Illumina TruSight FFPE QC Kitは、204 bpアンプリコンをターゲットにしたリアルタイムPCRアッセイを使用して、プロスペクティブDNAサンプルの品質を評価します。
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）サンプルから抽出されたDNAは、固定プロセスによって分解され、シーケンスアプリケーションの品質と有用性が大きく異なる可能性があります。Illumina TruSight FFPE QC Kitは、204 bpアンプリコンをターゲットにしたリアルタイムPCRアッセイを使用して、シーケンス用のFFPE DNAサンプル候補の品質と適合性を評価します。
Illumina TruSight FFPE QC Kitは、DNAサンプルの品質を評価するためにリアルタイムPCRアッセイを使用します。このアッセイは、さまざまなサプライヤーから市販されるキットを使用して抽出されたFFPE DNAと互換性があり、柔軟性に優れています。
各キットは、384反応数に対応するプライマーとリファレンスDNAテンプレートを提供します。このワークフローは、標準的なリアルタイムPCR装置や試薬など、一般的なPCR法を使用した経験のあるラボにとっては馴染みのあるものです。
このワークフローは、さまざまなメーカーのqPCR機器や試薬で実行できる簡単なリアルタイムPCRプロトコールに従っています。
| システム | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq X Plus System, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム |
|---|---|
| 手法 | ターゲットDNAシーケンス, エクソームシーケンス |
| 核酸の種類 | DNA |
| 対応サンプルタイプ | FFPE組織 |
| 生物種カテゴリー | ヒト |
| テクノロジー | シーケンス, リアルタイムPCR |
アッセイには、緑色蛍光色素を含むqPCRマスターミックスを別途購入する必要があります（Thermo Fisher Scientific、カタログ番号 A46012、または同等品）。具体的な推奨事項については、qPCR装置の製造業者にお問い合わせください。
TruSight FFPE QC Kitは、リアルタイムPCRアッセイを使用して、候補DNAサンプルの品質を評価し、下流シーケンスアプリケーションへの適合性を保証します。
FFPEサンプルのシーケンス：はじめに
このウェビナーでは、FFPEサンプルの種類、抽出方法、ライブラリー調製オプションについて紹介し、DNAの劣化や制限を扱うユーザーが経験が浅い場合も、経験豊富なユーザーの場合も、両方にガイダンスを提供します。
TruSight FFPE QC Kit
20139070
TruSight™ FFPE QCキットでは、DNAサンプルの品質評価にリアルタイムPCRアッセイを使用します。
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FFPE組織から、すべての主要バリアントクラスに加え、重要なバイオマーカー（TMB、MSI、HRD）を網羅する大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現します。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSI）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現し、スケーラビリティを強化します。
DNAコンテンツを組み合わせた58遺伝子の腫瘍横断型パネルです。シングルチューブSLIMampワークフローを使用して、ライブラリー調製とターンアラウンドタイムを高速化します。
MPL、JAK2、CALR遺伝子の主要な変異をターゲットにしたロバストなアッセイです。シングルチューブのSLIMampワークフローを使用してライブラリー調製にかかる時間とターンアラウンドタイムを短縮します。
DNAとRNAのコンテンツを組み合わせた腫瘍横断型パネルで、シングルチューブのSLIMampワークフローを利用し、ライブラリー調製とターンアラウンドタイムを高速化します。
ロバストなcfDNAリキッドバイオプシーNGSアッセイ。複数の固形腫瘍タイプを対象に血漿から104の遺伝子を解析します。
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