Pillar oncoReveal Fusion LBx Panel

ロバストなcfRNAリキッドバイオプシーNGSアッセイ。複数の固形腫瘍タイプを対象に血漿から83の融合遺伝子を解析します。

サンプルからレポートまで48時間

アッセイ時間

約3時間

ハンズオンタイム

10~30 ng cfRNA

インプット量

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概要

Pillar oncoReveal Fusion LBx Panelは、血漿から分離されたセルフリーRNA(cfRNA)を使用して、複数の固形腫瘍タイプに関連する18種類のドライバー遺伝子および80種類以上の融合パートナー遺伝子を解析するよう設計されたロバストなNGSアッセイです。

主な特長

  • サンプルからレポートまで48時間以内の迅速なワークフローに対応

  • RNA量が限られている場合やサンプル品質が低い場合でも、UID(一意識別子)を使用せずに高感度かつロバストな融合遺伝子検出を実現

  • ラボ効率を改善し「ノーコール」率を削減

このフォーカスパネルは、血漿から分離された融合転写産物(cfRNA)に由来する遺伝子再構成を検出することができます。

このアッセイは、効率的に1本のチューブでターゲット濃縮を行うタイル状アンプリコンに基づくライブラリー調製手法である独自のStem Loop Inhibition-Mediated Amplification(SLIMamp)テクノロジーを採用しています。

このワークフローは、社内のNGSラボで実施可能な単一チューブのタイル方式の増幅であるため、サンプルと結果をラボで管理できます。 

仕様

必要な製品

Pillar oncoReveal Fusion LBx Panelでは、Pillar Index Kit、シーケンス試薬、PiVAT二次解析ソフトウェアも使用する必要があります。追加のバリアント解釈が必要な場合は、Illumina Connected Insightsをご使用ください。

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アプリケーション

Pillar oncoReveal Fusion LBx Panelは、血漿から分離したcfRNAを用いて複数の固形がん種を解析し、約3時間のハンズオンタイムで10時間以内に処理を完了します。 

ワークフローの例

関連するアプリケーションと手法

ドキュメント

製品資料
サポートドキュメント

この製品では専用サポートセクションは現在ご利用いただけません

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Pillar oncoReveal Fusion LBx Panel TruSight Oncology 500 ctDNA v2 Pillar oncoReveal Core LBx Panel Pillar oncoReveal Essential LBx Panel
アッセイ時間 サンプルからレポートまで48時間 精製された核酸からバリアントレポートまで<4日 サンプルからレポートまで48時間 サンプルからレポートまで48時間
がんの種類 汎がん (Pan-cancer), 固形腫瘍 汎がん (Pan-cancer), 固形腫瘍 汎がん (Pan-cancer), 固形腫瘍 汎がん (Pan-cancer), 固形腫瘍
コンテンツ仕様 18のドライバー遺伝子と83のパートナー 合計1.94 Mbのパネルサイズに対する523遺伝子(完全コード配列)をターゲットとして選択。
• 免疫腫瘍学バイオマーカーのカバレッジ:TMBおよびMSI
• ガイドラインの適用範囲:複数の固形腫瘍タイプに関する主要ガイドラインを幅広く網羅
• 臨床試験のカバレッジ:600件を超える臨床試験(2023年2月現在、Pierian臨床ナレッジベースに基づく)
104の遺伝子に446のアンプリコン 34の遺伝子に200のアンプリコン
説明 Pillar oncoReveal Fusion LBx Panelは、18のドライバー遺伝子からの融合転写物を、複数の固形腫瘍種にわたる80を超える関連パートナーと共に解析するロバストなcfRNAリキッドバイオプシー用NGSアッセイです。 液体生検サンプル(血漿からのctDNA)の包括的ゲノムプロファイリングにより、がん研究アプリケーション用の固形腫瘍のプロファイリングのための非侵襲的方法を提供します。この液体生検アプローチは、組織ベースのCGPを補完する低侵襲性サンプル収集アプローチを使用して、腫瘍内および腫瘍間の不均一性に関する洞察を提供します。 Pillar oncoReveal Core LBx Panelは、複数の固形腫瘍種にわたる104の対象遺伝子から446のターゲット領域を解析するロバストなcfDNAリキッドバイオプシー用NGSアッセイです。 Pillar oncoReveal Essential LBx Panelは、複数の固形腫瘍種にわたる34の対象遺伝子から200のターゲット領域を解析するロバストなcfDNAリキッドバイオプシー用NGSアッセイです。
ハンズオンタイム 約3時間 ライブラリー調製および濃縮時間約2.5時間 約3時間 約3時間
インプット量 10~30 ng cfRNA cfDNA 20 ng(血漿4 ml) cfDNA 10~30 ng cfDNA 10~30 ng
システム MiSeqDx システム 研究(RUO)モード, NextSeq 550Dx システム研究(RUO)モード, MiSeq i100システム NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000Dx システム研究(RUO)モード, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム NextSeq 550システム, NextSeq 550Dx システム研究(RUO)モード NextSeq 550システム, MiSeqDx システム 研究(RUO)モード, NextSeq 550Dx システム研究(RUO)モード, MiSeq i100システム
作用機序 タイルアンプリコンを使用したマルチプレックスPCR法 ハイブリッドキャプチャーケミストリー タイルアンプリコンを使用したマルチプレックスPCR法 タイルアンプリコンを使用したマルチプレックスPCR法
手法 アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス ターゲットDNAシーケンス, ターゲット濃縮 ターゲットDNAシーケンス, アンプリコンシーケンス ターゲットDNAシーケンス, アンプリコンシーケンス
核酸の種類 RNA DNA DNA DNA
アンプリコン数 プール1:83アンプリコン プール1:446アンプリコン プール1:200アンプリコン
反応数 1キットあたりの反応24回 1キットあたりの反応24回 1キットあたりの反応24回
対応サンプルタイプ Cell-free RNA 血中循環腫瘍DNA, 血液 セルフリーDNA セルフリーDNA
生物種カテゴリー ヒト ヒト ヒト ヒト
ストランド特異性 ストランド情報なし
ターゲットインサートサイズ 80 bp 80 bp 90 bp
テクノロジー シーケンス シーケンス シーケンス シーケンス
バリアントクラス 融合遺伝子 1塩基変異(SNV), 挿入 欠失(Indel), コピー数バリアント(CNV) 1塩基変異(SNV), 挿入 欠失(Indel), コピー数バリアント(CNV), 血液マイクロサテライト不安定性(bMSI) 1塩基変異(SNV), 挿入 欠失(Indel), コピー数バリアント(CNV), 血液マイクロサテライト不安定性(bMSI)

選択ツール:

遺伝子リスト

Pillar oncoReveal Fusion LBx Panelには、18種類のドライバー遺伝子と83種類のパートナー遺伝子が含まれています。

パネル仕様

Pillar oncoReveal Fusion LBx Panelの血漿からのcfRNA解析に関する仕様。

ライブラリー調製 (3)

oncoReveal Fusion LBx 24 Rxn

HLA-HS-1005-24

18 gene (24 sample) liquid biopsy cfRNA panel on SLIMamp™ workflow

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Pillar Biosciences LBx Indexing Kit A

IDX-PI-1013-96

Index kit for oncoReveal cfDNA/cfRNA panels

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Pillar Biosciences LBx Indexing Kit B

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