NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
イルミナDNA PCR-Free Prepは、ヒト全ゲノムシーケンス（WGS）、微生物ゲノムのde novoアセンブリ、腫瘍/正常バリアントコーリングなどの高感度全ゲノムシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための迅速で柔軟なワークフローを提供します。
Illumina DNA PCR-Free Prep
高感度シーケンスアプリケーション用の高精度データを生成する効率的で高速な統合ライブラリー調製ワークフロー。
約1.5時間
アッセイ時間
約45分
ハンズオンタイム
25 ng 〜 300 ng
インプット量
概要
ラボ運営の簡素化
イルミナのDNA PCR-Free Prepワークフローは、幅広いDNAインプット範囲、複数のサンプルタイプ、および小規模ゲノムと大規模ゲノムの両方をサポートします。ワークフローには、血液、唾液、または乾燥血液スポットからのDNA抽出も含まれます。
信頼できる結果を得る
PCRフリーのライブラリー調製と組み合わせたオンビーズタグメンテーションケミストリーは、PCRによるバイアスを排除し、エラーの可能性を減らし、高GCまたは-AT領域にわたって優れた均一なカバレッジを提供します。オンビーズタグメンテーションの詳細はこちら。
柔軟なスループットへのアクセス
イルミナDNA/RNA UDインデックスセットは、最大384のユニークデュアルインデックスを提供し、リードの正確な割り当てとフローセルの効率的な使用を可能にします。
イルミナDNA Prep製品ライン
幅広いアプリケーションで使用できる、高速で最適化されたシーケンスライブラリー調製ソリューションを見つけてください。
高感度シーケンスアプリケーション用の高精度データを生成する効率的で高速な統合ライブラリー調製ワークフロー。
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
Illumina DNA Prep with Enrichment
幅広いターゲットシーケンスアプリケーションにシーケンス対応DNAライブラリーを提供する高速な統合ワークフロー。
仕様
| Automation capability | Liquid Handling Robots |
|---|---|
| Method | Whole-Genome Sequencing, De Novo Sequencing |
| Specialized sample types | Blood, Not FFPE-Compatible, Low-Input Samples, Saliva |
| Variant class | Short tandem repeats (STRs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
| アッセイ時間 | 約1.5時間 |
| インプット量 | 25 ng 〜 300 ng |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| ターゲットインサートサイズ | 450 bp +/- 75 bp |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | 約45分 |
| マルチプレックス | 最大384プレックス |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム |
| 核酸の種類 | DNA |
| 生物種 | すべて, ヒト |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る |
| 説明 |
PCRフリーケミストリーとオンビーズタグメンテーションのユニークな組み合わせを使用して、高感度アプリケーション用のシーケンスライブラリーを調製します。これにより、PCRによるバイアスを排除すると同時に、ライブラリー調製の合計時間が90分に短縮されます。 |
| Automation capability | Liquid Handling Robots |
|---|---|
| Method | Whole-Genome Sequencing, De Novo Sequencing |
| Specialized sample types | Blood, Not FFPE-Compatible, Low-Input Samples, Saliva |
| Variant class | Short tandem repeats (STRs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| 核酸の種類 | DNA |
| 生物種 | すべて, ヒト |
必要な製品
NovaSeq 6000システムを除くすべての装置について、Illumina DNA PCR-Free Sequencing and Indexing Primer（カタログ番号：20041797）を購入してください。
インデックスアダプターはオプションですが、マルチプレックスに推奨されます。サンプルのスループットに合わせて必要なインデックス数を選択してください。 イルミナDNA/RNA UD Indexes Sets A-D (20091654、20091656、20091658、20091660）を注文することをお勧めします。IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D (20027213, 20027214, 20042666, 20042667)は中止されています。
Illumina Lysis Kitは、血液サンプルの処理にのみ必要です。
/
アプリケーション
Illumina DNA PCR-Free Prepは、腫瘍/正常バリアントの同定やヒト全ゲノムシーケンス（WGS）などの高感度アプリケーションに、PCRフリーのシーケンス対応ライブラリーを約1.5時間で提供します。
ワークフローの例
ライブラリー調製
Illumina DNA PCR-Free Prep
プロジェクトの推奨事項
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NovaSeq 6000 System | S1: 3 (based on 607M reads, 40× coverage, or > 160 Gb of total data passing filter) S2: 6 (based on 663M reads, 40× coverage, or > 160 Gb of total data passing filter) S4: 16 (based on 669M reads, 40× coverage, or > 160 Gb of total data passing filter) |
2 × 150 bp |
関連するアプリケーションとメソッド
ヒト全ゲノムシーケンスは、私たちをユニークな存在にしている複雑な遺伝性バリアントを、最も詳しく知ることができるものです。
ハイスループットとロースループットの両方のウォークアウェイ自動化手法は、当社の自動化パートナーを通じて利用でき、ハンズオンタイムを短縮し、エラーを最小限に抑えます。
腫瘍と正常サンプルを比較して、がんドライバー変異として機能する体細胞バリアントを発見する腫瘍と正常サンプルを比較した研究があります。
ドキュメント
製品資料
比較する
| Illumina DNA PCR-Free Prep | Illumina DNA Prep | TruSeq DNA PCR-Free | TruSeq DNA Nano | |
|---|---|---|---|---|
| Automation capability | Liquid Handling Robots | Liquid Handling Robots | Liquid Handling Robots | |
| Method | Whole-Genome Sequencing, De Novo Sequencing | Shotgun Sequencing, Whole-Genome Sequencing, De Novo Sequencing, Amplicon Sequencing | Shotgun Sequencing | Shotgun Sequencing, Whole-Genome Sequencing, Genotyping by Sequencing |
| Specialized sample types | Blood, Not FFPE-Compatible, Low-Input Samples, Saliva | Blood, Not FFPE-Compatible, Saliva | Not FFPE-Compatible, Low-Input Samples | |
| Variant class | Short tandem repeats (STRs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
| アッセイ時間 | 約1.5時間 | 約3～4時間（DNA抽出からライブラリーのノーマライズまで） | 合計アッセイ時間5時間 |
合計アッセイ時間約6時間 |
| インプット量 | 25 ng 〜 300 ng | 小さなゲノム（微生物など）の場合はDNA 1～500 ng、大きなゲノム（ヒトなど）の場合はDNA 100～500 ng。（血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください）。 | DNA 1 ug | 100 ng ゲノムDNA |
| ターゲットインサートサイズ | 450 bp +/- 75 bp | 約350 bp | 350 bpまたは550 bp | 350 bpまたは550 bp |
| ハンズオンタイム | 約45分 | 1〜1.5時間 | 4時間 | 約4時間 |
| マルチプレックス | 最大384プレックス | 最大384のユニークデュアル（UD）の組み合わせと96のコンビナトリアルデュアル（CD）の組み合わせ | 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル（CD）、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル（UD）の組み合わせ | 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル（CD）、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル（UD）の組み合わせ |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム | ビーズ結合トランスポソーム | メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローはPCRフリー、ゲルフリー。 | メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローでは、低バイアスPCRを使用し、ゲルフリーです。 |
| 核酸の種類 | DNA | DNA | DNA | |
| 生物種 | すべて, ヒト | Drosophila, すべて, Mammalian, マウス, Yeast, Zebrafish, ヒト, ラット, Plant, Virus, Nematode, Bacteria | Other, Mammalian, マウス, ヒト, ラット, Plant | Other, Mammalian, マウス, ヒト, ラット, Plant |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る |
| 説明 |
PCRフリーケミストリーとオンビーズタグメンテーションのユニークな組み合わせを使用して、高感度アプリケーション用のシーケンスライブラリーを調製します。これにより、PCRによるバイアスを排除すると同時に、ライブラリー調製の合計時間が90分に短縮されます。 |
さまざまなサンプルタイプとDNAインプット量に対応する迅速で柔軟なライブラリー調製ワークフローにより、ヒトから微生物の全ゲノムシーケンスまで、幅広いアプリケーションにアクセスできます。 |
ゲノムの困難な領域を配列解析できる、全ゲノムシーケンスのためのシンプルで包括的なPCR-Free Prep。 | 高いゲノムカバレッジ品質とバイアスの低減を実現するローインプット研究法。 |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
図
Illumina DNA PCR-Free Prepケミストリー
1回の迅速な反応で、オンビーズタグメンテーションとPCRフリーワークフローのユニークな組み合わせ。
GCリッチ領域にわたるリードカバレッジの比較
Illumina DNA PCR-Free Prepキットは、TruSeq DNA PCR-FreeおよびTruSeq DNA Nano Library Prepキットと比較して、ヒトRNPEPL1遺伝子のGCリッチプロモーター領域全体で優れたリードカバレッジを提供します。
イルミナDNA PCRフリープレップカバレッジの均一性
イルミナDNA PCR-Free Prepは、ヒトゲノムのさまざまなGC含量にわたって均一なカバレッジを提供します。
幅広いDNAインプットにわたるイルミナDNA PCRフリー調製性能
さまざまなDNAインプットから調製されたイルミナDNA PCR-Free Prepライブラリーは、（A）すべてのDNAインプットの品質仕様に合格し、（B）同等のコール性性能を示しています。
リソース
Illumina DNA PCR-Free Prep, Tagmentation: Introduction
このウェビナーでは、ライブラリー調製ワークフローとシーケンスに関する考慮事項について説明し、次世代シーケンスプロジェクトを成功させるためのヒントを提供します。
ライブラリー調製 (2)
Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (24 Samples)
20041794
24ライブラリー調製用の試薬とイルミナ精製ビーズが含まれます。インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (96 Samples)
20041795
96ライブラリー調製用の試薬とイルミナ精製ビーズが含まれます。インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
インデックスアダプター (8)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027213
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042666
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042667
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027214
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
サービス (1)
Illumina DNA PCR-Free Prep Training
20046010
アクセサリー製品 (2)
Illumina® DNA PCR-Free Sequencing and Indexing Primer
20041797
iSeq VP10、MiniSeq、NextSeq 500/550、NextSeq 1000/2000、およびHiSeq 3000/4000システムで使用するための、VP10カスタムリード1プライマーの7.5 mLチューブ2本と、VP14カスタムインデックス2プライマーの7.5 mLチューブ2本が含まれます。
List Price:
Discounts:
Illumina® Lysis Kit
20042221
Illumina DNA PCR-Free Prepで血液サンプルを処理するための溶解キットが1つ含まれています。ライブラリー調製アダプターとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
表示されている結果 : /
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単価
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カタログ番号:数量:
よくある質問（FAQ）
PCRフリーのライブラリー調製は、PCR増幅を使用せずにDNAライブラリーを構築するものです。イルミナのDNA PCRフリーケミストリーは、PCRによるバイアスを排除し、高感度アプリケーションのための高精度なシーケンス情報を提供します。
PCRフリーのライブラリー調製では、ビーズ結合トランスポソーム複合体を使用して、アダプタータグシーケンスを断片化し、1回の迅速な反応ステップで追加することでゲノムDNAにタグを付けます。単一反応ステップはオンビーズタグメンテーションと呼ばれます。ビーズ結合トランスポソームがDNAで飽和した後、追加のタグメンテーションは発生せず、一貫したライブラリー収量とインサートサイズが得られます。 オンビーズタグメンテーションの詳細はこちら
PCRフリーシーケンスは、PCR増幅ステップを排除し、一般的なPCRによるバイアスや不均一な増幅を大幅に低減します。
Illumina DNA PCR-Free Prepワークフローは、オンビーズタグメンテーションを使用しており、1回の迅速な反応で、DNAインプット量やゲノムサイズに関係なく、一貫したインサートサイズ、均一なカバレッジ、性能の向上を実現します。オンビーズタグメンテーションはPCR増幅ステップの必要性をなくし、偏った塩基組成とエラーの可能性を最小限に抑え、このキットは高感度シーケンスアプリケーションに最適です。
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MiSeq Reagent Kit v3
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
包括的で最新のエクソームエンリッチメントパネルを含む、高性能で高速かつ信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスソリューションです。
NextSeq 1000/2000 Reagents
NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジと複数のフローセル構成を備えており、柔軟なシーケンスオプションが可能です。
Illumina Complete Long Read with Enrichment, Human
ヒトゲノムのマッピング困難な領域に対処するための、費用効率に優れ、柔軟性のある、ターゲット化したロングリードソリューション。
NovaSeq 6000試薬キット
すぐに使用できる充填された試薬カートリッジとフローセルからなるNovaSeq 6000システム用試薬キットです。
TruSight Oncology 500 High Throughput
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSI）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現し、スケーラビリティを強化します。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2
主要な免疫腫瘍学遺伝子シグネチャ（TMB、MSI）に加えて、血漿中のctDNAからすべての主要なバリアントクラスを検出できる腫瘍横断型パネルでCGPを可能にします。
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