NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globinは、血液由来のトータルRNAからのトランスクリプトームの明確かつ包括的観察、高速かつ効率的なシーケンスライブラリー調製が可能になります。
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin
リボソームRNAとグロビンmRNAを1ステップで除去する効率的なワークフローで、血液由来RNAから全トランスクリプトームシーケンスライブラリーを調製します。
11.5時間
アッセイ時間
5.5時間
ハンズオンタイム
0.1～1 ug血液由来高品質精製トータルRNA
インプット量
概要
主な特長
精確なストランド情報による高品質全トランスクリプトーム解析
これらのキットは、ヒト、マウス、またはラットサンプルの全トランスクリプトーム解析のためのRNAシーケンス（RNA-Seq）テクノロジーとRibo-ZeroリボソームRNA削減ケミストリーの利点を結び付けています。
リボソームRNAとグロビンmRNAをワンステップで効率的に除去
血液由来RNAの全トランスクリプトーム解析では、全血に高濃度で存在するリボソームRNA（細胞質とミトコンドリアの両方）とグロビンmRNAの2種類の大量のRNAの除去が必要です。
従来の除去方法では2つの個別のステップが必要です。つまり、追加の試薬が必要なうえワークフローが長くなり、より多くのインプットRNAが失われてしまいます。TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globinは、Ribo-Zeroケミストリーを活用して、簡単なワンステップで大量に存在する両形態のRNAを効率的に除去します。
自動化に適したワークフロー
仕様
| Automation capability | Liquid Handling Robots |
|---|---|
| Method | Whole-Transcriptome Sequencing |
| Specialized sample types | Blood |
| Variant class | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants |
| アッセイ時間 | 11.5時間 |
| インプット量 | 0.1～1 ug血液由来高品質精製トータルRNA |
| コンテンツ仕様 | コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー |
| システム | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | 5.5時間 |
| マルチプレックス | ハイスループットキット：コンビナトリアルデュアルインデックスまたはユニークデュアルインデックスのいずれかを使用して、96個のインデックスサンプルを調製, ロースループットキット：最大12のサンプルをプールします。または、セットAとセットBを併せて最大24のサンプルをプールします。 |
| 作用機序 | ビーズベースのrRNA除去、cDNA合成、PCR |
| 核酸の種類 | RNA |
| 生物種 | マウス, ヒト, ラット |
| 生物種詳細 | rRNAの除去：ヒト、マウス、およびラットのrRNA（細胞質およびミトコンドリア）およびグロビンmRNAを除去 |
| 説明 | 血液由来RNAの全トランスクリプトームシーケンシング研究用。細胞質およびミトコンドリアのrRNAおよびグロビンmRNAを除去します。 |
必要な製品
イルミナは、お客様のワークフローを柔軟にするモジュラー式の注文製品方式を採用しています。以下のインデックスを含んだライブラリー調製製品を注文することができます。
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アプリケーション
ワークフローの例
ライブラリー調製
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin
プロジェクトの推奨事項
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | RNA Profiling: 6-20 samples per run (based on 20 million reads per sample) |
2 x 75 bp |
| NovaSeq 6000 System | RNA Profiling (samples per run, dual flow cell): S1: 160, S2: 320, S4: 768. Limited by index combinations (dual). Based on 20 million reads. |
≤ 2 × 100 bp |
関連するアプリケーションとメソッド
コーディングRNAと複数の形態のノンコーディングRNAの両方を解析し、トランスクリプトームを包括的に把握します。
劣化したFFPE組織やその他の低品質サンプルから高品質の結果を得るFFPE RNAシーケンスソリューションを見つけてください。
RNA-Seqは、次世代シーケンサー（NGS）を使用してトランスクリプトーム全体の発現を解析し、既知または新規の特徴を検出し、RNAを定量化することを可能にします。
ドキュメント
Support documentation
- TruSeq Stranded Total RNAドキュメント Documentation
- TruSeq Stranded Total RNA Dual Index製品インサート Documentation
- TruSeq Stranded Total RNA消耗品および装置 Documentation
- TruSeq Stranded Total RNA Sample Preparation ユーザーが用意する消耗品および機器 Documentation
- TruSeq Stranded Total RNA Sample Prep HS EUCおよびLTF Documentation
- Illumina Experiment Managerユーザーガイド Documentation
- TruSeq Stranded Total RNAリファレンスガイド Documentation
- TruSeq HTデュアルインデックスクイックリファレンスカード Documentation
- TruSeqサンプル調製ベストプラクティスガイド Documentation
- シーケンスライブラリーqPCR定量ガイド Documentation
- TruSeq Stranded Total RNA Sample Prep Guide Documentation
- TruSeq Stranded Total RNA With Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletionリファレンスガイド Documentation
- TruSeq Stranded Total RNA Sample Preparation LS EUCおよびLTF Documentation
- TruSeq Stranded Total RNAチェックリスト Documentation
- All TruSeq Stranded Total RNAサポート Support
- All TruSeq Stranded Total RNAサポート - 文書と文献 Support
比較する
| TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome | |
|---|---|---|
| Automation capability | Liquid Handling Robots | Liquid Handling Robots |
| Method | Whole-Transcriptome Sequencing | Whole-Transcriptome Sequencing, Metatranscriptome Sequencing |
| Specialized sample types | Blood | Microbiome Samples, Low-Input Samples, FFPE Tissue |
| Variant class | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants |
| アッセイ時間 | 11.5時間 | 約7時間 |
| インプット量 | 0.1～1 ug血液由来高品質精製トータルRNA |
標準品質のRNA検体にはトータルRNA 1～1,000 ng、最適パフォーマンスとFFPE検体にはトータルRNA 10 ng以上を推奨 |
| コンテンツ仕様 | コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー | コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー |
| システム | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | 5.5時間 | <3時間 |
| マルチプレックス | ハイスループットキット：コンビナトリアルデュアルインデックスまたはユニークデュアルインデックスのいずれかを使用して、96個のインデックスサンプルを調製, ロースループットキット：最大12のサンプルをプールします。または、セットAとセットBを併せて最大24のサンプルをプールします。 | 最大384のユニークデュアルインデックス |
| 作用機序 | ビーズベースのrRNA除去、cDNA合成、PCR | 酵素によるrRNA除去、ライゲーションベースのアダプターおよびインデックスの追加 |
| 核酸の種類 | RNA | RNA |
| 生物種 | マウス, ヒト, ラット | マウス, ヒト, ラット, Bacteria |
| 生物種詳細 | rRNAの除去：ヒト、マウス、およびラットのrRNA（細胞質およびミトコンドリア）およびグロビンmRNAを除去 |
Ribo-Zero Plusは、ヒト細胞質およびミトコンドリアrRNA・マウスrRNA・ラットrRNA・細菌（大腸菌および枯草菌）rRNA・ヒトβグロビン転写産物を含む複数種から豊富な転写産物を除去します Ribo-Zero Plus Microbiomeは、Ribo-Zero Plusが除去した転写産物だけでなく、多様な微生物種、ATCC MSA-2002、MSA-2005、MSA-2006を含む複数種から豊富な転写産物を除去します |
| 説明 | 血液由来RNAの全トランスクリプトームシーケンシング研究用。細胞質およびミトコンドリアのrRNAおよびグロビンmRNAを除去します。 |
低RNAインプットや低品質サンプルから全トランスクリプトームシーケンシング対応ライブラリーを調製し、幅広いRNA-Seqアプリケーションをサポートします。豊富なトランスクリプトーム解析を容易にするため、複数種からrRNAとグロビンRNAを単一チューブで除去するRibo-Zero Plusが含まれています。 |
図
テクニカルリプリケート
FFPE組織のテクニカルリプリケートは高い一致率を示し、堅牢なライブラリー調製性能を示しています。軸はlog2（FPKM）です。R2 値を示す。
トランスクリプト全体で均一なカバレッジ
TruSeq Stranded Total RNAは、新鮮凍結腫瘍（FF、上段）およびFFPE腫瘍（下段）の両方とマッチングした正常乳房組織において、上から1,000個の発現転写産物に優れたカバレッジを提供し、98%を超える配列ストランドリードが達成されます。X軸：転写産物に沿った位置、Y軸 = 混合リードのカバレッジ率。
ライブラリー調製 (2)
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Globin (48 Samples)
20020612
血液サンプルからrRNAとグロビンmRNAを枯渇させるRiboZeroビーズ、RNAをcDNAに転写するPCRマスターミックス、48サンプル調製用の試薬が含まれます。インデックスアダプターと精製ビーズは別売りです。
List Price:
Discounts:
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Globin (96 Samples)
20020613
血液サンプルからrRNAとグロビンmRNAを枯渇させるRiboZeroビーズ、RNAをcDNAに転写するPCRマスターミックス、48サンプル調製用の試薬が含まれます。インデックスアダプターと精製ビーズは別売りです。
List Price:
Discounts:
インデックスアダプター (5)
TruSeq RNA CD Index Plate (96 Indexes, 96 Samples)
20019792
TruSeq Stranded RNA HT Kit 96 Samples Adapter Plate Box
List Price:
Discounts:
TruSeq RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)
20020492
48の個別RNAサンプルを調製するための24のインデックス（インデックス：2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19）のうち12を含みます。
List Price:
Discounts:
TruSeq RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)
20020493
48の個別RNAサンプルを調製するための24のインデックス（インデックス：1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27）のうち12が含まれます。
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes (24 Indexes, 96 Samples)
20020591
TruSeq Stranded mRNAおよびTruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kitで使用できる新しいユニークデュアルインデックス（UDI）。UDIキットはプレート形式で提供され、96サンプルに対応する24のUDIが4セット含まれています。
IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes (96 Indexes, 96 Samples)
20022371
TruSeq Stranded mRNAおよびTruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kitで使用できる新しいユニークデュアルインデックス（UDI）。UDIキットはプレート形式で提供され、96サンプルに対応する96のUDIが含まれています。
List Price:
Discounts:
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カタログ番号
量
単価
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カタログ番号:数量:
MiSeq Reagent Kit v3
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
NextSeq 500/550 v2.5 Kits
試薬v2.5キットは、開始蛍光強度を維持する弾力性のあるフローセルを使用しており、以前のバージョンと比較して安定性とパフォーマンスが向上しています。
TruSight Hereditary Cancer Panel
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
TruSeq Stranded mRNA
mRNAからシーケンスライブラリーを調製し、ストランド特異的情報でコーディングトランスクリプトームを明確に把握します。
TruSeq Stranded Total RNA
ヒト、マウスおよびホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織を含むさまざまな生物種やサンプルタイプに対応した、堅牢でスケーラブルな全トランスクリプトーム解析（RNA-Seq）ソリューション。
TruSeq RNA Exome
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織やその他の低品質のサンプルからRNAをシーケンスするための再現性と経済性を兼ね備えたソリューションを提供します。わずか10 ngのトータルRNAから得られる精度
Illumina RNA Prep with Enrichment
幅広いサンプルタイプとRNAインプット量から、エンリッチメントおよびインデックス配列ライブラリーを生成するための、高速で統合されたワークフロー。
使用制限ラベルライセンス：
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin Workflow製品とその使用は、Max Planck Gesellschaft氏が所有する米国および外国の1つ以上の発行済みおよび/または保留中の特許出願の対象であり、New England Biolabs, Inc.に独占的にライセンスされ、Illumina, Inc.にサブライセンスされています。Illumina, Inc.、その関連会社、またはその認定再販業者および販売業者から本製品を購入すると、購入者（購入者が学術団体であるか営利団体であるかは問わない）には購入した数量の製品および製品の構成品を使用する譲渡不可の権利が付与されます。本製品の購入は、前述の特許または製品の製造を意図する特許出願のいかなる主張に基づくライセンスも譲渡するものではありません。購入者は、本製品またはその構成品を第三者あるいはその他の者に販売または譲渡したり、以下の商業目的で使用することはできません。（1）製品またはその構成品を製造に使用する、または（2）ヒトまたは動物の治療または予防目的で製品またはその構成品を使用する。
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