアが含まれます。迅速かつ正確なサンプル同定を可能にします。ライブラリー調製、プローブパネル、インデックスアダプターは別途ご購入ください。

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AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

AmpliSeq for Illuminaプロトコールを使用したライブラリー構築のために、非染色スライドマウントFFPE組織からDNAを調製するための24の反応を含み、脱パラフィンやDNA精製は必要ありません。

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

AmpliSeq for Illuminaライブラリーをシーケンス用に調製する場合のライブラリーノーマライゼーション用のビーズと試薬が含まれます。

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製品名

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単価

NovaSeq Xシリーズのご購入

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。

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