Illumina miRNA Prep 

あらゆる生物種について、トータルRNAから直接miRNAおよびその他の互換性のあるSmall RNAライブラリーを生成するための簡素化された経済的なソリューションです。

7時間

アッセイ時間

3時間

ハンズオンタイム

RNA 1~500 ng

インプット量

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概要

Illumina miRNA Prepは、反応バイアスを最小限に抑え、アダプターダイマーを排除しつつ、ロバストなmiRNA特異的ライブラリー調製を可能にします。分子バーコード(UMI)は、各miRNAに早期段階でタグ付けし、PCRバイアスやシーケンスバイアスを排除します。

主な特長

  • ワークフローの改善により、ゲル精製の必要性がなくなるため、時間を節約し、サンプルロスを減らすことができます。

  • 少量のRNAであっても、ライブラリー調製の強化によりアダプターダイマー形成を効果的に防止します。

  • バイアスやバックグラウンド干渉を低減しながら、高品質のmiRNAターゲットライブラリーを作製します。

  • 循環miRNAバイオマーカーの検出に不可欠な超低インプットレベルに最適化されています。

  • 次世代シーケンサーを使用し、成熟miRNAのバイアスのない正確な定量を行うためにUMIを内蔵しています。

ロバストな性能

Illumina miRNA Prepは、信頼性の高いmiRNA特異的ライブラリー を生成し、反応バイアスを最小限に抑え、低インプットのトータルRNA であってもアダプターダイマーを除去します。 

ワークフローの最適化

ゲル電気泳動、切り出し、溶出のステップが不要になるため、サンプルロスを大幅に削減し、時間を節約できます。

ハイスループット機能

Illumina miRNA Prepは、最大384のユニークデュアルインデックスを使用して、Illumina MiSeq、NextSeq、およびNovaSeqシーケンスシステムでのハイスループットシーケンスを可能にします。

仕様

必要な製品

96サンプルの場合、Illumina miRNA Prep 96反応ライブラリー調製キット1個とIllumina miRNA UDインデックスプレート1個(A~Dを選択)が必要となります。

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アプリケーション

Illumina miRNA Prepは、わずか1 ngのトータルRNAインプットを使用して、3時間のハンズオンタイムに加え7時間で、さまざまな種類のサンプルでSmall RNAシーケンスライブラリーを調製できます。  

ワークフローの例

1
ライブラリー調製

Illumina miRNA Prep (96サンプル) 

プロジェクトの推奨事項

装置 推奨サンプル数 リード長
NextSeq 2000 System

P2 XLEAP-SBS (100サイクル) - 96サンプル

P3 XLEAP-SBS (100サイクル) - 192サンプル 

P4 XLEAP-SBS (100サイクル) - 384サンプル

(推奨5-10Mリード/サンプル) 

1 x 75 bp

MiSeq i100システム

25M 試薬キット (100サイクル) - 6サンプル

1 x 75 bp

関連するアプリケーションと手法

ドキュメント

製品資料

比較する

Illumina miRNA Prep  Illumina Stranded mRNA Prep TruSeq Small RNA Library Preparation Kit
アッセイ時間 7時間 6.5時間 1日
説明 miRNAをキャプチャーするための合理化されたゲルフリーワークフロー 正確なストランド情報を用いたコーディング・トランスクリプトーム解析用のシンプルで費用対効果の高いソリューション
ハンズオンタイム 3時間 <3時間 4時間
インプット量 RNA 1~500 ng 標準品質トータルRNA25~1,000 ng 1000 ng RNA
システム NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System, MiSeq i100システム NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System, NextSeq 500 System
手法 miRNAおよびsmall RNAシーケンス mRNAシーケンス miRNAおよびsmall RNAシーケンス
マルチプレックス 最大384のユニークデュアルインデックス 最大384のユニークデュアルインデックス 48の固有インデックスが利用可能
核酸の種類 RNA RNA RNA
サンプルタイプの詳細 循環miRNAを含むさまざまなサンプルタイプをサポートしています。
対応サンプルタイプ 血液, 少量インプットサンプル, FFPE組織 FFPE非対応, 少量インプットサンプル 少量インプットサンプル
生物種カテゴリー ショウジョウバエ, Any species, マウス, ゼブラフィッシュ, ヒト, ラット, 線形動物 哺乳類, ウシ, マウス, ヒト, ラット ショウジョウバエ, Any species, マウス, ゼブラフィッシュ, ヒト, ラット, 線形動物
ストランド特異性 ストランド情報あり ストランド情報あり
テクノロジー シーケンス シーケンス シーケンス
バリアントクラス 新規点転写産物 1塩基変異多型(SNP), 融合遺伝子, 新規点転写産物, 転写産物バリアント 新規点転写産物, 転写産物バリアント

選択ツール:

Illumina miRNA Prep chemistry

Illumina miRNA Prepケミストリー

アダプターは5'末端と3'末端にライゲーションされ、miRNAの優先的な増幅を確実にします。分子バーコード(UMI)は、逆転写(RT)ステップ中に統合され、デジタル定量化と増幅バイアスの補正を可能にします。迅速でビーズベースのクリーンアップは、ゲル精製に代わるものであり、ワークフローをわずか7時間に簡素化します。

Illumina miRNA Prep and TruSeq Small RNA workflow comparison

Illumina miRNA PrepとTruSeq Small RNAワークフローの比較

Illumina miPrep mRNA Prepは、ゲル電気泳動と精製が無いため、TruSeq Small RNAと比較してハンズオンタイムが短縮され、ワークフローが迅速化します。

Unbiased miRNA quantification using UMIs

UMIを用いたバイアスのないmiRNA定量

ワークフローの早い段階で分子バーコード(UMI)を組み込むことで、ほとんどのシーケンスリードは固有のmiRNAにマッピングされ、アダプターダイマーによるバイアスが最小限に抑えられます。

Robust miRNA detection in serum samples

血清サンプルにおけるロバストなmiRNA検出

Illumina miRNA Prepは、血清などの生体液中で再現性のあるロバストなmiRNA検出を実現します。(A)複製血清サンプルからのmiRNAの検出。(B)複製血清サンプルからのアダプターダイマーと比較した、マップされたmiRNAのリード。

ライブラリー調製 (1)

Illumina miRNA Prep (96 samples)

20145030

ライブラリー調製用の試薬がすべて含まれ、インデックスは含まれません

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インデックスアダプター (4)

Illumina miRNA Indexes Set A (96 Indexes, 96 Samples)

20145031

96のユニークデュアルインデックス、セットA

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Illumina miRNA Indexes Set B (96 Indexes, 96 Samples)

20145032

96のユニークデュアルインデックス、セットB

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Illumina miRNA Indexes Set C (96 Indexes, 96 Samples)

20145033

96のユニークデュアルインデックス、セットC

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Illumina miRNA Indexes Set D (96 Indexes, 96 Samples)

20145034

96のユニークデュアルインデックス、セットD

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よくある質問

Illumina miRNA Prepは、細胞、FFPE組織、血清/血漿、および事実上あらゆる生物種の新鮮/凍結組織から単離されたトータルRNAと互換性があります。 

miRNAの濃縮は必要ありません。Illumina miRNA PrepはトータルRNAから開始します。

いいえ、Illumina miRNA PrepはIllumina miRNA UDインデックスプレートA~Dと連動するように設計されており、他のIllumina RNA UDIプレートとは互換性がありません。

このキットは、18~40塩基のsmall RNAをキャプチャーすることに最適化されています。Illumina miRNA Prepと互換性のあるその他のsmall RNAには、 PIWA相互作用RNA(piRNA)、短鎖干渉RNA(siRNA)、トランスファーRNA由来Small RNA(tsRNA)があります。

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NextSeq 1000/2000試薬

NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジ形式で提供され、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフローセル構成を備えています。

MiSeq i100 シリーズ用‭ 試薬キット

MiSeq i100シリーズ用試薬は、使いやすいカートリッジと、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフロー セル構成を備えています。

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