AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel

Method	Targeted RNA Sequencing, mRNA Sequencing, Exome Sequencing
Specialized sample types	Blood, FFPE Tissue
Variant class	Transcript variants
アッセイ時間	6時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない）
アンプリコン数	1プール
インプット量	RNA 1～100 ng（推奨量10 ng）
コンテンツ仕様	ヒトRefSeq遺伝子の95%超、20,802遺伝子、ヒトトランスクリプトームをキャプチャー
システム	NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System
テクノロジー	イルミナシーケンサー
ハンズオンタイム	<1.5時間
マルチプレックス	96のデュアルインデックスの組み合わせ
作用機序	マルチプレックスPCR法
核酸の種類	RNA
生物種	ヒト
説明	配列特異的アンプリコンを使用して、20,000を超えるヒトRefSeq遺伝子の発現レベルを調べます。

Method

Targeted RNA Sequencing, mRNA Sequencing, Exome Sequencing

Specialized sample types

Blood, FFPE Tissue

Variant class

Transcript variants

アッセイ時間

6時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない）

アンプリコン数

1プール

インプット量

RNA 1～100 ng（推奨量10 ng）

コンテンツ仕様

ヒトRefSeq遺伝子の95%超、20,802遺伝子、ヒトトランスクリプトームをキャプチャー

システム

NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System

テクノロジー

イルミナシーケンサー

ハンズオンタイム

<1.5時間

マルチプレックス

96のデュアルインデックスの組み合わせ

作用機序

マルチプレックスPCR法

核酸の種類

RNA

生物種

ヒト

説明

配列特異的アンプリコンを使用して、20,000を超えるヒトRefSeq遺伝子の発現レベルを調べます。

	AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel	TruSeq Stranded Total RNA	TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin
Method	Targeted RNA Sequencing, mRNA Sequencing, Exome Sequencing	Whole-Transcriptome Sequencing	Whole-Transcriptome Sequencing
Specialized sample types	Blood, FFPE Tissue	FFPE Tissue	Blood
Variant class	Transcript variants	Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants	Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants
アッセイ時間	6時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない）	11.5時間	11.5時間
アンプリコン数	1プール
インプット量	RNA 1～100 ng（推奨量10 ng）	高品質トータルRNA0.1～1 ug 低品質のサンプルは、さらなる最適化を必要とする場合があります。	0.1～1 ug血液由来高品質精製トータルRNA
コンテンツ仕様	ヒトRefSeq遺伝子の95%超、20,802遺伝子、ヒトトランスクリプトームをキャプチャー	コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー	コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー
テクノロジー	イルミナシーケンサー	イルミナシーケンサー	イルミナシーケンサー
ハンズオンタイム	<1.5時間	5.5時間	5.5時間
作用機序	マルチプレックスPCR法	ビーズベースのrRNA除去、cDNA合成、PCR	ビーズベースのrRNA除去、cDNA合成、PCR
核酸の種類	RNA	RNA	RNA
生物種	ヒト	マウス, ヒト, ラット	マウス, ヒト, ラット
説明	配列特異的アンプリコンを使用して、20,000を超えるヒトRefSeq遺伝子の発現レベルを調べます。	全トランスクリプトームシーケンシング研究用。トータルRNAバージョンは細胞質rRNAを除去し、トータルRNA Goldバージョンは細胞質およびミトコンドリアrRNAを除去します。	血液由来RNAの全トランスクリプトームシーケンシング研究用。細胞質およびミトコンドリアのrRNAおよびグロビンmRNAを除去します。

AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel

Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome

TruSeq Stranded Total RNA

TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin

Method

Targeted RNA Sequencing, mRNA Sequencing, Exome Sequencing

Whole-Transcriptome Sequencing

Specialized sample types

Blood, FFPE Tissue

FFPE Tissue

Blood

Variant class

Transcript variants

Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants

アッセイ時間

6時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない）

11.5時間

アンプリコン数

1プール

インプット量

RNA 1～100 ng（推奨量10 ng）

高品質トータルRNA0.1～1 ug 低品質のサンプルは、さらなる最適化を必要とする場合があります。

0.1～1 ug血液由来高品質精製トータルRNA

コンテンツ仕様

ヒトRefSeq遺伝子の95%超、20,802遺伝子、ヒトトランスクリプトームをキャプチャー

コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー

テクノロジー

イルミナシーケンサー

ハンズオンタイム

<1.5時間

5.5時間

作用機序

マルチプレックスPCR法

ビーズベースのrRNA除去、cDNA合成、PCR

核酸の種類

RNA

生物種

ヒト

マウス, ヒト, ラット

説明

配列特異的アンプリコンを使用して、20,000を超えるヒトRefSeq遺伝子の発現レベルを調べます。

全トランスクリプトームシーケンシング研究用。トータルRNAバージョンは細胞質rRNAを除去し、トータルRNA Goldバージョンは細胞質およびミトコンドリアrRNAを除去します。

血液由来RNAの全トランスクリプトームシーケンシング研究用。細胞質およびミトコンドリアのrRNAおよびグロビンmRNAを除去します。

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