複数の固形がん種に対応し、FFPE組織から83種類のRNA融合遺伝子を解析するターゲットパネルです。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panelは、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）検体から分離されたRNAを用いて、複数の固形がん種に関連する18種類のドライバー遺伝子および83種類の融合パートナー遺伝子を解析するよう設計された、ロバストなNGSアッセイです。
このフォーカスパネルは、FFPE組織から分離されたRNA中の遺伝子再構成を検出することができます。
このアッセイは、効率的に1本のチューブでターゲット濃縮を行うタイル状アンプリコンに基づくライブラリー調製手法である独自のStem Loop Inhibition-Mediated Amplification（SLIMamp）テクノロジーを採用しています。
このワークフローは、社内のNGSラボで実施可能な単一チューブのタイル方式の増幅であるため、サンプルと結果をラボで管理できます。
| アッセイ時間 | 48時間-サンプルからレポートまで |
|---|---|
| がんの種類 | 汎がん (Pan-cancer), 固形腫瘍 |
| コンテンツ仕様 | 18個のドライバー遺伝子と83種類の融合パートナー |
| 説明 | FFPE組織から18個のドライバー遺伝子と83種類の融合パートナーを解析するRNA融合パネル |
| ハンズオンタイム | 約3時間 |
| インプット量 | 10～50 ng RNA |
| システム | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, MiSeq i100システム |
| 手法 | アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス |
| 核酸の種類 | RNA |
| アンプリコン数 | プール1：83アンプリコン |
| 反応数 | 24反応／キット |
| 対応サンプルタイプ | FFPE組織 |
| 生物種カテゴリー | ヒト |
| ストランド特異性 | ストランド情報なし |
| ターゲットインサートサイズ | 120 bp |
| テクノロジー | シーケンス |
| バリアントクラス | 融合遺伝子 |
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panelでは、Pillar Index Kit、シーケンス試薬のほか、DRAGEN AmpliconまたはPiVAT二次解析ソフトウェアも使用する必要があります。追加のバリアント解釈が必要な場合は、Illumina Connected Insightsをご使用ください。
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panelは、FFPE検体から抽出したRNAを用いて複数の固形がん種を解析し、約3時間のハンズオンタイムで9時間以内に処理を完了します。
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel
研究者は、リキッドバイオプシーNGSアッセイを使用して、がん患者の血液中に存在する腫瘍由来のバイオマーカーを検出し、特徴づけることができます。
イルミナのシーケンステクノロジーとマイクロアレイテクノロジーは、DNAからRNA解析、エピジェネティクスなど、がんゲノム研究の応用分野を幅広くサポートしています。
RNAシーケンス（RNA-Seq）により、がんの遺伝子発現とトランスクリプトームの変化を検出し、新しいがん遺伝子転写物を同定します。
| Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel | Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel | Pillar oncoReveal Multi-Cancer CNV + RNA Fusion Panel | TruSight RNA Pan-Cancer Panel | |
|---|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | 48時間-サンプルからレポートまで | 48時間-サンプルからレポートまで | 48時間-サンプルからレポートまで | 2.5日 |
| がんの種類 | 汎がん (Pan-cancer), 固形腫瘍 | 汎がん (Pan-cancer), 固形腫瘍 | 汎がん (Pan-cancer), 固形腫瘍 | 汎がん (Pan-cancer), 血液学, 固形腫瘍 |
| コンテンツ仕様 | 18個のドライバー遺伝子と83種類の融合パートナー | 48遺伝子 | 78遺伝子小型汎腫瘍用腫瘍学パネル | 1,385のターゲット遺伝子と21,043の標的エクソン領域を有する腫瘍横断型パネルです。がん遺伝子融合に関与する507の遺伝子を含みます。 |
| 説明 | FFPE組織から18個のドライバー遺伝子と83種類の融合パートナーを解析するRNA融合パネル | Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panelは、複数の固形腫瘍がん種を対象に48種類の遺伝子を解析する堅牢なDNA NGSアッセイです。 | DNAおよびRNAのコンテンツ、シンプルなシングルチューブワークフローを備えた78遺伝子アンプリコンベースのパネル | 複数のがんタイプにおける遺伝子融合、バリアント、遺伝子発現の変化に関する研究を可能にするがん関連RNA転写産物の包括的な評価。 |
| ハンズオンタイム | 約3時間 | 約3時間 | 約3時間 | 11時間 |
| インプット量 | 10～50 ng RNA | 20～80 ng DNA | 5～80 ng DNA、10～50 ng RNA | 10 ngトータルRNA、20～100 ng FFPE RNA |
| システム | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, MiSeq i100システム | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, MiSeq i100システム | MiSeq System, NextSeq 550 System, MiSeqDx in Research Mode, NextSeq 550Dx in Research Mode, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム | MiSeq System, NextSeq 550 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 System, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム |
| 手法 | アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス | ターゲットDNAシーケンス, アンプリコンシーケンス | ターゲットDNAシーケンス, アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス | ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮, カスタムシーケンス |
| 核酸の種類 | RNA | DNA | DNA, RNA | RNA |
| アンプリコン数 | プール1：83アンプリコン | プール1：246アンプリコン | プール1（DNA）：341アンプリコン。プール2（RNA）：>80アンプリコン＋METエクソン14スキッピング | |
| 反応数 | 24反応／キット | 24反応／キット | 24 DNA/24 RNA | |
| 対応サンプルタイプ | FFPE組織 | FFPE組織 | 血液, 少量インプットサンプル, FFPE組織 | 少量インプットサンプル, FFPE組織 |
| 生物種カテゴリー | ヒト | ヒト | ヒト | ヒト |
| ストランド特異性 | ストランド情報なし | |||
| ターゲットインサートサイズ | 120 bp | 154 bp | 平均：120 bp（範囲：86～185 bp） | |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス | シーケンス |
| バリアントクラス | 融合遺伝子 | 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel） | 融合遺伝子, 体細胞バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） | 融合遺伝子, 体細胞バリアント, 新規点転写産物, 転写産物バリアント |
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
遺伝子リスト
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panelには、18種類のドライバー遺伝子と83種類のパートナー遺伝子が含まれています。
パネル仕様
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 PanelのFFPE組織から分離された融合転写産物（RNA）の解析に関する仕様。
oncoReveal™ MultiCancer RNA Fusion v2 Pnl 24rxn
HRA-HS-1002-24
SLIMamp™ワークフローを使用した18遺伝子（24サンプル）の固形腫瘍RNAパネル
List Price:
Discounts:
Pillar Index Kit A (32 reactions)
IDX-PI-1001-96
インデックスPI501-8、PI701-4（32の組み合わせ、96反応）
List Price:
Discounts:
Pillar Index Kit D (96 reactions)
IDX-PI-1004-192
キットD、インデックスPI501-8、PI701-12
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操作の簡素化、高度なケミストリー、オンボードインフォマティクスにより、使いやすく、高速で、幅広いアプリケーションをサポートする柔軟性の高い装置を提供します。
MiSeq i100シリーズ用試薬は、使いやすいカートリッジと、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフロー セル構成を備えています。
Illumina Connected Analyticsでインフォマティクスを活用して科学的洞察を促進しましょう。価格、サブスクリプションなどについては、弊社までお問い合わせください。
MPL、JAK2、CALR遺伝子の主要な変異をターゲットにしたロバストなアッセイです。シングルチューブのSLIMampワークフローを使用してライブラリー調製にかかる時間とターンアラウンドタイムを短縮します。
シングルチューブのSLIMampワークフローを利用したターゲットBRCA1/2遺伝子パネルにより、ライブラリー調製とターンアラウンドタイムが短縮されます。
DNAとRNAのコンテンツを組み合わせた腫瘍横断型パネルで、シングルチューブのSLIMampワークフローを利用し、ライブラリー調製とターンアラウンドタイムを高速化します。
DNAコンテンツを組み合わせた58遺伝子の腫瘍横断型パネルです。シングルチューブSLIMampワークフローを使用して、ライブラリー調製とターンアラウンドタイムを高速化します。
ロバストなDNA NGSアッセイ。複数の固形腫瘍がん種にわたって48種類もの遺伝子を解析します。
FFPE組織から、すべての主要バリアントクラスに加え、重要なバイオマーカー（TMB、MSI、HRD）を網羅する大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現します。
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