NextSeq 1000/2000試薬
NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジ形式で提供され、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフローセル構成を備えています。
あらゆる生物種について、トータルRNAから直接miRNAおよびその他の互換性のあるSmall RNAライブラリーを生成するための簡素化された経済的なソリューションです。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
Illumina miRNA Prepは、反応バイアスを最小限に抑え、アダプターダイマーを排除しつつ、ロバストなmiRNA特異的ライブラリー調製を可能にします。分子バーコード(UMI)は、各miRNAに早期段階でタグ付けし、PCRバイアスやシーケンスバイアスを排除します。
Illumina miRNA Prepは、信頼性の高いmiRNA特異的ライブラリー を生成し、反応バイアスを最小限に抑え、低インプットのトータルRNA であってもアダプターダイマーを除去します。
ゲル電気泳動、切り出し、溶出のステップが不要になるため、サンプルロスを大幅に削減し、時間を節約できます。
Illumina miRNA Prepは、最大384のユニークデュアルインデックスを使用して、Illumina MiSeq、NextSeq、およびNovaSeqシーケンスシステムでのハイスループットシーケンスを可能にします。
| アッセイ時間 | 7時間 |
|---|---|
| 説明 | miRNAをキャプチャーするための合理化されたゲルフリーワークフロー |
| ハンズオンタイム | 3時間 |
| インプット量 | RNA 1~500 ng |
| システム | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System, MiSeq i100システム |
| 手法 | miRNAおよびsmall RNAシーケンス |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアルインデックス |
| 核酸の種類 | RNA |
| サンプルタイプの詳細 | 循環miRNAを含むさまざまなサンプルタイプをサポートしています。 |
| 対応サンプルタイプ | 血液, 少量インプットサンプル, FFPE組織 |
| 生物種カテゴリー | ショウジョウバエ, Any species, マウス, ゼブラフィッシュ, ヒト, ラット, 線形動物 |
| ストランド特異性 | ストランド情報あり |
| テクノロジー | シーケンス |
| バリアントクラス | 新規点転写産物 |
96サンプルの場合、Illumina miRNA Prep 96反応ライブラリー調製キット1個とIllumina miRNA UDインデックスプレート1個(A~Dを選択)が必要となります。
Illumina miRNA Prepは、わずか1 ngのトータルRNAインプットを使用して、3時間のハンズオンタイムに加え7時間で、さまざまな種類のサンプルでSmall RNAシーケンスライブラリーを調製できます。
Illumina miRNA Prep (96サンプル)
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 2000 System | P2 XLEAP-SBS (100サイクル) - 96サンプル P3 XLEAP-SBS (100サイクル) - 192サンプル P4 XLEAP-SBS (100サイクル) - 384サンプル (推奨5-10Mリード/サンプル) |
1 x 75 bp |
| MiSeq i100システム | 25M 試薬キット (100サイクル) - 6サンプル |
1 x 75 bp |
RNA-Seqは、次世代シーケンサー(NGS)を使用してトランスクリプトーム全体の発現を解析し、既知または新規の特徴を検出し、RNAを定量化することを可能にします。
miRNAや他の小さなノンコーディングRNAなどの小さなRNA種を単離してシーケンスするか、小さなRNAの発現差異を研究します。
| Illumina miRNA Prep | Illumina Stranded mRNA Prep | TruSeq Small RNA Library Preparation Kit | |
|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | 7時間 | 6.5時間 | 1日 |
| 説明 | miRNAをキャプチャーするための合理化されたゲルフリーワークフロー | 正確なストランド情報を用いたコーディング・トランスクリプトーム解析用のシンプルで費用対効果の高いソリューション | |
| ハンズオンタイム | 3時間 | <3時間 | 4時間 |
| インプット量 | RNA 1~500 ng | 標準品質トータルRNA25~1,000 ng | 1000 ng RNA |
| システム | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System, MiSeq i100システム | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System, NextSeq 500 System |
| 手法 | miRNAおよびsmall RNAシーケンス | mRNAシーケンス | miRNAおよびsmall RNAシーケンス |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアルインデックス | 最大384のユニークデュアルインデックス | 48の固有インデックスが利用可能 |
| 核酸の種類 | RNA | RNA | RNA |
| サンプルタイプの詳細 | 循環miRNAを含むさまざまなサンプルタイプをサポートしています。 | ||
| 対応サンプルタイプ | 血液, 少量インプットサンプル, FFPE組織 | FFPE非対応, 少量インプットサンプル | 少量インプットサンプル |
| 生物種カテゴリー | ショウジョウバエ, Any species, マウス, ゼブラフィッシュ, ヒト, ラット, 線形動物 | 哺乳類, ウシ, マウス, ヒト, ラット | ショウジョウバエ, Any species, マウス, ゼブラフィッシュ, ヒト, ラット, 線形動物 |
| ストランド特異性 | ストランド情報あり | ストランド情報あり | |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス |
| バリアントクラス | 新規点転写産物 | 1塩基変異多型(SNP), 融合遺伝子, 新規点転写産物, 転写産物バリアント | 新規点転写産物, 転写産物バリアント |
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
Illumina miRNA Prepケミストリー
アダプターは5'末端と3'末端にライゲーションされ、miRNAの優先的な増幅を確実にします。分子バーコード(UMI)は、逆転写(RT)ステップ中に統合され、デジタル定量化と増幅バイアスの補正を可能にします。迅速でビーズベースのクリーンアップは、ゲル精製に代わるものであり、ワークフローをわずか7時間に簡素化します。
Illumina miRNA PrepとTruSeq Small RNAワークフローの比較
Illumina miPrep mRNA Prepは、ゲル電気泳動と精製が無いため、TruSeq Small RNAと比較してハンズオンタイムが短縮され、ワークフローが迅速化します。
UMIを用いたバイアスのないmiRNA定量
ワークフローの早い段階で分子バーコード(UMI)を組み込むことで、ほとんどのシーケンスリードは固有のmiRNAにマッピングされ、アダプターダイマーによるバイアスが最小限に抑えられます。
血清サンプルにおけるロバストなmiRNA検出
Illumina miRNA Prepは、血清などの生体液中で再現性のあるロバストなmiRNA検出を実現します。(A)複製血清サンプルからのmiRNAの検出。(B)複製血清サンプルからのアダプターダイマーと比較した、マップされたmiRNAのリード。
Illumina miRNA Prep (96 samples)
20145030
ライブラリー調製用の試薬がすべて含まれ、インデックスは含まれません
List Price:
Discounts:
Illumina miRNA Indexes Set A (96 Indexes, 96 Samples)
20145031
96のユニークデュアルインデックス、セットA
List Price:
Discounts:
Illumina miRNA Indexes Set B (96 Indexes, 96 Samples)
20145032
96のユニークデュアルインデックス、セットB
List Price:
Discounts:
Illumina miRNA Indexes Set C (96 Indexes, 96 Samples)
20145033
96のユニークデュアルインデックス、セットC
List Price:
Discounts:
Illumina miRNA Indexes Set D (96 Indexes, 96 Samples)
20145034
96のユニークデュアルインデックス、セットD
List Price:
Discounts:
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製品名
数量
単価
製品名
カタログ番号
量
単価
Illumina miRNA Prepは、細胞、FFPE組織、血清/血漿、および事実上あらゆる生物種の新鮮/凍結組織から単離されたトータルRNAと互換性があります。
miRNAの濃縮は必要ありません。Illumina miRNA PrepはトータルRNAから開始します。
いいえ、Illumina miRNA PrepはIllumina miRNA UDインデックスプレートA~Dと連動するように設計されており、他のIllumina RNA UDIプレートとは互換性がありません。
このキットは、18~40塩基のsmall RNAをキャプチャーすることに最適化されています。Illumina miRNA Prepと互換性のあるその他のsmall RNAには、 PIWA相互作用RNA(piRNA)、短鎖干渉RNA(siRNA)、トランスファーRNA由来Small RNA(tsRNA)があります。
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