NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
Illumina DNA Prep with Enrichment（旧称Nextera Flex for Enrichment）は、Illuminaのライブラリー調整ポートフォリオの中で最も高速で柔軟なDNAのターゲットシーケンスソリューションを提供します。
Illumina DNA Prep with Enrichment
幅広いアプリケーションに対応する完全なターゲットリシーケンスソリューションは、迅速な統合ワークフローとカスタムおよび固定エンリッチメントパネルの選択肢を取り揃えています。
約6.5時間
アッセイ時間
約2時間
ハンズオンタイム
高品質ゲノムDNA 10～1,000 ng、FFPE DNA 50～1,000 ng （血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください）。
インプット量
概要
Illumina DNA Prep製品ライン
幅広いアプリケーションで使用できる、高速で最適化されたシーケンスライブラリー調製ソリューションを見つけましょう。
Illumina DNA Prep with Enrichment
オンビーズタグメンテーションとターゲットシーケンスアプリケーションのための単一のハイブリダイゼーションプロトコールを組み合わせた、高速で統合されたDNAベースのライブラリー調製およびエンリッチメントワークフロー。
全ヒトゲノムシーケンス、アンプリコン、プラスミド、微生物ゲノムなど、幅広いアプリケーション用の高速かつ統合されたライブラリー調製ワークフロー。
ヒト全ゲノムシーケンスや腫瘍／正常シーケンスなどの高感度アプリケーション用の高性能で迅速な統合PCRフリー ライブラリー調製ワークフロー。
仕様
| アッセイ時間 | 約6.5時間 |
|---|---|
| Automation capability | Liquid handling robot(s) |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る |
| Content specifications |
Custom: 0.5 - 15 Mb genomic content of interest, with Illumina Custom Enrichment Panels and Illumina Custom Enrichment Panel v2 Fixed panels: Content varies by panel. |
| 説明 | 低いDNAインプットやさまざまなサンプルタイプから、全エクソーム、カスタム、固定パネルターゲットシーケンスなど、さまざまな実験用のシーケンスライブラリーを約6.5時間で調製します。 |
| ハンズオンタイム | 約2時間, 約2時間 |
| インプット量 | 高品質ゲノムDNA 10～1,000 ng、FFPE DNA 50～1,000 ng （血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください）。 |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソームおよびハイブリッドキャプチャー化学 |
| 手法 | Custom sequencing, Targeted DNA sequencing, Exome sequencing, Target enrichment |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアルインデックスを使用可能。最大12プレックスの濃縮前プーリングをテスト。 |
| Nucleic acid type | DNA |
| 反応数 | カスタムワークフロー：16または96サンプル |
| オンターゲットリード | エクソームパネルでは≥85%（サンプルデータセットの結果。実際のパフォーマンスは異なる場合があります） |
| Specialized sample types | Blood, Low-input samples, FFPE tissue, Saliva |
| Species category | Other, ヒト |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| 均一性 | 90%以上（4 Gbで20xのカバレッジ、エクソームパネルの場合） |
| バリアントクラス | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
必要な製品
Illumina DNA Prep and Enrichmentキットには、Illumina DNA/RNA UD Indexes Setを使用する必要があります。デュアルインデックスが推奨されます。
パネルとプローブはオプションです。別途ご注文ください。
Flex Lysis Kitは血液DNA抽出を補完します。
Infinium FFPE QC Kitは、FFPEサンプルの適格性確認に必要です。
Infinium MIDI Heatblock Insertは、SciGene Hybexマイクロヒートシステムを使用する際に必要です。
Illumina Free Adapter Blocking Reagent（オプション）は、インデックスホッピングレベルを下げるために使用されます。
Illumina Purification Beadsは、DNA精製やビーズ/サンプル比に基づくDNA断片のサイズ選択に使用されます。
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件
アプリケーション
Illumina DNA Prep with Enrichmentは、汎用性が高く、シンプルで高速なライブラリー調製と、幅広いDNAインプットおよびサンプルタイプからの濃縮を組み合わせ、カスタムパネル、固定パネル、および全エクソームパネルを含む幅広いターゲット濃縮アプリケーションをサポートします。
ワークフローの例
ライブラリー調製
Illumina DNA Prep with Enrichment
プロジェクトの推奨事項
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| iSeq 100 System | TruSight Cancer: 4 samples per run (based on 280× mean targeted coverage; 99% target coverage at 20×) |
2 x 100 bp |
| MiniSeq System | TruSight Cancer (samples per run): mid output: 8, high output: 25 (based on 280× mean targeted coverage; 99% target coverage at 20×) |
2 x 100 bp |
| MiSeq System | TruSight Cancer (samples per run): v2 reagents: 15, v3 reagents: 25 (based on 280× mean targeted coverage; 99% target coverage at 20×) |
2 x 100 bp |
| NextSeq 550 System | Exome (samples per run): mid output: 5, high output: 16 (based on 50× mean targeted coverage; 90% target coverage at 20×) |
2 x 100 bp |
| NovaSeq 6000 System | Exome (samples per run, by flow cell type): S1: 128, S2: 164, S4: 400 (based on 50× mean targeted coverage; 90% target coverage at 20×; S4 limited by available indexes) |
2 x 100 bp |
関連するアプリケーションとメソッド
ターゲットリシーケンスでは、遺伝子のサブセットまたはゲノム領域を単離しシーケンスすることで、ラボのリソースを節約できます。
イルミナのシーケンステクノロジーとマイクロアレイテクノロジーは、DNAからRNA解析、エピジェネティクスなど、がんゲノム研究の応用分野を幅広くサポートしています。
様々な複雑な遺伝的疾患の研究を加速する、アレイおよび次世代シーケンスの包括的ソリューション。
本製品の用途例
ドキュメント
製品資料
Support documentation
- Illumina DNA Prep with Enrichment消耗品および機器
- Illumina Adapter Sequences
- Illumina DNA Prep with Enrichmentリファレンスガイド
- Index Adapters Pooling Guide
- 尿病原体ID/AMRパネルの文書
- エンリッチメントBaseSpaceアプリのドキュメント
- イルミナアダプター配列
- Illumina DNA Prep with Enrichmentチェックリスト
- 尿病原体ID/AMRパネルリファレンス
- Illumina DNA Prep with Enrichment Documentation
- All Illumina DNA RNA UD Indexes Support
比較する
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
図
イルミナのオンビーズタグメンテーションケミストリー
eBLTによって媒介される均一なタグメンテーション反応とそれに続く単一のハイブリダイゼーション反応により、迅速かつ柔軟なワークフローが実現します。
エンリッチメントパネルの互換性
Illumina DNA Prep with Enrichmentは、さまざまなイルミナエンリッチメントパネルと互換性があり、低スループット、中スループット、ハイスループットのシステムでの使用向けに最適化されています。
高いカバレッジ均一性とパッド入りリードエンリッチメント
Illumina DNA Prep with Enrichmentは、カスタムパネル、固定パネル、エクソームパネルに高いカバレッジ均一性とオンターゲットのパッド入りリードエンリッチメントを提供します。
正確なバリアントコーリング
Illumina DNA Prep with Enrichmentは、（A、B）細胞株のFFPEコントロールヒトリファレンスDNAサンプルと（C、D）実世界のFFPEサンプルに、オーソロガスシーケンスアッセイで得られた頻度と有意な相関を示すバリアント頻度が観察された、少量の体細胞バリアントコーリングを提供します。
ライブラリー調製 (4)
Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)
20025524
96ライブラリー（8、12プレックスエンリッチメント反応）を調製および濃縮するための試薬が含まれます。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)
20025523
16のライブラリー（16、1プレックスエンリッチメント反応）を調製および濃縮するための試薬が含まれます。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)
20025520
96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。濃縮試薬は含まれていません。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。濃縮試薬は、ライブラリー調製試薬［(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 samples)］でのみ注文が可能です。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)
20025519
16ライブラリー調製用試薬が入っています。濃縮試薬は含まれていません。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。濃縮試薬は、ライブラリー調製試薬［Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 samples)］でのみ注文が可能です。
List Price:
Discounts:
パネル (8)
TruSight Cancer – Enrichment Oligos only (4 or 8 Enrichment Reactions)
FC-121-0202
TruSight Cancerは、さまざまながんの素因に関連する94の遺伝子と284のSNPをターゲットとしており、シングルハイブリダイゼーションワークフローによりNextera Flex for Enrichmentと組み合わせた場合は8回の濃縮反応に十分な量、TruSight Rapid Captureと組み合わせた場合は4回の濃縮反応に十分な量が含まれています。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。
List Price:
Discounts:
TruSight Hereditary Cancer – Enrichment Oligos Only (8 Enrichment Reactions)
20029551
TruSight Hereditary Cancer - Enrichment Oligos Only (8 Enrichment Reactions)
List Price:
Discounts:
TruSight One – Enrichment Oligos only (6 Enrichment Reactions)
20029227
Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentationと組み合わせると、6つのエンリッチメント反応に十分です。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
TruSight One Expanded – Enrichment Oligos only (6 Enrichment Reactions)
20029226
Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentationと組み合わせると、6つのエンリッチメント反応に十分です。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (32 µl, 120 bp)
20073953
Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの2本ストランドカスタムパネル設計を可能にし、32 µl（Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると濃縮反応8回分に十分な量）の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (384 µl, 120 bp)
20073952
Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの2本ストランドカスタムパネル設計を可能にし、384 µl（Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると濃縮反応96回分に十分な量）の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (1536 µl, 120 bp)
20111339
Illumina Custom Enrichment Panel V2 enables 120 bp double-stranded custom panel design from 100 up to 1,000,000 probes using DesignStudio or Concierge Services and provides 1536 µl of material (sufficient for 384 enrichment reactions when paired with Illumina DNA Prep with Enrichment). Library prep, enrichment, and index adapter reagents need to be ordered separately.
Illumina Custom Enrichment Panel (8 Enrichment Reactions)
20025371
イルミナDNA Prep with Enrichmentと組み合わせると、8回の濃縮反応に十分です。DesignStudioを使用して、2K～67Kプローブ間のカスタムパネルデザインを可能にします。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびインデックスアダプターは別売りです。
インデックスアダプター (8)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027213
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027214
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042666
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042667
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
サービス (1)
Illumina DNA Prep with Enrichment Training
20028457
アクセサリー製品 (7)
Illumina Purification Bead, 100mL
20060057
ライブラリーのクリーンアップとサイズ選択用のビーズ100 mL容器が1個含まれています。ライブラリー調製試薬および濃縮試薬、プローブパネル、インデックスは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 400mL
20060058
ライブラリーのクリーンアップとサイズ選択用のビーズ100 mL容器4個が含まれます。ライブラリー調製試薬および濃縮試薬、プローブパネル、インデックスは別売りです。
List Price:
Discounts:
Flex Lysis Reagent Kit (96 reactions)
20018706
Illumina DNA PrepおよびIllumina DNA Prep with Enrichmentで血液サンプルを処理するための試薬が含まれます。ライブラリー調製、濃縮、濃縮プローブパネル、およびインデックスアダプター試薬は別売りです。
List Price:
Discounts:
Infinium FFPE QC Kit (384 reactions)
WG-321-1001
Infinium FFPE QC Kitは、Nextera Flex for Enrichmentを用いたFFPEサンプルの適格性確認に必要な付属製品です。別途、ライブラリー調製、濃縮、および濃縮プローブパネル、およびインデックスアダプターの試薬を注文する必要があります。
List Price:
Discounts:
Infinium MIDI Heatblock Insert
BD-60-601
Nextera Flex for Enrichmentのハイブリダイゼーションステップに必要なSciGene Hybex Microheatingシステム用のヒートブロックインサートです。
List Price:
Discounts:
Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (12 Reactions)
20024144
この試薬をライブラリー調製時に使用することで、インデックスホッピングレベルが低減されます。
List Price:
Discounts:
Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (48 Reactions)
20024145
この試薬をライブラリー調製時に使用することで、インデックスホッピングレベルが低減されます。
List Price:
Discounts:
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よくある質問（FAQ）
Illumina DNA Prep with Enrichmentキットは、10～1000 ngまたは50～1000 ng FFPEの高品質の二本鎖ゲノムDNA（gDNA）インプットに対応しています。ヒトgDNAサンプルおよびその他の大規模複雑なゲノムの場合、推奨される最小gDNAインプットは50 ngです。
このキットでは、ビーズベースのトランスポソーム複合体を使用して、アダプターでゲノムDNAを断片化し、タグ付けした後、PCRステップでDNA断片の端にインデックスアダプターシーケンスを追加します。ライブラリー調製後、ビオチン化オリゴヌクレオチドプローブをハイブリダイズし、Streptavidin Magnetic Beads（SMB）を使用してターゲットライブラリー断片をキャプチャーすることでターゲットを濃縮します。キャプチャーされたインデックス付きライブラリーはビーズから溶出され、シーケンス前に増幅されます。
Flex Lysis Reagent KitおよびBlood Lysis Protocol with Illumina DNA Prep with Enrichmentでの凍結血液または凝固血液の使用は、イルミナではサポートされておらず、テストもされていません。
Illumina DNA Prep with EnrichmentによるBlood Lysisプロトコールは、K2-EDTA採血管（Becton Dickinson社製）での使用に最適化されています。他の採血管も機能する可能性がありますが、検証されていません。
/
件
MiSeq Reagent Kit v3
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを準備するための、高速で統合されたワークフロー。
TruSight Tumor 15
固形腫瘍において、15個の通常変異遺伝子を1つのシンプルで、迅速なワークフローで評価するためのフォーカスされた次世代シーケンサー（NGS）パネル。
AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel
シーケンス固有のターゲットまたは興味のあるゲノムコンテンツにに最適化されたターゲットカスタムリサーチパネル。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
低DNAインプット要件で、小規模ゲノム、PCR アンプリコン、プラスミド、cDNA シーケンス用のDNAライブラリーを調整するための90分のワークフローを提供します。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
包括的で最新のエクソームエンリッチメントパネルを含む、高性能で高速かつ信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスソリューションです。
Illumina DNA PCR-Free Prep
高感度シーケンスアプリケーション用の高精度データが得られる、効率的で高速な統合ライブラリー調製ワークフロー。
NextSeq 1000/2000試薬
NextSeq 1000/2000システムの試薬は、使いやすいカートリッジと複数のフローセル構成を備えており、柔軟なシーケンスオプションが可能です。
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