TruSeq Custom Amplicon Low Input Kit

このライブラリー調製キットでは、少量のDNAサンプルやホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織のDNAサンプルでも高感度で特異性の高いアンプリコンシーケンス結果が得られますRead More...
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Product Highlights

TruSeq Custom Amplicon Low Input ライブラリー調製キットは、少量インプットおよびホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織のDNAサンプルでも高精度で詳細な結果が得られる拡張性のあるアンプリコンシーケンスソリューションです。この製品は以下を特長としています:

  • わずか10 ngのゲノムDNA(gDNA)インプット量や難しいFFPEサンプルから精確に変異を検出
  • 簡潔なデータ解析を含む、フルサポート型の最適化されたワークフローソリューション
  • ライブラリー調製をわずか3時間のハンズオン時間を含む6時間で完了できる、自動化しやすいワークフロー
少量のDNAインプットとFFPEサンプルに対応

TruSeq Custom Amplicon Low Input Library Prep Kitは、わずか10 ngのゲノムDNA(gDNA)からスタートでき、ターゲットリシーケンス用の完全なカスタマイズが可能なアンプリコンベースのアッセイです。この拡張性あるアッセイにより、1回の反応で、対象となる複数のターゲットを同時にキャプチャーして、1つのプールで最大1536のアンプリコンをシーケンスすることが可能です。このライブラリー調製キットには、保存腫瘍組織などのFFPEサンプルに対応できる柔軟性があります。

確かなアッセイデザイン

カバレッジを最適化できる操作が簡単な無料オンラインツールDesignStudioを使ってターゲットTruSeq Custom Ampliconオリゴヌクレオチドプローブをデザインできます。

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FFPEサンプルのクオリティをシーケンス前に評価

TruSeq FFPE DNAライブラリー調製QCキットは、qPCR反応を使ってDNA品質を評価し、シーケンスパラメーターに関する情報を提供します。このステップでは、確実に必要なシーケンスパラメーターを満たすサンプルのみが調製されるため、クオリティの低いサンプルや分解が進んだサンプルを使用することによるリソースの無駄を抑えることができます。このQCステップで得られた結果を基に、インプットDNAが確定します。TruSeq FFPE DNAライブラリー調製QCキットをTruSeq Custom Amplicon Low Input Library Prep Kitと併用することで、ラボの予算を最大限に有効利用することができます。

FFPEアンプリコンの場合、FFPEサンプルのDNAは分解が進んでいるため、150 bpまたは175 bpのアンプリコンでプロジェクトをデザインすることをご提案します。TruSeq Custom Amplicon Low Inputは、425 bpアンプリコンが必要なアプリケーションでは使用できません。

生物種互換性

TruSeq Custom Amplicon Low Inputライブラリー調製は、ヒト、マウス、ラット、およびウシのサンプルに対応しています。DesignStudioのデザインアルゴリズムは、トウモロコシ、イネ、ブタ、イヌ、ダイズ、ニワトリ、およびヒツジでも使用できますが、その場合のアッセイについては検証されていないため、アッセイ性能は保証されません。また、イルミナコンシェルジュサービスではカスタムアッセイのデザインや目的の生物種に合わせたアッセイ最適化のサポートをご提供しています。

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仕様

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Supporting Data and Figures

 
Comparison of TruSeq Custom Amplicon Kits
Technology TruSeq Custom Amplicon Low Input TruSeq Custom Amplicon v1.5
Amplicon plexity (single pool) Up to 1536 Up to 10,000 (via Concierge)
Input requirement as low as 10 ng 50 ng
FFPE Compatibility Yes – 10 ng (FFPE DNA input dependent on quality) Yes – 250 ng
Amplicon size 150, 175, 250 bp 150, 175, 250, 425 bp
Instrument MiniSeq, MiSeq, NextSeq MiniSeq, MiSeq, NextSeq
Read Length Up to 2 x 150 bp Up to 2 x 300 bp
Time 6.5 hours 10 hours
Kit size (samples) 16, 96+ 96+

Two amplicon-based options for targeted sequencing are now available: TruSeq Custom Amplicon Low Input for low-input DNA and FFPE, or TruSeq Custom Amplicon 1.5 for very high plexity pools or longer amplicons.

TruSeq Custom Amplicon Low Input enables you to detect and discover high-quality information, even from limited and challenging samples. Use the table to compare assays

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