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TruSeq DNA PCR-Free

複雑なゲノムを正確かつ包括的にカバーする、シンプルで包括的な全ゲノムシーケンス（WGS）ライブラリー調製。

合計アッセイ時間5時間

アッセイ時間

4時間

ハンズオンタイム

DNA 1 ug

インプット量

仕様タブで詳細を確認する

イルミナDNA PCR-Free Prep が利用可能になりました。このライブラリー調製キットは、TruSeq DNA PCR-Freeと同等の性能を実現し、ターンアラウンドタイムとハンズオンタイムを削減します。

概要

TruSeq DNA PCR-Freeは、全ゲノムシーケンスアプリケーションのためのシンプルで包括的なライブラリー調製を提供します。研究者は、バクテリアなどの小さなゲノムからヒトの全ゲノムまで、多種多様な生物のシーケンスを行うことができます。ワークフローには以下の機能があります。

  • PCRの必要性を排除するゲルフリーワークフローの短縮

  • 困難な領域をシーケンスする能力

  • ゲノムの深い洞察を得るための優れたカバレッジ品質

難易度の高い領域のシーケンス

TruSeq DNA PCR-Freeは、GCが豊富な領域、プロモーター、反復的なコンテンツなど、従来シーケンスが困難な領域に対して優れたカバレッジを提供します。

ワークフローはさまざまなリード長に調整可能で、イルミナのすべてのシーケンス装置でサポートされています。これにより、研究者は各ランを実験のニーズに合わせて調整することができます。

ゲノムに対する深い洞察を得る

PCRフリーは、ライブラリーのバイアスとギャップを低減することを意味します。その結果、ゲノム全体で高いデータ品質と最適なバリアント検出が実現します。優れたゲノムカバレッジ品質は、結果のギャップがほとんどなく、GCが豊富な領域を良好にカバーできることを意味します。

PCRフリープロトコールで時間を節約

PCRの除去は時間を節約し、PCRステップに関連するゲノムカバレッジバイアスを取り除きます。ビーズベースのサイズ選択によりワークフローが短縮されます。イルミナのシーケンスシステムと並行して、TruSeq DNA PCR-Freeは、広く採用されているライブラリー調製ワークフローに幅広い機能強化を提供します。

柔軟なスループットオプションへのアクセス

  • TruSeq DNA PCR-Free with Single Indexesは、ロースループット（LT）研究用の24サンプル手動処理をサポートします。
  • TruSeq DNA PCR-Free with 96 CD Indexesは、ハイスループット（HT）研究用の96サンプル処理をサポートし、液体処理ロボットで自動化（または手動で処理）できます。
  • IDT for Illumina Unique Dual (UD) Indexes （24または96）により、リードを正確に割り当て、フローセルを効率的に使用することができるようになります。

高速で自動化に適したワークフロー

イルミナシーケンス用のライブラリーを1日で調製します。イルミナの認定メソッドは、 当社のパートナーを通じて、さまざまな自動化プラットフォームで利用できます。

仕様

アッセイ時間 合計アッセイ時間5時間
自動化機能 自動液体分注システム
自動化の詳細 利用可能な自動化方法を見る
説明 ゲノムの困難な領域を配列解析できる、全ゲノムシーケンスのためのシンプルで包括的なPCR-Free Prep。
ハンズオンタイム 4時間
インプット量 DNA 1 ug
システム MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, MiniSeq System, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム
作用機序 メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローはPCRフリー、ゲルフリー。
手法 シーケンスによるジェノタイピング, 全ゲノムシーケンス, ショットガンシーケンス
マルチプレックス 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル（CD）、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル（UD）の組み合わせ
核酸の種類 DNA
特殊なサンプルタイプ FFPE非対応
生物種カテゴリー その他, 哺乳類, マウス, ヒト, ラット, 植物
生物種詳細 ほとんどの大きなDNAゲノムに対応。
ターゲットインサートサイズ 350 bpまたは550 bp
テクノロジー イルミナシーケンサー
バリアントクラス 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV）

必要な製品

イルミナは、お客様のワークフローを柔軟にするモジュラー式の注文製品方式を採用しています。以下のインデックス付きのライブラリー調製製品をご注文いただけます。 

/ 件

アプリケーション

ワークフローの例

1
ライブラリー調製
2
シーケンス
3
解析

プロジェクトの推奨事項

装置 推奨サンプル数 リード長
NextSeq 550 System

1 sample per run (based on 30× coverage of a human genome) 

350 bpインサート：≤ 2 × 100 bp
550 bpインサート：≤ 2 × 150 bp
NovaSeq 6000システム

Samples per run (dual flow cell): S1: 8, S2: 16, S4: 48 (based on 30× coverage of a human genome) 

350 bpインサート：≤ 2 × 150 bp
550 bpインサート：≤ 2 × 150 bp

関連するアプリケーションとメソッド

大規模全ゲノムシーケンス

大規模全ゲノムシーケンスは、疾患研究および集団ゲノム研究に役立ち、疾患関連アリルを明らかにします。

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本製品の用途例
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Max Planck InstituteとUniversity of Pennsylvaniaの研究者たちは、猫の希少疾患の遺伝的原因を明らかにするためにNextSeq 500システムを使用して、Lil Bubのゲノムシーケンスに資金を提供しています。

ドキュメント

製品資料
Support documentation

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TruSeq DNA PCR-Free Illumina DNA PCR-Free Prep Illumina DNA Prep TruSeq DNA Nano
アッセイ時間 合計アッセイ時間5時間 約1.5時間 約3～4時間（DNA抽出からライブラリーのノーマライズまで） 合計アッセイ時間約6時間
自動化機能 自動液体分注システム 自動液体分注システム 自動液体分注システム 自動液体分注システム
自動化の詳細 利用可能な自動化方法を見る 利用可能な自動化方法を見る 利用可能な自動化方法を見る 利用可能な自動化方法を見る
説明 ゲノムの困難な領域を配列解析できる、全ゲノムシーケンスのためのシンプルで包括的なPCR-Free Prep。 PCRフリーケミストリーとオンビーズタグメンテーションのユニークな組み合わせを使用して、高感度アプリケーション用のシーケンスライブラリーを調製します。これにより、PCRによるバイアスを排除すると同時に、ライブラリー調製の合計時間が90分に短縮されます。 さまざまなサンプルタイプとDNAインプット量に対応する迅速で柔軟なライブラリー調製ワークフローにより、ヒトから微生物の全ゲノムシーケンスまで、幅広いアプリケーションにアクセスできます。  高いゲノムカバレッジ品質とバイアスの低減を実現するローインプット研究法。
ハンズオンタイム 4時間 約45分 1〜1.5時間 約4時間
インプット量 DNA 1 ug 25 ng 〜 300 ng 小さなゲノム（微生物など）の場合はDNA 1～500 ng、大きなゲノム（ヒトなど）の場合はDNA 100～500 ng。（血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください）。 100 ng ゲノムDNA
システム MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, MiniSeq System, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, 研究（RUO）モードのNextSeq 550Dx システム, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム MiSeq System, iSeq 100システム, NextSeq 550 System, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, MiniSeq System, 研究（RUO）モードのNextSeq 550Dx システム, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, MiniSeq System, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム
作用機序 メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローはPCRフリー、ゲルフリー。 ビーズ結合トランスポソーム ビーズ結合トランスポソーム メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローでは、低バイアスPCRを使用し、ゲルフリーです。
手法 シーケンスによるジェノタイピング, 全ゲノムシーケンス, ショットガンシーケンス 全ゲノムシーケンス, de novoシーケンス アンプリコンシーケンス, 全ゲノムシーケンス, de novoシーケンス, ショットガンシーケンス シーケンスによるジェノタイピング, 全ゲノムシーケンス, ショットガンシーケンス
マルチプレックス 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル（CD）、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル（UD）の組み合わせ 最大384プレックス 最大384のユニークデュアル（UD）の組み合わせと96のコンビナトリアルデュアル（CD）の組み合わせ 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル（CD）、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル（UD）の組み合わせ
核酸の種類 DNA DNA DNA DNA
特殊なサンプルタイプ FFPE非対応 血液, FFPE非対応, 少量インプットサンプル, 唾液, FFPE非対応 血液, FFPE非対応, 唾液 FFPE非対応, 少量インプットサンプル
生物種カテゴリー その他, 哺乳類, マウス, ヒト, ラット, 植物 すべて, ヒト ショウジョウバエ, すべて, 哺乳類, マウス, 酵母, ゼブラフィッシュ, ヒト, ラット, 植物, ウイルス, 線形動物, 細菌 その他, 哺乳類, マウス, ヒト, ラット, 植物
生物種詳細 ほとんどの大きなDNAゲノムに対応。 任意の種に対応 ほとんどの大きなDNAゲノムに対応。
ターゲットインサートサイズ 350 bpまたは550 bp 450 bp +/- 75 bp 約350 bp 350 bpまたは550 bp
テクノロジー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー
バリアントクラス 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） ショートタンデムリピート（STR）, 1塩基変異多型（SNP）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV）

選択ツール：

ライブラリー調製＆アレイキットセレクター

ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングでき、キットの比較や共有も可能です。

ライブラリー調製 (2)

TruSeq DNA PCR-Free Low Throughput Library Prep Kit (24 samples)

20015962

24ライブラリー調製用の試薬とサンプル精製ビーズが含まれます。インデックスアダプターは別売りです。

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Discounts:

TruSeq DNA PCR-Free High Throughput Library Prep Kit (96 samples)

20015963

24ライブラリー調製用の試薬とサンプル精製ビーズが含まれます。インデックスアダプターは別売りです。

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インデックスアダプター (1)

IDT for Illumina – TruSeq DNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)

20040870

96サンプルのラベリングに十分な96個の8 bpのインデックスを含み、TruSeq NanoおよびTruSeq PCR-Free Library Prep Kitと互換性があります。バージョン2には、プレート20022370内の192のインデックスオリゴのうち8つの改善が含まれており、残りの184は変更されていません。ライブラリー調製およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina DNA PCR-Free Prep

高感度シーケンスアプリケーション用の高精度データが得られる、効率的で高速な統合ライブラリー調製ワークフロー。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを準備するための、高速で統合されたワークフロー。

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