NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
イルミナDNA Prepは、Nextera DNA Flexとして知られており、ヒト全ゲノムシーケンスからシーケンスアンプリコン、プラスミド、微生物種まで、幅広いDNAインプットタイプと量からノーマライズされたシーケンス対応ライブラリーを調製するための迅速で堅牢かつ柔軟なワークフローを提供します。1
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
約3～4時間（DNA抽出からライブラリーのノーマライズまで）
アッセイ時間
1〜1.5時間
ハンズオンタイム
小さなゲノム（微生物など）の場合はDNA 1～500 ng、大きなゲノム（ヒトなど）の場合はDNA 100～500 ng。（血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください）。
インプット量
Nextera DNA Flex製品は、現在Illumina DNA Prepと呼ばれています。（M）は、約350 bpのインサートサイズを生成するビーズ結合トランスポソームを示します。Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D (20091654、、2009165620091658、20091660）を注文することをお勧めします。IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D (20027213, 20027214, 20042666, 20042667)は製造中止となります。最終注文日は2025年1月30日です。
概要
信頼できる結果を得る
イルミナDNA Prepワークフローは、DNAインプット量やゲノムサイズに関係なく、一貫したインサートサイズ、均一なカバレッジ、最適化された性能を提供します。ビーズベースのテクノロジーにより、バイアスやエラーの可能性が最小限に抑えられ、再現性の高いシーケンスデータが得られます。
柔軟なスループットオプションへのアクセス
イルミナのDNA/RNA UDインデックスセットは、最大384のユニークデュアルインデックスを提供し、リードの正確な割り当てとフローセルの効率的な使用を可能にします。
イルミナアドバンテージ製品の入手可能性
本製品はIllumina Advantage（TG）製品としてもご用意しています。Illumina Advantageの大規模なシーケンス製品は、ロット単位の出荷検査、より長い有効期間、そして事前製品変更通知の提供を特長とし、研究室の効率性を高めます。
イルミナDNA Prep製品ライン
幅広いアプリケーションで使用できる、高速で最適化されたシーケンスライブラリー調製ソリューションを見つけてください。
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
Illumina DNA Prep with Enrichment
幅広いターゲットシーケンスアプリケーションにシーケンス対応DNAライブラリーを提供する高速な統合ワークフロー。
高感度シーケンスアプリケーション用の高精度データを生成する効率的で高速な統合ライブラリー調製ワークフロー。
仕様
| Automation capability | Liquid Handling Robots |
|---|---|
| Method | Shotgun Sequencing, Whole-Genome Sequencing, De Novo Sequencing, Amplicon Sequencing |
| Specialized sample types | Blood, Not FFPE-Compatible, Saliva |
| Variant class | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
| アッセイ時間 | 約3～4時間（DNA抽出からライブラリーのノーマライズまで） |
| インプット量 | 小さなゲノム（微生物など）の場合はDNA 1～500 ng、大きなゲノム（ヒトなど）の場合はDNA 100～500 ng。（血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください）。 |
| サンプルタイプの詳細 |
FFPEサンプルでの使用は検証されていません |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| ターゲットインサートサイズ | 約350 bp |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | 1〜1.5時間 |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアル（UD）の組み合わせと96のコンビナトリアルデュアル（CD）の組み合わせ |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム |
| 核酸の種類 | DNA |
| 生物種 | Drosophila, すべて, Mammalian, マウス, Yeast, Zebrafish, ヒト, ラット, Plant, Virus, Nematode, Bacteria |
| 生物種詳細 | 任意の種に対応 |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る |
| 説明 |
さまざまなサンプルタイプとDNAインプット量に対応する迅速で柔軟なライブラリー調製ワークフローにより、ヒトから微生物の全ゲノムシーケンスまで、幅広いアプリケーションにアクセスできます。 |
必要な製品
各Illumina DNA Prepキットには、シーケンスに使用されるサンプルプーリングレベルに関係なく、プロトコールを完了するためにインデックスキットのいずれかが必要です。可能な限り、独自のデュアルインデックスを使用することをお勧めします。お客様のアプリケーションに適したインデックスオプションの選択の詳細はこちら。
インデックスキットはNextera DNAまたはNextera XTインデックスキットと互換性がありません。
Flex Lysis Kitは、Illumina DNA Prepの血液DNA抽出を補完する別の製品です。
イルミナ精製ビーズはイルミナDNA Prepキットに含まれており、別途購入する必要はありません。
/
アプリケーション
イルミナDNA Prepは、幅広いDNAインプット範囲（1～500 ng）をサポートし、大きな全ゲノムからアンプリコン、プラスミド、微生物種まで、わずか約3.5時間でシーケンスサンプル用の高品質のライブラリーを提供します。
ワークフローの例
主なアプリケーションノート
プロジェクトの推奨事項
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | 1 sample per run (high output; based on 30× coverage of a human genome) |
最大2 × 150 bp |
| NovaSeq 6000 System | 2–10 samples per run (dual flow cell; based on 30× coverage of a human genome) |
最大2 × 125 bp（高速ラン） |
関連するアプリケーションとメソッド
微生物全ゲノムシーケンスを使用して、新規生物のゲノムをマッピングしたり、既知の生物のゲノムを仕上げたり、複数のサンプルでゲノムを比較したりできます。
大規模全ゲノムシーケンスは、疾患研究および集団ゲノム研究に役立ち、疾患関連アリルを明らかにします。
特定の複雑なサンプルに存在するすべての生物のすべての遺伝子を包括的にサンプリングして、細菌の多様性を評価し、培養不可能な微生物を検出します。
ドキュメント
製品資料
サポートドキュメント
- Illumina DNA Prep消耗品および機器リスト Documentation
- イルミナDNA調製チェックリスト Documentation
- Illumina DNA Prepリファレンスガイド Documentation
- Index Adapters Pooling Guide Documentation
- Local Run Manager for MiniSeqにおけるNextera DNA Flex用トリムアダプター Documentation
- Illumina DNA Prepサポート資料 Documentation
- All Illumina DNA Prep Support
- All Illumina DNA RNA UD Indexes Support
比較する
| Illumina DNA Prep | TruSeq DNA PCR-Free | TruSeq DNA Nano | Nextera XT DNA Library Preparation Kit | |
|---|---|---|---|---|
| Variant class | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants |
| アッセイ時間 | 約3～4時間（DNA抽出からライブラリーのノーマライズまで） | 合計アッセイ時間5時間 |
合計アッセイ時間約6時間 |
DNA抽出からライブラリーのノーマライズまで約5.5時間。（ライブラリー調製時間：約90分）。 |
| インプット量 | 小さなゲノム（微生物など）の場合はDNA 1～500 ng、大きなゲノム（ヒトなど）の場合はDNA 100～500 ng。（血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください）。 | DNA 1 ug | 100 ng ゲノムDNA | 1 ng DNA |
| サンプルタイプの詳細 |
FFPEサンプルでの使用は検証されていません |
|||
| ターゲットインサートサイズ | 約350 bp | 350 bpまたは550 bp | 350 bpまたは550 bp | 300 bp～1.5 kb |
| ハンズオンタイム | 1〜1.5時間 | 4時間 | 約4時間 | 15分 |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアル（UD）の組み合わせと96のコンビナトリアルデュアル（CD）の組み合わせ | 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル（CD）、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル（UD）の組み合わせ | 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル（CD）、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル（UD）の組み合わせ | ユニークにインデックスされた最大384サンプルをプールし、一緒にシーケンスできます。 |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム | メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローはPCRフリー、ゲルフリー。 | メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローでは、低バイアスPCRを使用し、ゲルフリーです。 | 酵素による断片化 |
| 生物種詳細 | 任意の種に対応 | ほとんどの大きなDNAゲノムに対応。 | ほとんどの大きなDNAゲノムに対応。 | 任意の種に対応 |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る |
| 説明 |
さまざまなサンプルタイプとDNAインプット量に対応する迅速で柔軟なライブラリー調製ワークフローにより、ヒトから微生物の全ゲノムシーケンスまで、幅広いアプリケーションにアクセスできます。 |
ゲノムの困難な領域を配列解析できる、全ゲノムシーケンスのためのシンプルで包括的なPCR-Free Prep。 | 高いゲノムカバレッジ品質とバイアスの低減を実現するローインプット研究法。 | DNAローインプット要件で、小規模ゲノム、PCRアンプリコンおよびプラスミド用のシーケンス対応ライブラリーを90分で調製します。 |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
図
イルミナビーズ結合トランスポソームケミストリー
(A) ビーズ結合トランスポソームは、gDNAの断片化およびイルミナシーケンスプライマーの付加を同時に媒介します。(B) サイクルを減らしたPCR増幅により、すぐにシーケンスできるDNA断片を増幅し、インデックスとアダプターを付加します。(C) すぐにシーケンスできる断片を洗浄しプーリングします。
イルミナDNA Prepは最速のイルミナワークフローを提供します
DNA抽出からライブラリーノーマライゼーションおよびプーリングまでのワークフロー時間の総比較。イルミナDNA Prepは、ステップ数が最も少なく、合計ワークフロー時間が最速のワークフローを作成します。
カバレッジ均一性の向上
(A) イルミナDNA Prepは、TruSeq DNA Nanoキットと同等のゲノム全体で均一なカバレッジを提供します。（B）GC含有量が極めて高いまたは低い微生物のカバレッジを示します。オンビーズタグメンテーションライブラリー調製化学が改善されたため、Illumina DNA PrepはNextera XTよりも均一なカバレッジを示します。
リソース
DNAライブラリー調製とRNAライブラリー調製の両方に、使いやすく、迅速でシンプルなソリューションを提供するために設計されたイルミナのテクノロジーについて学びます。
オンビーズタグメンテーションライブラリー調製ケミストリーは、DNA抽出、断片化、ライブラリー調製、ライブラリーノーマライゼーションを統合します。
ライブラリー調製 (2)
Illumina DNA Prep, (M) Tagmentation (24 Samples, IPB)
20060060
24ライブラリー調製用の試薬が含まれます。イルミナ精製ビーズが含まれています。エンリッチメントプローブパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina DNA Prep, (M) Tagmentation (96 Samples, IPB)
20060059
96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。イルミナ精製ビーズが含まれています。エンリッチメントプローブパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
インデックスアダプター (9)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027213
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027214
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042666
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042667
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Nextera™ DNA CD Indexes (96 Indexes, 96 Samples)
20018708
20のインデックス、8つのi500および12のi700インデックスを含み、96のサンプルのラベル付けに十分な96のデュアルインデックス機能を提供します。インデックスは96ウェル形式で提供されます。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
サービス (1)
Nextera DNA Flex - Customer Site
20022900
ゲノムDNAの定量と品質管理、ライブラリーの品質と量の確認、Nextera DNA Flexワークフロー全体のトレーニング。
アクセサリー製品 (6)
Illumina Purification Bead, 100mL
20060057
ライブラリーのクリーンアップとサイズ選択用のビーズ100 mL容器が1個含まれています。ライブラリー調製試薬および濃縮試薬、プローブパネル、インデックスは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 400mL
20060058
ライブラリーのクリーンアップとサイズ選択用のビーズ100 mL容器4個が含まれます。ライブラリー調製試薬および濃縮試薬、プローブパネル、インデックスは別売りです。
List Price:
Discounts:
Flex Lysis Reagent Kit (96 reactions)
20018706
Illumina DNA PrepおよびIllumina DNA Prep with Enrichmentで血液サンプルを処理するための試薬が含まれます。ライブラリー調製、濃縮、濃縮プローブパネル、およびインデックスアダプター試薬は別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (12 Reactions)
20024144
この試薬をライブラリー調製時に使用することで、インデックスホッピングレベルが低減されます。
Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (48 Reactions)
20024145
この試薬をライブラリー調製時に使用することで、インデックスホッピングレベルが低減されます。
NextSeq PhiX Control Kit
FC-110-3002
NextSeqイルミナシーケンスプラットフォーム用DNAコントロール。10 µnM PhiXソリューションで最大150 bpのシングルエンドリードおよびペアエンドリードに対応。
List Price:
Discounts:
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よくある質問（FAQ）
はい、イルミナは血液と唾液の両方に対して特定の抽出プロトコールを設計しました。プロトコールはIllumina DNA Prepリファレンスガイドに記載されています。
一般的に、イルミナDNA Prepは、ほとんどの自動液体処理システムと互換性があるように設計されています。
イルミナのオートメーションパートナーはすべて、少なくとも1つの既存の自動化プラットフォームのための手法を開発しています。詳細については、各パートナーにお問い合わせください。
GCが豊富な領域のカバレッジは、使用するサーマルサイクラーのモデル、設定、性能の影響を受ける可能性があります。イルミナは、Bio-Rad DNA Engine Tetrad 2、Bio-Rad S1000、Bio-Rad C1000、およびMJ Research PTC-225 DNA Engine TetradサーマルサイクラーをイルミナDNA Prepで使用することを検証しています。他のサーマルサイクラーでは性能が異なるため、ゲノムカバレッジに影響を与える可能性があります。
はい、イルミナDNA Prepの最小入力範囲（1～500 ng）では、Dryed Blood Spot（DBS）カードから抽出されたDNAを使用できます。乾燥血液スポット抽出のためのイルミナの実証済みプロトコールは、Nextera DNA Flex Dried Blood Spotプロトコールガイド文書にあります。
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MiSeq Reagent Kit v3
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
90分間のワークフローで、DNAインプットの必要性が低く、小さなゲノム、PCRアンプリコン、プラスミド、cDNAシーケンス用のDNAライブラリーを調製できます。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
包括的で最新のエクソームエンリッチメントパネルを含む、高性能で高速かつ信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスソリューションです。
Illumina DNA PCR-Free Prep
高感度シーケンスアプリケーション用の高精度データを生成する効率的で高速な統合ライブラリー調製ワークフロー。
NextSeq 1000/2000 Reagents
NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジと複数のフローセル構成を備えており、柔軟なシーケンスオプションが可能です。
Illumina Complete Long Read with Enrichment, Human
ヒトゲノムのマッピング困難な領域に対処するための、費用効率に優れ、柔軟性のある、ターゲット化したロングリードソリューション。
Illumina UD Indexes
ユニークデュアル（UD）インデックスにより、スループットの向上とコスト削減メリットをもたらすマルチプレックス可能なハイクオリティなライブラリーの調製が可能になります。
参考文献
1. Bruinsma S, Burgess J, Schlingman D, et al. ビーズ結合トランスポソームは、NGSライブラリー調製のためのノーマライゼーションフリーワークフローを可能にします。2018;19:722。BMC Genomics. 2018年10月1日オンライン公開。doi: 10.1186/s12864-018-5096-9
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