がんにおける構造的異常を同定する
ゲノムの不安定性と染色体異常は、がんにおいて頻繁におこる特徴です。これらの構造的異常を理解することで、がんの病因における洞察を得ることが可能です。染色体異常はがん細胞によく起こる現象で、融合遺伝子、染色体転座、CNVなどが含まれます。
がんにおける染色体異常を同定するために、イルミナではアレイおよびシーケンスベースの手法をご提供します。
RNAシーケンスによる融合遺伝子の解析
融合遺伝子は、染色体転座によっておこるがんでよく見られる染色体異常で、腫瘍形成において重要なドライバーであるとされています。ペアエンドシーケンシング（RNA-Seq）はDNAの両端をシーケンスし、研究者は連続性のない配列を精度よく見極めることができます。
RNA-Seqについてもっと知るメイトペアシーケンスによる構造変化の検出
メイトペアシーケンスは、構造変化を検出するためにデザインされています。大きなDNA断片の両端の配列に特異的な情報がわかることで、がんにおける染色体異常を迅速に検出し、構造変化や染色体ブレイクポイントの包括的な評価を行うことができます。
メイトペアシークエンスについてアレイによるCNVの同定
マイクロアレイは、CNV、コピー数変化を伴わないLOH、低いレベルのモザイク、そしてがんサンプルの異種混合性などを捉えるのに最適です。細胞学的に関連のある数千以上の遺伝子が一度に解析でき、がんにおける染色体変異の包括的な理解を深めることができます。
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参考文献
- International Collaboration for Clinical Genomics (www.iccg.org)
- Cancer Cytogenomics Microarray Consortium (www.cancergenomics.org)